[发明专利]一种与辣椒核不育相关的SNP分子标记及其应用

说明书

本发明属于蔬菜分子育种技术领域，具体涉及一种与辣椒核不育相关的SNP分子标记及其应用。所述的与辣椒核不育相关的SNP分子标记为SNP2、SNP3、SNP4、SNP7或SNP8，其SNP位点的核苷酸序列如SEQ ID NO.1～5所示，该分子标记与辣椒育性表型共分离或紧密连锁。本发明还提供了一种鉴定上述SNP分子标记的KASP引物，该引物可以用于快速鉴定辣椒育性表型，能够极大地加快新的辣椒核雄性不育系的转育进程。而本发明开发的与辣椒核不育相关的SNP分子标记属于核不育基因共分离SNP标记，可以实现在辣椒幼苗期判定植株育性，从而减少制种成本。同时，也可以加速新的辣椒核雄性不育系的转育进程。

技术领域

本发明属于蔬菜分子育种技术领域，具体涉及一种与辣椒核不育相关的SNP分子标记及其应用。

背景技术

辣椒是世界范围内广泛栽培的一种茄科蔬菜作物。辣椒杂种优势明显，杂种一代种子是辣椒目前和今后生产用种的主要利用形式。利用雄性不育繁殖杂种一代种子可以免除人工去雄，从而降低种子生产成本，是辣椒杂种优势利用的理想途径。

用于辣椒杂种一代种子生产的雄性不育类型主要有两种，即质核互作雄性不育(cytoplasmic male sterility，CMS)和细胞核雄性不育(genic male sterility，GMS)。后者比前者通常具有不育性更为稳定和不受恢保关系限制等优点，而且GMS不存在不育胞质负效应和胞质单一化的潜在风险。

自1969年Shifriss等发现第一个自然突变的辣椒GMS基因(命名为ms1)以来，国内外先后报道了20多个人工或自然突变的辣椒GMS基因。但是，仅有少数基因被确定基因座位，如ms1、ms3、ms8、ms_w、ms_nw和msc-1分别被定位于辣椒5、1、4、5、5和2号染色体上，其余辣椒GMS基因的物理位置以及它们之间的等位关系均尚不清楚。

此外，目前利用GMS两用系进行辣椒杂种一代种子生产时，仍采用常规的方法，即从开花初期开始，人工鉴别单株育性后，逐一拔除群体中的约50％的可育株，这极大地限制了GMS的大规模应用。通过开发辣椒GMS基因紧密连锁的分子标记，可以实现在种子或者苗期阶段对个体育性进行早期鉴别，对于GMS的高效转育以及提高杂种一代制种效率均具有重要的意义。

发明内容

为了克服现有技术的不足和缺点，本发明的首要目的在于提供一种与辣椒核不育相关的SNP分子标记。

本发明的另一目的在于提供上述与辣椒核不育相关的SNP分子标记的应用。

本发明的再一目的在于提供一种鉴定上述与辣椒核不育相关的SNP分子标记的KASP引物。

本发明的第四个目的在于提供上述鉴定与辣椒核不育相关的SNP分子标记的KASP引物的应用。

本发明的第五个目的在于提供一种辣椒分子育种的方法。

本发明的目的通过下述技术方案实现：

一种与辣椒核不育相关的SNP分子标记，为SNP2、SNP3、SNP4、SNP7或SNP8，其中，SNP2的SNP位点对应于辣椒参考基因组Zunla-1 10号染色体上第3,425,281个核苷酸位点GT突变；SNP3的SNP位点对应于辣椒10号染色体上第3,425,392个核苷酸位点GT突变；SNP4的SNP位点对应于辣椒10号染色体上第3,425,965个核苷酸位点CT突变；SNP7的SNP位点对应于辣椒10号染色体上第3,511,564个核苷酸位点GA突变；SNP8的SNP位点对应于辣椒10号染色体上第3,512,704个核苷酸位点CA突变；

所述的SNP2的SNP位点的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，其中序列中的M是G或T，导致辣椒育性表型的不同；