[发明专利]快速检测小麦光周期基因Ppd-B1甲基化水平的引物、方法及应用在审

专利信息
申请号: 201910277826.5 申请日: 2019-04-08
公开(公告)号: CN109943658A 公开(公告)日: 2019-06-28
发明(设计)人: 孙晗;吴永振;崔法;赵春华;余梦伟;黄世霞;陈易安 申请(专利权)人: 鲁东大学
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11
代理公司: 北京汇捷知识产权代理事务所(普通合伙) 11531 代理人: 马金华
地址: 264025 山东*** 国省代码: 山东;37
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摘要:
搜索关键词: 引物 甲基化水平 基因组DNA 鉴定材料 快速检测 扩增产物 小麦材料 光周期 酶切 琼脂糖凝胶电泳检测 核苷酸序列 小麦 低甲基化 反应成本 扩增片段 基因 甲基化 应用
【权利要求书】:

1.一种快速检测小麦光周期基因Ppd-B1甲基化水平的引物,其特征在于,包括Ppd-B1-HpaII-F1和Ppd-B1-HpaII-R1,其核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示。

2.一种快速检测小麦光周期基因Ppd-B1甲基化水平的方法,其特征在于,包括以下步骤:

步骤1、利用CTAB法提取小麦材料基因组DNA;

步骤2、对小麦材料基因组DNA进行酶切处理;

步骤3、对酶切后的产物进行PCR扩增处理;

步骤4、用1.5%的琼脂糖凝胶电泳检测扩增产物,如获得扩增产物的分子量为586bp的扩增片段,表明鉴定材料为Ppd-B1高甲基化类型,否则表明鉴定材料为Ppd-B1低甲基化类型。

3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述步骤2中的酶切体系如下:10×NEBuffer 2.5μL,BstUI或HpaII 0.5μL,600ng/μL DNA 3.0μL,dd H2O 19.0μL,总量为25.0μL。

4.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述步骤2中的酶切条件如下:BstUI酶切样品置于60℃,酶切15min;HpaII酶切样品置于37℃,酶切15min。

5.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述步骤3中的PCR体系如下:酶切产物1μL,10μM Ppd-B1-HpaII-F1 1μL,10μM Ppd-B1-HpaII-R1 1μL,2×PCR Master mix 12.5μL,dd H2O 9.5μL,总量为25.0μL。

6.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述步骤3中的PCR反应程序如下:①预变性94℃,5min;②94℃变性,30s;62℃退火,40s;72℃延伸,40s;40个循环;③72℃,延伸10min;④4℃,保存。

7.权利要求1所述的引物、权利要求2-6所述的方法在快速检测小麦光周期基因Ppd-B1甲基化水平中的应用。

8.权利要求1所述的引物、权利要求2-6所述的方法在小麦育种中的应用。

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