[发明专利]胃癌治疗效果的预测

权利要求书

1.一种治疗癌症患者的方法，包括：

(a)在从患者获得的肿瘤组织样品所制备的蛋白质消化物中，量化特定的TUBB3片段肽的水平和量化特定的TYMP片段肽的水平，并通过使用质谱法的选择反应监测计算所述样品中TUBB3和TYMP肽的水平；

(b)将所述TUBB3片段肽的水平与TUBB3参照水平和所述TYMP片段肽的水平与TYMP参照水平进行比较，以及

(c)当TUBB3片段肽的水平低于所述TUBB3参照水平时，用包括首先施用FOLFIRI方案(伊立替康/5-氟尿嘧啶/亚叶酸)，然后单独序贯施用联合化疗药物多西紫杉醇和顺铂的治疗方案(FOLFIRI+多西紫杉醇/顺铂)治疗患者，或

(d)当TUBB3片段肽的水平高于所述TUBB3参照水平时，用包括不同治疗药物的不同的治疗方案治疗患者，所述治疗方案不同于包括首先施用FOLFIRI方案(伊立替康/5-氟尿嘧啶/亚叶酸)，然后单独序贯施用联合化疗药物多西紫杉醇和顺铂的治疗策略(FOLFIRI+多西紫杉醇/顺铂)，或

(e)当TYMP片段肽的水平高于所述TYMP参照水平时，用包括首先施用FOLFIRI方案(伊立替康/5-氟尿嘧啶/亚叶酸)，然后单独序贯施用联合化疗药物多西紫杉醇和顺铂的治疗方案(FOLFIRI+多西紫杉醇/顺铂)治疗患者，或

(f)当TUBB3片段肽的水平低于所述TYMP参照水平时，用包括不同治疗药物的不同的治疗方案治疗患者，所述治疗方案不同于首先施用FOLFIRI方案(伊立替康/5-氟尿嘧啶/亚叶酸)，然后单独序贯施用联合化疗药物多西紫杉醇和顺铂(FOLFIRI+多西紫杉醇/顺铂)。

2.根据权利要求1所述的方法，其中，所述癌症是胃癌。

3.根据权利要求1或2所述的方法，其中，所述蛋白质消化物包括蛋白酶消化物。

4.根据权利要求3所述的方法，其中，所述蛋白质消化物包括胰蛋白酶消化物。

5.根据上述权利要求中任意一项所述的方法，其中，质谱法包括串联质谱法、离子阱质谱法、三重四级杆质谱法、MALDI-TOF质谱法、MALDI质谱法、混合离子阱/四级质谱法和/或飞行时间质谱法。

6.根据权利要求5所述的方法，其中，所使用的质谱法的模式为选择反应监测(SRM)、多重反应监测(MRM)、平行反应监测(PRM)、智能选择反应监测(iSRM)和/或多重选择反应监测(mSRM)。

7.根据上述权利要求中任意一项所述的方法，其中，特定的TUBB3肽具有如SEQ ID NO:1所述的氨基酸序列。

8.根据上述权利要求中任意一项所述的方法，其中，特定的TYMP肽具有如SEQ ID NO:2所述的氨基酸序列。

9.根据上述权利要求中任意一项所述的方法，其中，肿瘤样品是细胞、细胞集合或固体组织。

10.根据权利要求9所述的方法，其中，所述肿瘤样品是福尔马林固定的固体组织。

11.根据权利要求10所述的方法，其中，所述组织是石蜡包埋的组织。

12.根据上述权利要求中任意一项所述的方法，其中，所述量化特定的TUBB3片段肽包括通过与已知量的加标内标肽进行比较来确定所述样品中TUBB3肽的量，其中，生物样品中的天然肽和内标肽都对应于相同的如SEQ ID NO:1所示的TUBB3片段肽的氨基酸序列。

13.根据上述权利要求中任意一项所述的方法，其中，所述量化特定的TYMP片段肽包括通过与已知量的加标内标肽进行比较来确定所述样品中TYMP肽的量，其中，生物样品中的天然肽和内标肽都对应于相同的如SEQ ID NO:2所示的TYMP片段肽的氨基酸序列。