[发明专利]一种检测茶卡羊BAG4基因CNV标记的方法及其应用

权利要求书

1.一种检测与茶卡羊生长性状相关的BAG4基因CNV标记的方法，其特征在于：包括以下步骤：

利用实时荧光定量PCR，以待测茶卡羊基因组DNA为模板，分别扩增BAG4基因拷贝数变异区域，以及作为内参序列的ANKRD1基因的部分片段，然后根据定量结果鉴定茶卡羊BAG4基因的拷贝数变异类型；所述的BAG4基因拷贝数变异区域位于BAG4基因参考基因组序列NC_019483.2的31982401至31984000 bp；

所述的拷贝数变异类型是根据2*2^-ΔCt将定量结果分为的三类：插入型，2*2^-ΔCt 2.5；缺失型，2*2^-ΔCt 1.5；正常型，1.5≤2*2^-ΔCt≤2.5；

所述的BAG4基因拷贝数变异区域的扩增引物对为：

上游引物F1：5’- TGGATGAAGACACAAAGACCA -3’

下游引物R1：5’- TCAAAGGAAACCCCATACCCT-3’ ；

所述的ANKRD1基因的部分片段的扩增引物对为：

上游引物F2：5’- TGGGCACCACGAAATTCTCA -3’

下游引物R2：5’-TGGCAGAAATGTGCGAACG -3’ ；

具有缺失型拷贝数变异类型的个体在生长性状上优于具有正常型和插入型拷贝数变异类型的个体。

2.如权利要求1所述的方法，其特征在于：所述的实时荧光定量PCR的反应程序为：95℃预变性10 min；95 ℃变性15 s，60 ℃退火1min，共40个循环。

3.一种如权利要求1-2中任意一项权利要求所述的方法在茶卡羊分子标记辅助选择育种中的应用。