[发明专利]一种与辣椒核不育相关的SNP分子标记及其应用

权利要求书

1.一种与辣椒核不育相关的SNP分子标记在辣椒育种中的应用，其特征在于所述的与辣椒核不育相关的SNP分子标记为SNP2、SNP3、SNP4、SNP7或SNP8；

所述的SNP2的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，其中序列中的M为SNP2的SNP位点，是G或T，导致辣椒育性表型的不同；

所述的SNP3的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示，其中序列中的M为SNP3的SNP位点，是G或T，导致辣椒育性表型的不同；

所述的SNP4的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示，其中序列中的M为SNP4的SNP位点，是C或T，导致辣椒育性表型的不同；

所述的SNP7的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示，其中序列中的M为SNP7的SNP位点，是G或A，导致辣椒育性表型的不同；

所述的SNP8的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示，其中序列中的M为SNP8的SNP位点，是C或A，导致辣椒育性表型的不同。

2.一种鉴定权利要求1中所述的与辣椒核不育相关的SNP分子标记的KASP引物，其特征在于其核苷酸序列如下所示：

引物A1-SNP2：5’-CTCATCAACCATATCACTACAACTAC-3’；

引物A2-SNP2：5’-CTTCTCATCAACCATATCACTACAACTAA-3’；

通用引物SNP2：5’-CTGTTAGAYAATCGCGCTGCTGCTA-3’；

引物A1-SNP3：5’-AACTATATCAGTACTAATAGCAGCGC-3’；

引物A2-SNP3：5’-CAACTATATCAGTACTAATAGCAGCGA-3’；

通用引物SNP3：5’-GGTTGTTGAGACGACAAATGTACTGTTA-3’；

引物A1-SNP4：5’-GGAAATGACTGGAAATGTGCTGTC-3’；

引物A2-SNP4：5’-CGGAAATGACTGGAAATGTGCTGTT-3’；

通用引物SNP4：5’-GCATCAACTAACAAAATCACAAACTGAGTT-3’；

引物A1-SNP7：5’-CATATATTCCCCATCAATTATCCCAC-3’；

引物A2-SNP7：5’-CATATATTCCCCATCAATTATCCCAT-3’；

通用引物SNP7：5’-GAATGTAATCGGAAAAGTCAACCACGAT-3’；

引物A1-SNP8：5’-CACTGCTTGGCTTGGTTGAGC-3’；

引物A2-SNP8：5’-GCACTGCTTGGCTTGGTTGAGA-3’；

通用引物SNP8：5’-CACATGCAAAGTTGATCAACTCCATTGAA-3’。

3.权利要求2所述的鉴定权利要求1中所述的与辣椒核不育相关的SNP分子标记的KASP引物在辣椒育种中的应用。

4.一种辣椒育性苗期分子标记鉴定的方法，其特征在于包含如下步骤：

以辣椒幼苗样品DNA为模板，以权利要求2所述的鉴定权利要求1中所述的与辣椒核不育相关的SNP分子标记的KASP引物为扩增引物，进行PCR扩增，然后利用酶标仪读取PCR板上每个孔的荧光信号，根据荧光信号判定样品基因分型信息，并确定辣椒育性。

5.根据权利要求4所述的辣椒育性苗期分子标记鉴定的方法，其特征在于：

所述的PCR扩增的反应体系为：0.36 μL DNA溶液，0.5 μL 2×KASP Master mix 1536，0.14 μL Primer mix。

6.根据权利要求4所述的辣椒育性苗期分子标记鉴定的方法，其特征在于：

所述的PCR扩增的反应程序为：

95℃变性15 min；94℃变性20 s，61至55℃退火60 s, 每个循环降0.6℃，共10个循环；94℃变性20 s，55℃退火60 s，26个循环。