[发明专利]基于数字PCR技术检测EGFR基因L858R突变的特异性引物、探针及试剂盒在审
申请号: | 201910234672.1 | 申请日: | 2019-03-26 |
公开(公告)号: | CN110066873A | 公开(公告)日: | 2019-07-30 |
发明(设计)人: | 许宝芝;秦颖 | 申请(专利权)人: | 德路通(石家庄)生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/11 |
代理公司: | 石家庄旭昌知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 13126 | 代理人: | 雷莹 |
地址: | 050000 河北省石家*** | 国省代码: | 河北;13 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 突变 特异性引物 技术检测 数字PCR 试剂盒 核苷酸序列 上游引物 下游引物 探针 高检测灵敏度 病理组织 扩增效率 突变频率 游离DNA 检测 扩增 切片 血液 | ||
1.一种基于数字PCR技术检测EGFR基因L858R突变的特异性引物,包括上游引物和下游引物,其特征在于:
所述上游引物,选自以下核苷酸序列的一种:
5′-ACT ACTTGGAGGA CCGTCGCTT-3′,
5′-ACTTGGAGGA CCGTCGCTTG-3′,
5′-CCAGGAACGTA CTGGTGAAAA C-3′或
5′-CAGGAACGTA CTGGTGAAAA CA-3′;
所述下游引物,选自以下核苷酸序列的一种:
5′-ATGGTATTCTTTCTCTTCCGCAC-3′,
5′-CTTTCTCTTCCGCACCCAGC-3′或
5′-GTATTCTTTCTCTTCCGCACCC-3′。
2.一种基于数字PCR技术检测EGFR基因L858R突变的探针,用于与权利要求1中所述的特异性引物配合使用,其特征在于:包括突变型探针和野生型探针;
所述突变型探针的核苷酸序列为5′-FAM-TTGGGCGGGCCAA ACT-MGB-NFQ-3′;所述突变型探针5′端设有荧光基团FAM,所述突变型探针3′端设有淬灭基团NFQ;
所述野生型探针的核苷酸序列为5′-VIC-TTGGGCTGGCCAA ACT-MGB-NFQ-3′;所述野生型探针5′端设有荧光基团VIC,所述野生型探针3′端设有淬灭基团NFQ。
3.根据权利要求2所述的探针,其特征在于:所述突变型探针和所述野生型探针均加入MGB。
4.一种基于数字PCR技术检测EGFR基因L858R突变的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒包括权利要求1所述的特异性引物和权利要求2-3中任一项所述的探针。
5.根据权利要求4所述的的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒还包括PCR预混液,所述预混液包括dNTPs、Taq酶和PCR缓冲液。
6.根据权利要求4或5中任一项所述的的试剂盒,其特征在于:所述上游引物于PCR反应扩增体系中的终浓度为400~500nM,所述下游引物于所述PCR反应扩增体系中的终浓度为400~500nM,所述突变型探针于所述PCR反应扩增体系中的终浓度为200~300nM,所述野生型探针于所述PCR反应扩增体系中的终浓度为200~300nM。
7.根据权利要求6所述的试剂盒,其特征在于:所述PCR反应扩增体系的扩增条件为:
a、95℃10min,进行1个循环;
b、94℃30s,58℃1min,进行40个循环;
c、98℃10min,进行1个循环;
d、4℃维持。
8.根据权利要求4或5所述的试剂盒,其特征在于:所述DNA模板的来源为病理组织中提取的DNA、病理切片中提取的DNA或血浆游离DNA。
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