[发明专利]一种sgRNA、敲除载体、KLF4基因的敲除方法及其应用有效
申请号: | 201910263714.4 | 申请日: | 2019-04-02 |
公开(公告)号: | CN110004145B | 公开(公告)日: | 2023-01-31 |
发明(设计)人: | 包文斌;王诗琴;戴开宇;王海飞;吴圣龙 | 申请(专利权)人: | 扬州大学 |
主分类号: | C12N15/113 | 分类号: | C12N15/113;C12N15/85;C12N15/90;C12N15/12;C12N15/11 |
代理公司: | 南京苏高专利商标事务所(普通合伙) 32204 | 代理人: | 王艳 |
地址: | 225009 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 sgrna 载体 klf4 基因 方法 及其 应用 | ||
1.一种sgRNA,其特征在于,所述sgRNA的碱基序列为ACAGCCATGTCAGACTCGCC。
2.一种双链DNA,其特征在于,所述双链DNA的上游序列为: sgRNA3F: 5’-CACCGACAGCCATGTCAGACTCGCC-3’, 双链DNA的下游序列为: sgRNA3R: 5’-AAACGGCGAGTCTGACATGGCTGT-3’。
3.包含权利要求1所述的sgRNA或权利要求2所述的双链DNA的载体。
4.包含权利要求3所述的载体的细胞。
5.一种KLF4基因的敲除方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)靶位点设计及sgRNA序列的合成:根据猪KLF4基因找出CDs区5’端进行敲除靶位点设计sgRNA向导序列;所述sgRNA向导序列为ACAGCCATGTCAGACTCGCC;
2)打靶载体的构建:将设计的sgRNA向导序列退火形成双链DNA序列,然后与载体相连接得到连接产物,将连接产物导入大肠杆菌得到菌落,菌落提取质粒得到敲除载体,根据敲除载体及sgRNA序列设计PCR引物,对菌落PCR的产物进一步测序验证获得阳性打靶载体;
3)细胞转染:将阳性打靶载体加入处于对数生长期的IPEC-J2细胞的悬浮液中进行电转得到细胞液;
4)KLF4基因的敲除:将嘌呤霉素对细胞液进行药物筛选,将获得的单克隆细胞转移扩大培养,当细胞长满时,分离出部分细胞并提取其基因组DNA,根据KLF4基因全序列,在敲除靶位点附近设计高特异性的引物,然后对提取的基因组DNA进行PCR扩增得到PCR产物,对产物进行验证即可。
6.根据权利要求5所述的KLF4基因的敲除方法,其特征在于,所述步骤2)中的PCR引物为:F3:5’-CATATGCTTACCGTAACTTGAAAG-3’; R3:5’-GGCGAGTCTGACATGGCTGT-3’。
7.根据权利要求5所述的KLF4基因的敲除方法,其特征在于,所述步骤2)中菌落PCR的反应程序为95℃ 10 min;95℃ 35 sec,60℃ 35 sec,72℃ 35 sec,35个循环;72℃10min。
8.根据权利要求5所述的KLF4基因的敲除方法,其特征在于,所述步骤3)中IPEC-J2细胞浓度为1~2×106个/ml。
9.根据权利要求5所述的KLF4基因的敲除方法,其特征在于,所述步骤4)高特异性的引物序列为: F: 5’-GGACTTCGGAGGACCTCTGA-3’; R: 5’-CCACCCACAGAAGCCCACTA-3’。
10.根据权利要求5所述的KLF4基因的敲除方法,其特征在于,所述步骤4)PCR反应程序为95℃ 5 min;95℃ 10 sec,60℃ 10 sec,72℃ 10 sec,35个循环;72℃ 5 min。
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