[发明专利]诊断菌群失调的方法

权利要求书

1.一种确定受试者中肠易激综合征(IBS)亚型的方法，其包括确定来自所述受试者或所述受试者的环境的样品中至少10个细菌属的丰度，其中所述至少10个细菌属选自嗜碱菌属(Alkaliphilus)、鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)、Pelotomaculum、埃格特菌属(Eggerthella)、真杆菌属(Eubacterium)、副球菌属(Paracoccus)、Lachnoclostridium、芽孢杆菌属(Bacillus)、棍状厌氧菌属(Anaerorhabdus)、放线菌属(Actinomyces)、甲基杆菌属(Methylobacterium)、假单胞菌属(Pseudomonas)、链球菌属(Streptococcus)、葡萄球菌属(Staphylococcus)、Peptoclostridium、Erysipelatoclostridium、Anaerostipes、萨顿氏菌属(Sutterella)、短波单胞菌属(Brevundimonas)、梭菌属(Clostridium)、消化链球菌科(Peptostreptococcaceae)、史雷克氏菌属(Slackia)、芽单胞菌属(Blastomonas)、乳杆菌属(Lactobacillus)、克雷伯氏菌属(Klebsiella)、土壤杆菌属(Agrobacterium)以及叶杆菌属(Phyllobacterium)。

2.根据权利要求1所述的方法，其中确定至少20个细菌属的丰度。

3.一种确定受试者中IBS亚型的方法，其包括确定来自所述受试者或所述受试者的环境的样品中至少5个细菌种的丰度，其中所述至少5个细菌种选自小克里斯滕森氏菌(Christensenella minuta)、Papillibacter cinnamivorans、沃氏嗜胆菌(Bilophilawadsworthia)、布氏瘤胃球菌(Ruminococcus bromii)、Soleaferrea massiliensis、嗜粘蛋白阿克曼氏菌(Akkermansia muciniphila)、颤杆菌(Oscillibacter valericigenes)、Desulfitobacterium frappieri、Anaerofilum pentosovorans、Lactobacillusjaponicas、Catabacter hongkongensis、球孢梭菌(Clostridium sporosphaeroides)以及普拉梭菌(Faecalibacterium prausnitzii)。

4.根据权利要求3所述的方法，其中确定至少10个细菌种的丰度。