[发明专利]一种高效提取结核杆菌DNA的方法在审
申请号: | 201910283923.5 | 申请日: | 2019-04-10 |
公开(公告)号: | CN110016473A | 公开(公告)日: | 2019-07-16 |
发明(设计)人: | 刘盛元;王健;韩桂圆;马剑平;张敏;郭旭君;吕纯芳;卢留珠;吴健虹 | 申请(专利权)人: | 深圳市南山区慢性病防治院 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 深圳市添源知识产权代理事务所(普通合伙) 44451 | 代理人: | 黎健任 |
地址: | 518000 广东省深圳*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 结核杆菌DNA 高效提取 制备技术领域 细菌DNA提取 液体培养物 生物安全 大样本 规模化 硅胶膜 离心柱 开盖 灭活 节约 应用 | ||
1.一种高效提取结核杆菌DNA的方法,其特征在于,包括,使用液体培养物进行结核杆菌培养,报阳之后灭活,然后再开盖,之后采用CTAB方法和硅胶膜离心柱相结合的方法进行细菌DNA分离。
2.根据权利要求1所述的一种高效提取结核杆菌DNA的方法,其特征在于,使用液体培养物进行结核杆菌培养步骤包括:使用美国BD公司BACTEC MGIT 960分枝杆菌培养监测仪,待系统报阳后取出MGIT管作为后续提取DNA的样本。
3.根据权利要求1或2所述的一种高效提取结核杆菌DNA的方法,其特征在于,报阳之后在水浴90-100℃下灭活30分钟以上。
4.根据权利要求2所述的一种高效提取结核杆菌DNA的方法,其特征在于,采用CTAB法和硅胶膜离心柱相结合的方法进行细菌DNA分离包括以下步骤:
收集灭活后的菌体,离心,弃上清,菌体沉淀用TE重悬,加入溶菌酶,混匀,37℃孵育16-20小时;
加入SDS和5μL蛋白酶K溶液,混匀,孵育;
加入NaCl和预热的CTAB/NaCl溶液,旋涡震荡混匀之呈现乳白色,孵育;
加入氯仿/异戊醇(24:1),颠倒混匀;离心;转移上层水相;
加入异丙醇和醋酸钠,混匀;
吸取混匀的液体转入吸附柱中,离心,弃掉废液;
向吸附柱中加入缓冲液GD,离心,弃掉废液;
向吸附柱中加入漂洗液PW,离心,弃掉废液;
将吸附柱置于室温放置数分钟,以彻底晾干吸附材料中残余的漂洗液;
将吸附柱滴加洗脱缓冲液TE,室温放置2-5min,离心,收集溶液。
5.根据权利要求4所述的一种高效提取结核杆菌DNA的方法,其特征在于,优选吸附柱CB3、缓冲液GD及漂洗液PW均为天根生物科技有限公司产品,货号分别为RK127,RK118和RK113。
6.根据权利要求4或5所述的一种高效提取结核杆菌DNA的方法,其特征在于,包括:
(1).13000rcf离心3min,弃上清,菌体沉淀用400μL TE重悬,加入50μL溶菌酶(10mg/ml),混匀,37℃孵育16-20小时;
(2).65℃预热CTAB/Nacl(室温放置会呈凝胶状,用前先在65℃预热,反复加热会影响其效果);
(3).加入70μL 10%SDS和5μL蛋白酶K(20mg/ml)溶液,混匀,65℃孵育10min;(轻轻混匀);
(4).加入100μL 5M NaCl和100μL预热的CTAB/NaCl溶液,旋涡震荡混匀之呈现乳白色,65℃孵育10min;
(5).加入750μL氯仿/异戊醇(24:1),颠倒混匀;12000rpm离心5min;转移上层水相至另一新的离心管;
(6).加入0.6倍体积(约450μL)的异丙醇和0.1体积(约75μL)3mol/L的醋酸钠,轻轻颠倒混匀;
(7).600-700μL混匀的液体转入吸附柱CB3中,12,000rpm(~13,400×g)离心30sec,弃掉废液;
(8).重复步骤5;
(9).向吸附柱CB3中加入500μl缓冲液GD,12,000rpm(~13,400×g)离心30sec,倒掉废液,将吸附柱CB3放入收集管中;
(10).向吸附柱CB3中加入600μl漂洗液PW,12,000rpm(~13,400×g)离心30sec,倒掉废液,将吸附柱CB3放入收集管中;
(11).重复操作步骤7;
(12).将吸附柱CB3放回收集管中,12,000rpm(~13,400×g)离心2min,倒掉废液。将吸附柱CB3置于室温放置数分钟,以彻底晾干吸附材料中残余的漂洗液。
(13).将吸附柱CB3转入一个干净的离心管中,向吸附膜的中间部位悬空滴加50-200μl洗脱缓冲液TE,室温放置2-5min,12,000rpm(~13,400×g)离心2min,将溶液收集到离心管中。
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