[发明专利]将衔接子附接至样品核酸的方法在审
申请号: | 201880025117.1 | 申请日: | 2018-04-13 |
公开(公告)号: | CN110546272A | 公开(公告)日: | 2019-12-06 |
发明(设计)人: | 安德鲁·肯尼迪;斯特凡尼·安·沃德·莫蒂默 | 申请(专利权)人: | 夸登特健康公司 |
主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806 |
代理公司: | 11262 北京安信方达知识产权代理有限公司 | 代理人: | 李敏春;郑霞<国际申请>=PCT/US2 |
地址: | 美国加利*** | 国省代码: | 美国;US |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 衔接子 平端 核酸分子 连接效率 双链核酸分子 单核苷酸 模板指导 双链核酸 测序 单链 核酸 扩增 制备 成功 | ||
1.一种制备用于分析的核酸的方法,所述方法包括:
(a)通过提供5'-3'聚合酶活性和3'-5'校正活性的一种或更多种酶以及四种标准类型核苷酸的作用,使样品中具有单链突出端的双链核酸平端化,其中伴随在5'末端的单链突出端用作通过所述聚合酶活性延伸互补链的模板,并且伴随在3'末端的单链突出端被产生平端核酸的所述校正活性消化;
(b)在不将所述平端核酸与所述样品的其他组分分离的情况下,通过无3'-5'校正功能的聚合酶的作用对所述平端核酸进行末端加尾,所述无3'-5'校正功能的聚合酶进行核苷酸向所述平端核酸的3'末端的非模板指导的添加,其中A优先于G被添加,G优先于C或T被添加;
(c)使来自步骤(c)的核酸与在3'末端具有单核苷酸T或C突出端的至少部分双链的衔接子退火;以及
(d)将所述核酸连接至所述衔接子。
2.如权利要求1所述的方法,所述方法还包括在步骤(a)之后将所述一种或更多种酶变性。
3.如权利要求1或2所述的方法,所述方法还包括使所述样品与所述一种或更多种酶、所述四种标准类型核苷酸和所述无3'-5'校正功能的聚合酶接触。
4.如权利要求3所述的方法,其中所述样品与所述一种或更多种酶、所述四种标准类型核苷酸和所述无3'-5'校正功能的聚合酶一起接触。
5.如任一前述权利要求所述的方法,其中步骤(b)在比步骤(a)更高的温度进行。
6.如权利要求5所述的方法,其中步骤(a)在环境温度进行,并且步骤(b)在超过60℃的温度进行。
7.如任一前述权利要求所述的方法,其中所述一种或更多种酶是具有5'-3'聚合酶活性和3'-5'校正活性的聚合酶。
8.如任一前述权利要求所述的方法,其中所述无3'-5'校正功能的聚合酶是热稳定聚合酶,并且所述方法还包括在步骤(a)之后升高所述样品的温度,以使所述具有5'-3'聚合酶活性和3'-5'校正活性的聚合酶失活。
9.如任一前述权利要求所述的方法,所述方法还包括(e)扩增连接至所述衔接子的所述核酸;和(f)分析所述核酸。
10.如任一前述权利要求所述的方法,所述方法还包括使所述样品与至少部分双链的平端衔接子接触,所述至少部分双链的平端衔接子在连接步骤中与平端双链核酸连接,所述平端双链核酸未经历核苷酸向3'末端的非模板指导的添加。
11.如权利要求7所述的方法,其中所述具有5'-3'聚合酶活性和3'-5'校正活性的聚合酶是T4聚合酶或Klenow大片段。
12.如任一前述权利要求所述的方法,其中所述无3'-5'校正功能的聚合酶是Taq聚合酶。
13.如任一前述权利要求所述的方法,其中至少步骤(a)-步骤(d)在单个管中进行。
14.如任一前述权利要求所述的方法,其中对于至少步骤(a)-步骤(d),没有组分被从所述样品中去除。
15.如权利要求9所述的方法,其中步骤(a)-步骤(e)在单个管中进行。
16.如任一前述权利要求所述的方法,其中具有单核苷酸T的至少部分双链的衔接子与具有单核苷酸C的至少部分双链的衔接子的摩尔比为4:1至2:1。
17.如权利要求16所述的方法,其中平端衔接子与加尾的衔接子的摩尔比为1:5至1:500。
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