[发明专利]用于改进编索引的核酸文库中的样品鉴定的组合物和方法

权利要求书

1.一种方法，所述方法包括：

提供一种组合物，所述组合物包含：

(i)第一文库，所述第一文库包括第一多于一个多核苷酸，所述第一多于一个多核苷酸包含靶多核苷酸，第一寡核苷酸衔接子和第二寡核苷酸衔接子与所述靶多核苷酸以第一衔接子-靶-第二衔接子核苷酸序列的形式结合，其中所述第一衔接子序列和所述第二衔接子序列中的一个或两个包含文库特异性序列；

(ii)第二文库，所述第二文库包括第二多于一个多核苷酸，所述第二多于一个多核苷酸包含靶多核苷酸，第一寡核苷酸衔接子和第二寡核苷酸衔接子与所述靶多核苷酸以第一衔接子-靶-第二衔接子核苷酸序列的形式附接，其中所述第一衔接子序列和所述第二衔接子序列中的一个或两个包含文库特异性序列，其中所述第一多于一个多核苷酸的文库特异性序列与所述第二多于一个多核苷酸的文库特异性序列不同；

(iii)未附接至靶多核苷酸的第一寡核苷酸衔接子和第二寡核苷酸衔接子；和

封闭所述第一多于一个多核苷酸和所述第二多于一个多核苷酸的3’末端以及所述未附接至靶核苷酸的第一寡核苷酸衔接子和第二寡核苷酸衔接子的3’末端。

2.根据权利要求1所述的方法，其中所述封闭包括将双脱氧核苷酸通过酶掺入到所述第一多于一个多核苷酸和所述第二多于一个多核苷酸的3’末端以及所述未附接至靶多核苷酸的第一寡核苷酸衔接子和第二寡核苷酸衔接子的3’末端。

3.根据权利要求1或权利要求2所述的方法，其中所述第一多于一个多核苷酸和所述第二多于一个多核苷酸包含被配置成形成双链区域的互补部分。

4.根据权利要求3所述的方法，其中所述封闭发生在所述第一多于一个多核苷酸和所述第二多于一个多核苷酸是至少部分双链的时。

5.根据权利要求1至4中任一项所述的方法，所述方法还包括：

提供基底，所述基底具有包含多于一个附接的寡核苷酸的表面，所述附接的寡核苷酸具有游离3’末端；和

将所述基底的所述表面与包含3’封闭的第一多于一个多核苷酸和3’封闭的第二多于一个多核苷酸以及3’封闭的未附接至所述靶多核苷酸的第一寡核苷酸衔接子和第二寡核苷酸衔接子的组合物接触，

其中所述基底的所述表面与所述组合物在允许(i)附接至所述基底的所述表面的寡核苷酸和(ii)所述第一多于一个多核苷酸和所述第二多于一个多核苷酸的第一衔接子序列的互补部分杂交的条件下接触。

6.根据权利要求5所述的方法，所述方法还包括通过掺入与附接至所述基底的所述表面的寡核苷酸杂交的多核苷酸的序列互补的核苷酸，使所述寡核苷酸从所述游离3’末端延伸，以产生杂交的多核苷酸的拷贝，使得所述拷贝被附接至所述基底的所述表面。

7.根据权利要求6所述的方法，所述方法还包括扩增附接至所述基底的所述表面的所述拷贝。