[发明专利]多路复用的受体-配体相互作用筛选

说明书

本公开内容的方面涉及细胞群体，其中每个细胞包含：i)异源受体基因；ii)包含受体应答元件的诱导型报告物；其中所述报告物的表达依赖于由所述受体基因编码的受体的活性激活，并且其中所述报告物包含条形码，所述条形码包含对于异源受体基因独特的索引区；其中所述细胞表达不同异源受体，并且其中每个单一细胞表达一种特定异源受体的一个或多个拷贝和一种特定报告物的一个或多个拷贝。

对相关申请的交叉引用

本申请要求2017年7月5日提交的美国临时专利申请No.62/528,833的优先权权益，其在此通过引用完整并入。

背景

本发明在国家科学基金会授予的1555952下在政府支持下完成。政府拥有本发明的某些权利。

1.发明领域

本公开内容涉及医学和药物发现领域。

2.相关技术的描述

G蛋白偶联受体(GPCR)是最重要的药物靶标类别之一，目前市售的药物的约三分之一通过GPCR起作用。G蛋白偶联受体(GPCR)占目前药物靶标的50-60％。此种膜蛋白家族在当今的药物发现中起着至关重要的作用。经典地，已经开发了许多基于GPCR的药物用于诸如心血管、代谢、神经变性性、精神病和肿瘤疾病的不同适应症。

此外，目前有很少的(若有的话)允许在单一测定平台中有效且高效大规模筛选数千甚至数万种受体的方法。本领域中对受体和配体相互作用筛选的改善有大量需要。

发明概述

本公开内容涉及可以用于测定特异性受体激活的核酸、载体、细胞、病毒颗粒和方法。因此，某些实施方案涉及核酸，其包含i)异源受体基因；和ii)包含受体应答元件的诱导型报告物；其中报告物的表达依赖于由受体基因编码的受体的活性激活，并且其中报告物包括条形码，所述条形码包含对于异源受体基因而言独特可鉴定的索引区。其它方面涉及包含本公开内容的核酸的载体。其它方面涉及包含异源受体基因的载体。在多核苷酸的背景中，术语“异源”是指已经通过本领域已知的或本文所述的基因转移方法转移到细胞的基因或多核苷酸；若外源衍生的序列保留在后代细胞中，则此类细胞的后代也可以称为含有异源核酸序列。细胞可以已经含有与异源受体基因相同的内源基因，或者细胞可以缺乏与异源基因相关或相同的任何内源基因。术语“异源细胞”或“宿主细胞”是指有意含有异源核酸序列的细胞。

术语“编码”在其应用于多核苷酸时是指在以下情况中称为“编码”多肽的多核苷酸：若处于其天然状态或通过本领域技术人员公知的方法操作时，其可以被转录和/或翻译以产生多肽和/或其片段的mRNA。反义链是此类核酸的互补物，并且可以从其推导编码序列。

在一些实施方案中，载体还包含诱导型报告物；其中报告物的表达依赖于由受体基因编码的受体的活性激活，并且其中报告物包含条形码，该条形码包含对于异源受体基因独特的索引区。其它方面涉及载体，其包含含有条形码的诱导型报告物。