[发明专利]minor BCR-ABL1基因的检测方法在审
申请号: | 201880026977.7 | 申请日: | 2018-04-25 |
公开(公告)号: | CN110546274A | 公开(公告)日: | 2019-12-06 |
发明(设计)人: | 葛城肃典;田中秀明;伊藤隆太;古贺大辅 | 申请(专利权)人: | 大塚制药株式会社 |
主分类号: | C12Q1/686 | 分类号: | C12Q1/686;C12N15/09;C12Q1/6886 |
代理公司: | 11277 北京林达刘知识产权代理事务所(普通合伙) | 代理人: | 刘新宇;李茂家<国际申请>=PCT/JP |
地址: | 日本*** | 国省代码: | 日本;JP |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 碱基序列 外显子 基因 反向引物 核酸扩增 核酸试样 正向引物 核酸 修饰 | ||
1.一种检测对象中minor BCR-ABL1基因的方法,其包括:
(1)在具有BCR基因的外显子2至14的一部分的碱基序列或与其互补的碱基序列的修饰核酸的存在下,以获得自对象的核酸试样作为模板、使用具有BCR基因的外显子1的一部分的碱基序列的正向引物、和具有与ABL1基因的外显子2至11的一部分互补的碱基序列的反向引物来进行PCR的步骤;和
(2)当通过PCR使核酸扩增时,判断对象具有minor BCR-ABL1基因的步骤。
2.根据权利要求1所述的方法,其中所述修饰核酸具有BCR基因的外显子2至13的一部分的碱基序列或与其互补的碱基序列。
3.根据权利要求1或2所述的方法,其中所述修饰核酸具有BCR基因的外显子12和13的一部分的碱基序列或与其互补的碱基序列。
4.根据权利要求1至3任一项所述的方法,其中所述修饰核酸包括约10个至约30个核苷酸。
5.根据权利要求1至4任一项所述的方法,其中所述修饰核酸包括SEQ ID NO:8的碱基序列。
6.根据权利要求1至5任一项所述的方法,其中所述修饰核酸包括PNA部分。
7.根据权利要求1至6任一项所述的方法,其中所述核酸试样为通过对获得自对象的RNA试样进行逆转录而得到的cDNA。
8.根据权利要求1至7任一项所述的方法,其中所述核酸试样为在具有与BCR基因的外显子2至14的一部分互补的碱基序列的修饰核酸的存在下,对获得自对象的RNA试样进行逆转录而得到的cDNA。
9.根据权利要求8所述的方法,其中用于逆转录的修饰核酸和用于PCR的修饰核酸具有相同的结构。
10.根据权利要求7至9任一项所述的方法,其中用于逆转录的反向引物和用于PCR的反向引物具有相同的结构。
11.根据权利要求7至10任一项所述的方法,其中逆转录和PCR在同一容器中进行。
12.根据权利要求1至11任一项所述的方法,其中PCR为定量PCR。
13.根据权利要求1至12任一项所述的方法,其中PCR为定量实时RT-PCR。
14.根据权利要求1至13任一项所述的方法,其中所述对象为人类。
15.根据权利要求1至14任一项所述的方法,其中所述核酸试样是提取自末梢血白细胞或骨髓液有核细胞的核酸试样。
16.一种用于检测对象者中minor BCR-ABL1基因的表达的试剂盒,其包括:具有BCR基因的外显子2至14的一部分的碱基序列或与其互补的碱基序列的修饰核酸、具有与ABL1基因的外显子2至11的一部分互补的碱基序列的反向引物、和具有BCR基因的外显子1的一部分的碱基序列的正向引物。
17.一种检测对象中minor BCR-ABL1基因的表达的方法,其包括以下:
(1)在具有与BCR基因的外显子2至14的一部分互补的碱基序列的修饰核酸的存在下,使用具有与ABL1基因的外显子2至11的一部分互补的碱基序列的第1反向引物对获得自对象的RNA试样进行逆转录的步骤;
(2)使用具有BCR基因的外显子1的一部分的碱基序列的正向引物以及具有与ABL1基因的外显子2至11的一部分互补的碱基序列的第2反向引物来进行PCR的步骤;和
(3)当通过PCR使核酸扩增时,判断对象表达minor BCR-ABL1基因的步骤。
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