[发明专利]一种基因测序芯片识别方法

说明书

本发明提供一种基因测序芯片识别方法。利用了FOP天然的指纹特征结合制备的定位标，可以代替传统的RFID等技术，并且不额外增加成本。本发明利用了FOP光传导的性质，在反应室相反的表面上制备定位标。利用传统的方式制备了体积、占表面积微小的定位系统，可以使得芯片具备精确定位的功能。当测序反应发生的时候，反应信号通过FOP传导到另一个表面，通过摄像系统的拍照，获得了反应信号的信息，同时还获得了定位信息。这种特殊的芯片识别方法，制备方法简单，成本低，适用于生物化学检测领域。

技术领域

本发明涉及一种基因测序芯片识别方法。更精确的说，涉及一种双面定位的FOP基因测序芯片识别方法，属于基因测序领域。

背景技术

基因测序是一种新型基因检测技术。目前，基因测序技术迅速成熟，已经开始涉足各种疾病的诊断和治疗中。基因芯片属于其中的重要研究方向之一。目前已经有多种多样的基因测序芯片问世。根据测序方法和需求的不同，测序芯片的设计也完全不一样，但主要的检测方法都是对芯片的检测区域进行扫描，收集扫描后的荧光信号进行分析。基因芯片实际应用的过程中，有两个主要的问题制约其发展。第一：在芯片扫描过程中，可能会遇到相邻的扫描区域错位、重叠的现象；第二：基因芯片的特定性难以记录，加密的技术实现比较麻烦、成本高。

本发明提供一种利用FOP(光纤面板fiber optocal plates)作为生物化学芯片，特别是测序芯片识别的方法。在FOP的一个表面上制作定位标，将其另一个表面和底板等封装在一起，形成密封的结构。不仅可以实现在定位表面的成像，还可以准确的确定位置信息，形成独特的双面定位结构。利用该测序芯片，识别定位标以后，可以识别特征芯片的特征指纹，从而识别测序芯片。

发明内容

一种基因测序芯片识别方法，包括以下步骤：

首先将FOP基因测序芯片放入测序仪；所述FOP的下表面有预先制备好的微坑，上表面带有预先制备好的定位标；

基因测序仪的物镜聚焦于基因测序芯片的FOP的上表面；

识别定位标；

设定起始位置，沿着一定的方向识别FOP的特征指纹；

开始测序。

根据优选的实施方式，所述沿着一定的方向识别FOP的特征指纹指的是识别沿着FOP的二次复丝的边界延伸的单丝形状信息。

根据优选的实施方式，所述沿着FOP的二次复丝的边界延伸的单丝形状信息指的是，根据一定的规则，将边界的单丝形状通过图像识别的方式转化成1和0。

根据优选的实施方式，所述基因测序芯片包括第一基板和第二基板；所述第一基板的上表面上有预先制备好的定位标，用于光学系统成像精确定位；所述第一基板的下表面上有预先制备好的微坑，用于基因测序反应；所述第一基板的下表面和第二基板封装组成芯片；所述第一基板为FOP。

根据优选的实施方式，所述测序仪包括基因测序芯片，流体系统，光学系统；所述光学系统包括物镜，聚焦于基因测序芯片的上表面。

根据优选的实施方式，在FOP的表面旋涂光刻胶，然后进行曝光，显影，获得表面的定位标；然后将FOP的带微坑的表面作为反应池的一个内表面，将FOP和底板组合在一起，形成密封的芯片。

根据优选的实施方式，FOP和底板之间用预先刻好图案的双面胶组合在一起，双面胶镂空的部分形成芯片的流体腔室。

根据优选的实施方案，所述FOP的芯层直径为1-5微米，优选1.5-4微米，更优选2-3.5微米。

根据优选的实施方案，所述FOP的皮层厚度为0.5-2微米，优选0.6-1.5微米，更优选0.7-1.0微米。

根据优选的实施方式，所述定位标是方形，或者无规则图形，或者其组合。