[发明专利]用于核酸序列分析的具有反应性表面的流动池

说明书

一种流动池制品，其包括：腔室；以及腔室的至少一个表面，其包括：具有反应性表面的固体基材，其包括：共价附接于固体基材的偶联剂；共价附接于偶联剂的聚合物；和共价附接于聚合物的核酸探针。还公开了制造所述制品的方法和使用所述制品的方法。

相关申请的交叉引用

本申请依据35U.S.C.§119要求于2017年9月18日提交的系列号为62/559,951的美国临时申请的优先权权益，本文以该申请的内容为基础并将其通过引用全文纳入本文。

本文中提及的每种公开物或专利文件的完整公开内容通过引用纳入本文。

背景

本公开涉及用于核酸序列分析的具有反应性表面的流动池。

发明内容

在实施方式中，本公开提供了用于核酸序列分析的具有反应性表面的流动池制品。

在实施方式中，本公开提供了具有胺反应性聚合涂层的流动池制品，所述胺反应性聚合涂层用于共价偶联胺封端的核酸(例如，DNA)探针分子。

在实施方式中，本公开提供了一种流动池制品，其具有共价偶联到胺反应性聚合涂层的胺封端的核酸(例如DNA)探针分子。

在实施方式中，可精确控制附接的核酸(例如DNA)探针分子的密度。

在实施方式中，本公开提供了一种控制附接的胺封端的核酸(例如DNA)探针分子的密度的方法，其可精确地控制含有与核酸探针互补的接头序列的DNA片断的杂交量，这可改进多克隆簇化(clustering)和测序效率。

附图说明

在本公开的实施方式中：

图1示出了共价偶联到固体载体的DNA探针分子的示意图(100)。

图2示出了在不同条件下与Cy3标记的dT30杂交后，存在dA30的表面的荧光强度的条形图。

图3示出了用0.05M NaOH处理并随后在不同条件下与Cy3标记的dT30杂交后，存在dA30的表面的荧光强度的条形图。

图4示出了在与Cy3标记的dT30杂交后，表面的荧光图像。

图5A和5B分别示出了具有8个通道并且每个通道由附接于反应性聚合物涂层的胺封端的dA30组成的完整流动池的照片图(5A)和荧光图(5B)。荧光图(5B)在与Cy3标记的dT30杂交后获得。

具体实施方式

下面参考附图(若有)对本公开的各个实施方式进行详细描述。参考各个实施方式不限制本发明的范围，本发明的范围仅受所附权利要求书的范围限制。此外，在本说明书中列出的任何实例都不是限制性的，并且仅列出了要求保护的本发明的诸多可能的实施方式中的一些实施方式。

在实施方式中，所公开的制品及制造和使用方法提供了一个或多个优势特征或方面，包括例如，如下文所述的优势特征或方面。在任何一项权利要求中所述的特征或方面一般可适用于本发明的所有方面。在任一项权利要求中所述的任何单个或多个特征或方面可以结合任一项或多项其他权利要求中所述的任何其他特征或方面，或与任一项或多项其他权利要求中所述的任何其他特征或方面置换。

定义

“下一代测序”、“NGS”是一种DNA测序技术类型，其利用对来自生物样品的许多DNA小片断进行平行测序来确定基因序列。NGS可用于对基因组中的每个核苷酸，或者小部分的基因组(例如外显子或预选的基因子集)进行测序。

“玻璃”或类似术语是指适合作为基材的玻璃和玻璃陶瓷。

“包括”、“包含”或类似术语意为包括但不限于，即，内含而非排他。