[发明专利]一种结核分枝杆菌DNA的提取方法有效
申请号: | 201910387978.0 | 申请日: | 2019-05-10 |
公开(公告)号: | CN110172497B | 公开(公告)日: | 2023-06-23 |
发明(设计)人: | 雷湘华;郭永超;陈莹莹;黄歆;黄萍 | 申请(专利权)人: | 深圳联合医学科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806;C12N15/10;C12R1/32 |
代理公司: | 深圳中一联合知识产权代理有限公司 44414 | 代理人: | 曹柳 |
地址: | 518000 广东省深圳市*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 结核 分枝杆菌 dna 提取 方法 | ||
1.一种结核分枝杆菌DNA的提取方法,其特征在于,所述提取方法包括以下步骤:
获取结核分枝杆菌,对所述结核分枝杆菌进行灭活处理,得到已灭活的结核分枝杆菌;
对所述已灭活的结核分枝杆菌,先进行涡旋振荡分散处理,然后进行超声分散处理,得到结核分枝杆菌分散液;
对所述结核分枝杆菌分散液进行破壁处理,得到破壁产物;
对所述破壁产物,先采用CTAB/NaCl溶液进行第一次抽提,然后采用酚、氯仿和异戊醇的混合液进行第二次抽提,得到抽提产物;其中,进行所述第一次抽提的步骤包括:获取十二烷基硫酸钠溶液和蛋白酶K溶液,将所述十二烷基硫酸钠溶液和所述蛋白酶K溶液添加到所述破壁产物中,轻柔混匀后,添加NaCl溶液和预热后的所述CTAB/NaCl溶液,再次轻柔混合均匀后,在60℃~70℃水浴条件下处理8~15分钟,得到第一次抽提产物;进行所述第二次抽提的步骤包括:获取与所述第一次抽提产物等体积的所述酚、氯仿和异戊醇混合液添加到所述第一次抽提产物中,混合均匀后,离心处理得到的上清液即为所述抽提产物;其中,所述十二烷基硫酸钠溶液中十二烷基硫酸钠的含量为10%,所述十二烷基硫酸钠溶液的添加量为所述破壁产物体积的14%~15%;所述蛋白酶K溶液的浓度为20mg/ml,添加量为所述破壁产物体积的2%~3%;所述CTAB/NaCl溶液为10%CTAB/0.7mol/LNacl,添加量为所述破壁产物体积的18%~19%;所述酚、氯仿和异戊醇的混合液中酚:氯仿:异戊醇的体积比为25:24:1;
采用异丙醇和糖原对所述抽提产物进行沉淀处理,得到结核分枝杆菌DNA;其中,所述沉淀处理的步骤包括:获取异丙醇和糖原溶液,将所述异丙醇添加到所述抽提产物中,混合均匀后,添加所述糖原溶液,再次混合均匀后,于低于-20℃条件下,低温处理2~3小时,得到低温处理产物;将所述低温处理产物离心处理后,得到的沉淀物采用乙醇离心洗涤处理2~3次,得到的白色沉淀即为所述结核分枝杆菌DNA;其中,所述异丙醇的添加量为所述抽提产物体积的55%~65%;所述糖原溶液的浓度为20mg/ml,添加量为所述抽提产物体积的0.6%~0.7%;所述结核分枝杆菌DNA在使用时,挥发去除其中的乙醇溶剂后,采用缓冲溶液溶解所述结核分枝杆菌DNA。
2.如权利要求1所述的结核分枝杆菌DNA的提取方法,其特征在于,所述灭活处理的步骤包括:将所述结核分枝杆菌置于TE缓冲液中,在75~85℃的条件下,处理30~60分钟;和/或,
所述涡旋振荡分散处理的步骤包括:将所述已灭活的结核分枝杆菌置于缓冲溶液中,在添加有玻璃珠的情况下,涡旋振荡分散2~5分钟,得到涡旋振荡分散产物。
3.如权利要求2所述的结核分枝杆菌DNA的提取方法,其特征在于,所述超声分散处理的步骤包括:对所述涡旋振荡分散产物进行间歇式超声处理2分钟~3分钟,得到所述结核分枝杆菌分散液;其中,所述间歇式超声处理的超声处理时长为2~10秒,暂停时长2~10秒。
4.如权利要求1~3任意一项所述的结核分枝杆菌DNA的提取方法,其特征在于,所述破壁处理的步骤包括:获取溶菌酶,将所述溶菌酶添加到所述结核分枝杆菌分散液中,混合均匀后,在35℃~38℃的条件下水浴消化2小时~24小时,得到所述破壁产物。
5.如权利要求4所述的结核分枝杆菌DNA的提取方法,其特征在于,所述溶菌酶的浓度为50~60mg/ml,添加量为所述结核分枝杆菌分散液体积的3.5%~4.5%;和/或,
所述水浴消化处理的步骤包括:每隔20~30分钟进行一次颠倒混合处理。
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