[发明专利]基于Toehold介导链置换反应引发滚环扩增和FRET检测miRNA的方法有效
| 申请号: | 201910160872.7 | 申请日: | 2019-03-04 |
| 公开(公告)号: | CN110004213B | 公开(公告)日: | 2023-01-03 |
| 发明(设计)人: | 唐波;刘炬;王慧;李平;梁凯丽 | 申请(专利权)人: | 山东师范大学 |
| 主分类号: | C12Q1/6844 | 分类号: | C12Q1/6844;C12N15/11;C12Q1/6886;C12Q1/6883 |
| 代理公司: | 济南圣达知识产权代理有限公司 37221 | 代理人: | 王磊 |
| 地址: | 250012 山*** | 国省代码: | 山东;37 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 基于 toehold 介导链 置换反应 引发 扩增 fret 检测 mirna 方法 | ||
1.一种基于Toehold介导链置换反应引发滚环扩增和FRET检测miRNA的引物组,其特征是,包括哑铃型DNA探针、含有供体荧光基团的DNA单链探针、含有受体荧光基团的DNA单链探针;
所述哑铃型DNA探针为5'端和3'端连接的封闭的单链DNA形成的茎环结构,且所述茎环结构中茎的两端均有一个环,其中一个环含有toehold序列,toehold序列与茎的一条单链直接连接,所述茎的一条单链的序列与toehold序列构成的整体序列能够和待测miRNA配位;
含有供体荧光基团的DNA单链探针和含有受体荧光基团的DNA单链探针均能够与引发待测miRNA滚环扩增反应形成的DNA单链进行配位,使配位后的供体荧光基团和受体荧光基团产生荧光共振能量转移;
toehold序列长度为具有8个碱基的序列;
所述哑铃型DNA探针从5'端到3'端的DNA序列为:GACAACCTACAAATACTGATGACAATCTATAAGGTTGTCCGTGTTGCAACAGAGAAGACAACACG;
含有受体荧光基团的DNA单链探针的DNA序列为:ATGACAATCTA;
含有供体荧光基团的DNA单链探针的DNA序列为:AGAGAAGACAACACGGACAACCT。
2.如权利要求1所述的引物组,其特征是,所述供体荧光基团为羧基四甲基罗丹明,所述受体荧光基团为6-羧基荧光素。
3.一种miRNA的检测试剂盒,其特征是,包括权利要求1~2任一所述的引物组、DNA聚合酶、DNA聚合酶反应缓冲液、BSA、dNTPs。
4.如权利要求3所述的检测试剂盒,其特征是,所述DNA聚合酶为phi29 DNA聚合酶。
5.一种非疾病诊断目的的基于Toehold介导链置换反应引发滚环扩增和FRET检测miRNA的方法,其特征是,采用权利要求1~2任一所述的引物组或权利要求3~4任一所述的试剂盒,其过程包括:
先向待测中添加哑铃型DNA探针、DNA聚合酶、DNA聚合酶反应缓冲液、dNTPs和水加热至体温下进行反应,反应终止;再添加含有供体荧光基团的DNA单链探针和含有受体荧光基团的DNA单链探针进行反应;然后进行荧光检测。
6.如权利要求5所述的方法,其特征是,反应终止的步骤为:加热至60~70℃反应。
7.如权利要求5所述的方法,其特征是,向链状DNA单链中添加DNA连接酶及DNA连接酶反应缓冲液,在20~25℃进行反应,终止反应后获得哑铃型DNA探针。
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