[发明专利]用于定量监测山核桃干腐病侵染和传播的qLAMP方法及所用引物有效

专利信息
申请号: 201910201728.3 申请日: 2019-03-18
公开(公告)号: CN109897908B 公开(公告)日: 2022-05-27
发明(设计)人: 张传清;王琼伟;刘亚慧;徐炳潮 申请(专利权)人: 浙江农林大学
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12Q1/6851;C12Q1/06;C12N15/11;C12R1/645
代理公司: 杭州中成专利事务所有限公司 33212 代理人: 金祺
地址: 311300 浙*** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: 用于 定量 监测 山核桃 干腐病 侵染 传播 qlamp 方法 所用 引物
【权利要求书】:

1.用于定量监测山核桃干腐病侵染和传播的qLAMP方法,其特征在于:

1)、q-LAMP反应

q-LAMP反应体系:

10×ThermoPol Buffer 2.0μL、10mM的dNTPs 2.0μL、25mM的MgCl2 5.0μL、5M的甜菜碱2.4μL、10×SYBR Green I 1.2μL、8U/μL的Bst DNA聚合酶1μL,20μM的FIP引物1.6μL、20μM的BIP引物1.6μL、10μM的F3引物0.25μL、10μM的B3引物0.25μL、DNA模板1μL,ddH2O补足至20μL;

扩增条件为恒温65.9℃,1min,进行80个循环;80℃反应10min,终止反应;

F3引物:5’—TGTCCATAGGTTCACCTCCA—3’;

B3引物:5’—AGATGGTCTGCCTGTGGT—3’;

FIP引物:5’—CAAAGTCAGCGCGATGCAGCGACCGGCCAATGCGTAAG—3’;

FIB引物:5’—AGGGTAACCAAATCGGTGCTGCGTCGATTCGCGTTAGCGG—3’;

2)、获得孢子数量、DNA浓度:

孢子个数的计算公式为

DNA浓度计算公式为

y为CT值。

2.根据权利要求1所述的用于定量监测山核桃干腐病侵染和传播的qLAMP方法,其特征在于:

q-LAMP反应体系中,FIP引物、BIP引物的终浓度为1.6μM,F3引物、B3引物的终浓度为0.125μM。

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