[发明专利]基于FRET的端粒酶活性检测方法有效

专利信息
申请号: 201910006456.1 申请日: 2019-01-04
公开(公告)号: CN109897887B 公开(公告)日: 2023-03-14
发明(设计)人: 缪鹏;孟凡渝;陈锡峰;马筱一;梅茜 申请(专利权)人: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
主分类号: C12Q1/6818 分类号: C12Q1/6818;C12Q1/48
代理公司: 北京远大卓悦知识产权代理有限公司 11369 代理人: 韩飞
地址: 215163 江苏*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 基于 fret 端粒 活性 检测 方法
【说明书】:

发明公开了一种基于FRET的端粒酶活性检测方法,包括以下步骤:首先设计荧光修饰的Flare DNA;再利用四个单链DNA:S1、S2、S3、S4,构建出DNA四面体结构;然后将DNA四面体与Flare DNA进行杂交,获得荧光DNA纳米探针;再将荧光DNA纳米探针与端粒酶混合反应,获取混合物的荧光光谱。本发明设计的基于FRET的荧光探针,可提供精确的检测结果,避免了假阳性信号的产生并使生物成像中系统波动的影响最小化。另一方面,三维(3D)DNA纳米结构具有优异的生物相容性和纳米级可控性,可以通过快速内吞途径进入细胞内,并保持细胞基本的完整性和稳定性,经过合理组装后可应用于生物传感和生物成像。

技术领域

本发明涉及端粒酶检测技术领域,特别涉及一种基于FRET的端粒酶活性检测方法。

背景技术

端粒酶被认为是早期癌症诊断的关键生物标志物,开发敏感而实用的端粒酶活性检测方法对于临床诊断,生物学研究和抗癌药物的开发具有重要意义。基于聚合酶链式反应的端粒重复序列扩增方案(TRAP)是检测端粒酶最常用的方法,另外还开发了许多其他应用,比如荧光、比色、电化学和电化学发光等技术来探测端粒酶活性。虽然这些方法具有较好的灵敏度,但是大多数需要细胞裂解样品,导致细胞来源的人工损失,还面临复杂的操作和误报读数。此外,只有少数基于DNA四面体的探针被设计用于细胞内端粒酶分析,这些探针主要基于单一信号源检测。因此,很多无法避免源自核酸酶消化、蛋白质结合或热力学波动的高假阳性信号。

发明内容

本发明所要解决的技术问题在于针对上述现有技术中的不足,提供一种基于FRET的端粒酶活性检测方法。

为解决上述技术问题,本发明采用的技术方案是:一种基于FRET的端粒酶活性检测方法,包括以下步骤:首先设计两端分别修饰Cy3和Cy5荧光团的单链Flare DNA;再利用四个单链DNA:S1、S2、S3、S4,构建出DNA四面体结构,其中,S4链在其3'末端含有引物区段,用于端粒酶催化的延伸,S1被设计成具有两个Flare互补区域,其在DNA四面体的形成期间保持未杂交;然后将DNA四面体与Flare DNA进行杂交,获得荧光DNA纳米探针;再将荧光DNA纳米探针与端粒酶混合反应,获取混合物的荧光光谱,并对荧光光谱进行分析处理,实现对端粒酶活性的测定。

优选的是,该方法还包括将经端粒酶抑制剂AZT处理后的延伸溶液与荧光DNA纳米探针混合反应,获取混合物的荧光光谱,并对荧光光谱进行分析处理,以作为对照实验。

优选的是,该基于FRET的端粒酶活性检测方法具体包括以下步骤:

1)设计荧光标记的Flare DNA探针,在其单链DNA的两端分别修饰Cy3和Cy5荧光团;

2)利用四个单链DNA:S1、S2、S3、S4,通过自下而上的退火反应,将等摩尔量的四种探针在Tris-HCl缓冲液中混合,并完全杂交,构建出DNA四面体结构;

其中,S4链在其3'末端含有引物区段,用于端粒酶催化的延伸反应,S1被设计成具有两个Flare互补区域,其在DNA四面体的形成期间保持未杂交;

3)通过在等摩尔量的互补序列之间进行杂交,将形成的DNA四面体与Flare DNA杂交获得荧光DNA纳米探针;

4)进行端粒酶活性的体外测量:提取端粒酶,再将端粒酶提取物与荧光DNA纳米探针混合反应,获取混合液的荧光光谱,并对荧光光谱进行分析,实现对端粒酶活性的测定。

优选的是,所述步骤4)中还包括:设置对照实验,端粒酶抑制剂AZT处理后的延伸溶液与荧光DNA纳米探针混合反应,获取其荧光光谱,并对荧光光谱进行分析。

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