[发明专利]基于FRET的端粒酶活性检测方法有效
| 申请号: | 201910006456.1 | 申请日: | 2019-01-04 |
| 公开(公告)号: | CN109897887B | 公开(公告)日: | 2023-03-14 |
| 发明(设计)人: | 缪鹏;孟凡渝;陈锡峰;马筱一;梅茜 | 申请(专利权)人: | 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所 |
| 主分类号: | C12Q1/6818 | 分类号: | C12Q1/6818;C12Q1/48 |
| 代理公司: | 北京远大卓悦知识产权代理有限公司 11369 | 代理人: | 韩飞 |
| 地址: | 215163 江苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 基于 fret 端粒 活性 检测 方法 | ||
本发明公开了一种基于FRET的端粒酶活性检测方法,包括以下步骤:首先设计荧光修饰的Flare DNA;再利用四个单链DNA:S1、S2、S3、S4,构建出DNA四面体结构;然后将DNA四面体与Flare DNA进行杂交,获得荧光DNA纳米探针;再将荧光DNA纳米探针与端粒酶混合反应,获取混合物的荧光光谱。本发明设计的基于FRET的荧光探针,可提供精确的检测结果,避免了假阳性信号的产生并使生物成像中系统波动的影响最小化。另一方面,三维(3D)DNA纳米结构具有优异的生物相容性和纳米级可控性,可以通过快速内吞途径进入细胞内,并保持细胞基本的完整性和稳定性,经过合理组装后可应用于生物传感和生物成像。
技术领域
本发明涉及端粒酶检测技术领域,特别涉及一种基于FRET的端粒酶活性检测方法。
背景技术
端粒酶被认为是早期癌症诊断的关键生物标志物,开发敏感而实用的端粒酶活性检测方法对于临床诊断,生物学研究和抗癌药物的开发具有重要意义。基于聚合酶链式反应的端粒重复序列扩增方案(TRAP)是检测端粒酶最常用的方法,另外还开发了许多其他应用,比如荧光、比色、电化学和电化学发光等技术来探测端粒酶活性。虽然这些方法具有较好的灵敏度,但是大多数需要细胞裂解样品,导致细胞来源的人工损失,还面临复杂的操作和误报读数。此外,只有少数基于DNA四面体的探针被设计用于细胞内端粒酶分析,这些探针主要基于单一信号源检测。因此,很多无法避免源自核酸酶消化、蛋白质结合或热力学波动的高假阳性信号。
发明内容
本发明所要解决的技术问题在于针对上述现有技术中的不足,提供一种基于FRET的端粒酶活性检测方法。
为解决上述技术问题,本发明采用的技术方案是:一种基于FRET的端粒酶活性检测方法,包括以下步骤:首先设计两端分别修饰Cy3和Cy5荧光团的单链Flare DNA;再利用四个单链DNA:S1、S2、S3、S4,构建出DNA四面体结构,其中,S4链在其3'末端含有引物区段,用于端粒酶催化的延伸,S1被设计成具有两个Flare互补区域,其在DNA四面体的形成期间保持未杂交;然后将DNA四面体与Flare DNA进行杂交,获得荧光DNA纳米探针;再将荧光DNA纳米探针与端粒酶混合反应,获取混合物的荧光光谱,并对荧光光谱进行分析处理,实现对端粒酶活性的测定。
优选的是,该方法还包括将经端粒酶抑制剂AZT处理后的延伸溶液与荧光DNA纳米探针混合反应,获取混合物的荧光光谱,并对荧光光谱进行分析处理,以作为对照实验。
优选的是,该基于FRET的端粒酶活性检测方法具体包括以下步骤:
1)设计荧光标记的Flare DNA探针,在其单链DNA的两端分别修饰Cy3和Cy5荧光团;
2)利用四个单链DNA:S1、S2、S3、S4,通过自下而上的退火反应,将等摩尔量的四种探针在Tris-HCl缓冲液中混合,并完全杂交,构建出DNA四面体结构;
其中,S4链在其3'末端含有引物区段,用于端粒酶催化的延伸反应,S1被设计成具有两个Flare互补区域,其在DNA四面体的形成期间保持未杂交;
3)通过在等摩尔量的互补序列之间进行杂交,将形成的DNA四面体与Flare DNA杂交获得荧光DNA纳米探针;
4)进行端粒酶活性的体外测量:提取端粒酶,再将端粒酶提取物与荧光DNA纳米探针混合反应,获取混合液的荧光光谱,并对荧光光谱进行分析,实现对端粒酶活性的测定。
优选的是,所述步骤4)中还包括:设置对照实验,端粒酶抑制剂AZT处理后的延伸溶液与荧光DNA纳米探针混合反应,获取其荧光光谱,并对荧光光谱进行分析。
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