[发明专利]产生复数候选探针和鉴定哺乳动物中细胞类型的方法在审
| 申请号: | 201880047117.1 | 申请日: | 2018-07-16 |
| 公开(公告)号: | CN111094594A | 公开(公告)日: | 2020-05-01 |
| 发明(设计)人: | 黄培瑛 | 申请(专利权)人: | 茂英基因科技股份有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886 |
| 代理公司: | 上海德昭知识产权代理有限公司 31204 | 代理人: | 郁旦蓉 |
| 地址: | 中国台湾台北市大安*** | 国省代码: | 台湾;71 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 产生 复数 候选 探针 鉴定 哺乳动物 细胞 类型 方法 | ||
1.一种产生复数候选探针的方法,用于辨识哺乳动物中细胞类型的方法,其特征在于,其包含:
步骤(a)通过侦测芯片从所述哺乳动物的标准样本中产生复数基因表现;
步骤(b)通过处理模块比较所述复数基因表现以产生比较结果;以及
步骤(c)根据所述比较结果转化出包含所述复数候选探针的矩阵,其中所述复数候选探针可以结合至任一复数多核苷酸序列选自SEQ ID No:1~652或SEQ ID No:1~652的任一片段,
其中,所述侦测芯片与所述处理模块彼此电讯连接。
2.如权利要求1所述的产生复数候选探针的方法,其特征在于:其中,所述复数候选探针的数量为200个。
3.如权利要求1所述的产生复数候选探针的方法,其特征在于:其中,所述复数候选探针的数量为100个。
4.如权利要求1所述的产生复数候选探针的方法,其特征在于:其中,所述复数候选探针的数量为50~60个。
5.如权利要求1所述的产生复数候选探针的方法,其特征在于:其中,所述复数候选探针的数量为25~35个。
6.如权利要求1所述的产生复数候选探针的方法,其特征在于:其中,所述复数探针的长度为至少15个核苷酸。
7.如权利要求1所述的产生复数候选探针的方法,其特征在于:其中,所述标准样本是一个被诊断为不患有特定疾病、失调、基因症状或上述任意的组合。
8.如权利要求1所述的产生复数候选探针的方法,其特征在于:其中,所述标准样本是一个被诊断为患有特定疾病、失调、基因症状或上述任意的组合。
9.如权利要求1所述的产生复数候选探针的方法,其特征在于:其中,所述标准样本包含血液、血浆、血清、尿液、组织、细胞、器官、体液或上述任意的组合。
10.如权利要求1所述的产生复数候选探针的方法,其特征在于:其中,所述步骤(b)不包含将所述标准样本中的所述复数基因表现与一个被诊断为患有特定疾病、失调、基因症状或上述任意的组合的受试者异常样本中的复数基因表现进行比较。
11.如权利要求1所述的产生复数候选探针的方法,其特征在于:其中,在所述步骤(c)中产生所述矩阵的方法包含:皮尔生相关系数、斯皮尔曼等级相关系数、肯德尔等级相关系数、K平均、马哈兰距离、汉明距离、莱文斯坦距离、欧几里得距离或上述任意的组合。
12.如权利要求1所述的产生复数候选探针的方法,其特征在于:其中,所述步骤(c)还包含:
步骤(c1)分析所述复数候选探针的特定序列与所述任一复数多核苷酸序列选自SEQID No:1~652或SEQ ID No:1~652的任一片段的表现量之间的相关性因子。
13.如权利要求12所述的产生复数候选探针的方法,其特征在于:其中,所述相关性因子包含结合亲和力。
14.一种鉴定哺乳动物中细胞类型的方法,其特征在于,其包含:
步骤(a')通过一个包含如权利要求1~5的任意一项中所述复数候选探针的侦测芯片侦测患有特定疾病、失调或基因病变的哺乳动物测试样本中矩阵的表现,其中所述复数候选探针可以与如权利要求1~5的任意一项中任一复数多核苷酸序列选自SEQ ID NO:1~652或SEQ ID NO:1~652的任一片段结合;
步骤(b')通过处理模块并且依据侦测的所述表现分析所述测试样本以产生测试样本分数;以及
步骤(c')通过所述处理模块且依据所述测试样本分数预测所述测试样本的细胞类型。
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