[发明专利]非复制型转导颗粒和基于转导颗粒的报告系统在审
| 申请号: | 201880081753.6 | 申请日: | 2018-12-20 |
| 公开(公告)号: | CN111492069A | 公开(公告)日: | 2020-08-04 |
| 发明(设计)人: | S.杜根尼;E.H.菲斯;M.雷富斯 | 申请(专利权)人: | 豪夫迈·罗氏有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/6897 | 分类号: | C12Q1/6897;C12Q1/14;C12Q1/18;C12N7/00;C12N15/74 |
| 代理公司: | 中国专利代理(香港)有限公司 72001 | 代理人: | 甘霖;李唐 |
| 地址: | 瑞士*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 复制 转导 颗粒 基于 报告 系统 | ||
1.一种用于检测样品中的金黄色葡萄球菌的方法,所述方法包括以下步骤:
(a)使所述样品与包含多个非复制型转导颗粒(NRTP)的裂解产物接触,使得如果金黄色葡萄球菌存在于样品中,则多个NRTP转导金黄色葡萄球菌,其中多个NRTP通过以下产生:
(i)诱导细菌细胞包装系统的裂解阶段,其中所述细菌细胞包装系统包含:宿主细菌细胞;作为溶素原存在于宿主细菌细胞内,具有破坏的terS包装起始位点序列的80α细菌噬菌体基因组;与80α细菌噬菌体基因组分开的报告核酸分子,其具有luxAB报告基因和未破坏的包装起始位点序列,用于促进将报告核酸分子的复制子包装到NRTP内,其中所述报告核酸分子包含选自SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4和SEQ ID NO:5的序列;
(ii)允许报告核酸分子的复制子被包装以产生NRTP;
(b)提供用于luxAB报告基因表达的条件;和
(c)检测由luxAB报告基因产生的光是否存在,其中所述光的存在指示金黄色葡萄球菌的存在。
2.权利要求1的方法,其进一步包括在步骤(b)之前,向样品提供抗微生物剂,并且检测由luxAB报告基因产生的光是否存在的步骤,以测定所述样品是否含有对抗微生物剂抗性或敏感的金黄色葡萄球菌。
3.权利要求1或2中任一项的方法,其中所述报告核酸分子包含SEQ ID NO:3的序列。
4.权利要求1或2中任一项的方法,其中所述报告核酸分子包含SEQ ID NO:4的序列。
5.权利要求1或2中任一项的方法,其中所述报告核酸分子包含SEQ ID NO:5的序列。
6.权利要求1-5中任一项的方法,其中具有破坏的terS包装起始位点序列的所述80α细菌噬菌体基因组包含SEQ ID NO:1的序列。
7.一种细菌细胞包装系统,其用于将报告核酸分子包装到非复制型转导颗粒(NRTP)内,用于引入金黄色葡萄球菌内,所述细菌细胞包装系统包含:
(a)宿主细菌细胞;
(b)作为溶素原存在于宿主细菌细胞内,具有破坏的包装起始位点序列的80α细菌噬菌体基因组;和
(c)与80α细菌噬菌体基因组分开的报告核酸分子,其具有luxAB报告基因和未破坏的包装起始位点序列,用于促进将报告核酸分子的复制子包装到NRTP内,其中所述报告核酸分子包含选自SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4和SEQ ID NO:5的序列。
8.权利要求7的细胞包装系统,其中所述报告核酸分子包含SEQ ID NO:3的序列。
9.权利要求7的细胞包装系统,其中所述报告核酸分子包含SEQ ID NO:4的序列。
10.权利要求7的细胞包装系统,其中所述报告核酸分子包含SEQ ID NO:5的序列。
11.权利要求7至10中任一项的细胞包装系统,其中具有破坏的terS包装起始位点序列的所述80α细菌噬菌体基因组包含SEQ ID NO:1的序列。
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