[发明专利]胃癌治疗效果的预测

说明书

本发明提供了确定癌症患者，特别是胃癌患者，是否会对采用序贯治疗策略做出反应的方法，其中序贯治疗策略包括首先施用FOLFIRI方案(伊立替康/5‑氟尿嘧啶/亚叶酸)，然后单独序贯施用联合化疗药物多西紫杉醇和顺铂(FOLFIRI+多西紫杉醇/顺铂)。用SRM质谱法直接在肿瘤细胞，特别是胃癌肿瘤细胞中精确检测和定量特定的TUBB3和TYMP片段肽，肿瘤细胞从癌症患者获得的肿瘤组织中收集，并与参照水平进行比较，以确定癌症患者是否对FOLFIRI+多西紫杉醇/顺铂序贯联合治疗有积极反应。

引言

为癌症患者，特别是胃癌患者提供了改进的治疗方法，通过分析来自患者的手术切除的肿瘤组织，并确定那些最可能对标准化疗策略有反应的患者，包括(治疗方案1)施用5-氟尿嘧啶/亚叶酸(folinic acid，DeGramont)，与(治疗方案2)包括首先施用FOLFIRI方案(伊立替康/5-氟尿嘧啶/亚叶酸)，然后序贯施用多西紫杉醇/顺铂组合的方案。治疗方案1包括5FU/LV，而治疗方案2包括FOLFIRI+多西紫杉醇/顺铂。

更具体地，利用SRM质谱法测量从患者肿瘤组织中提取的肿瘤细胞中TUBB3和TYMP蛋白，然后这些测量结果用于鉴别最有可能对序贯给药FOLFIRI，随后联合多西紫杉醇/顺铂化疗药物的治疗产生反应的癌症患者，特别是胃癌患者。

TUBB3又称Ⅲ类β-微管蛋白，是细胞微管组装的重要组成部分，并且还参与调节配体结合。蛋白质组学分析表明，与半胱氨酸残基结合的许多因子都参与了氧化应激和葡萄糖剥夺反应(glucose deprivation response)。TUBB3已经被研究作为一种预后生物标记物和多西紫杉醇及其他类似紫杉烷类化合物耐药性的指标，其中有报道表明具有较高定量水平的TUBB3是一种预后不良的生物标记物。因此，测定患者癌细胞中TUBB3蛋白的定量表达水平有助于确定癌细胞对多西紫杉醇治疗的反应。

TYMP又称胸苷磷酸化酶，是一种由胸腺嘧啶合成dTMP的蛋白质，且是dTMP生物合成修复途径的一部分，它本身也是嘧啶代谢的一部分。TYMP是一种血管生成因子，在体内促进血管生成，在体外刺激多种内皮细胞的生长。正常情况下，TYMP具有高限制性的靶细胞特异性，仅作用于内皮细胞。然而，在某些情况下，TYMP可在肿瘤细胞中异常高表达。TYMP的功能是将5-dFUR转化为5FU，5FU转化为FdUM，P促进5FU抑制TS蛋白的功能，从而阻断DNA的产生，诱导肿瘤细胞凋亡。

TUBB3和TYMP是癌症患者治疗结果的预后预测因子，因此可以提供关于癌症化疗治疗策略的信息。从患者肿瘤组织中获得的患者肿瘤细胞中TUBB3和TYMP蛋白表达的存在和/或定量水平是通过使用SRM质谱法，定量从每个TUBB3和TYMP全长蛋白的子序列中提取的特定肽来确定的。通过SRM质谱法在癌症患者体内存在的癌细胞中检测到的特定量的TUBB3蛋白水平表明，患者对含多西紫杉醇的化疗方案更有可能或更不可能产生积极的反应。通过SRM质谱法在癌症患者体内存在的癌细胞中检测到的特定量的TYMP蛋白水平表明，患者对包括5FU在内的化疗方案更可能或更不可能产生积极的反应。

伊立替康，也被称为Camptosar，是一种癌症化疗药物，通过插入与DNA相互作用，从而抑制拓扑异构酶I(TOPO1)的进展，TOPO1释放DNA中的超螺旋进行转录。阿霉素在破坏DNA复制链后稳定TOPO1复合物，防止DNA双螺旋被重新封装，以终止复制过程。这会阻止癌细胞合成DNA，阻止癌细胞分裂和肿瘤生长。然而，在癌细胞中高表达的TOPO1酶可以克服伊立替康的作用，并对伊立替康的作用产生耐受，使其合成DNA，并促进细胞分裂和肿瘤生长。