[发明专利]用于定量监测山核桃干腐病侵染和传播的qLAMP方法及所用引物有效
| 申请号: | 201910201728.3 | 申请日: | 2019-03-18 |
| 公开(公告)号: | CN109897908B | 公开(公告)日: | 2022-05-27 |
| 发明(设计)人: | 张传清;王琼伟;刘亚慧;徐炳潮 | 申请(专利权)人: | 浙江农林大学 |
| 主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6851;C12Q1/06;C12N15/11;C12R1/645 |
| 代理公司: | 杭州中成专利事务所有限公司 33212 | 代理人: | 金祺 |
| 地址: | 311300 浙*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 用于 定量 监测 山核桃 干腐病 侵染 传播 qlamp 方法 所用 引物 | ||
1.用于定量监测山核桃干腐病侵染和传播的qLAMP方法,其特征在于:
1)、q-LAMP反应
q-LAMP反应体系:
10×ThermoPol Buffer 2.0μL、10mM的dNTPs 2.0μL、25mM的MgCl2 5.0μL、5M的甜菜碱2.4μL、10×SYBR Green I 1.2μL、8U/μL的Bst DNA聚合酶1μL,20μM的FIP引物1.6μL、20μM的BIP引物1.6μL、10μM的F3引物0.25μL、10μM的B3引物0.25μL、DNA模板1μL,ddH2O补足至20μL;
扩增条件为恒温65.9℃,1min,进行80个循环;80℃反应10min,终止反应;
F3引物:5’—TGTCCATAGGTTCACCTCCA—3’;
B3引物:5’—AGATGGTCTGCCTGTGGT—3’;
FIP引物:5’—CAAAGTCAGCGCGATGCAGCGACCGGCCAATGCGTAAG—3’;
FIB引物:5’—AGGGTAACCAAATCGGTGCTGCGTCGATTCGCGTTAGCGG—3’;
2)、获得孢子数量、DNA浓度:
孢子个数的计算公式为
DNA浓度计算公式为
y为CT值。
2.根据权利要求1所述的用于定量监测山核桃干腐病侵染和传播的qLAMP方法,其特征在于:
q-LAMP反应体系中,FIP引物、BIP引物的终浓度为1.6μM,F3引物、B3引物的终浓度为0.125μM。
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