[发明专利]cfRNA的液体活检

权利要求书

1.一种预测患有癌症的个体对检查点抑制剂治疗的治疗反应的方法，该方法包括：

从该个体获得血液并从该血液中分离cfRNA，其中该cfRNA编码检查点抑制基因；

使用定量PCR方法对该cfRNA进行定量；以及

当该cfRNA的量高于阈值水平时预测阳性治疗反应。

2.如权利要求1所述的方法，其中该检查点抑制剂是针对PD1或PD-L1的抗体，并且其中该cfRNA是PD-L1 cfRNA。

3.如权利要求1所述的方法，其中该分离cfRNA的步骤使用RNA稳定化和细胞保存。

4.如权利要求1所述的方法，其中该定量PCR方法包括实时PCR。

5.如权利要求1所述的方法，其中该定量步骤使用β-肌动蛋白作为内标。

6.如权利要求1所述的方法，其中PD-L1相对于β-肌动蛋白而言，阈值水平为ΔΔCT>10。

7.如权利要求1所述的方法，该方法进一步包括使用该定量PCR方法对至少第二cfRNA进行定量的步骤。

8.如权利要求7所述的方法，其中该至少第二cfRNA编码TIM3或LAG3。

9.如权利要求1所述的方法，该方法进一步包括对至少第二cfRNA进行定量的步骤，其中该至少第二cfRNA编码具有肿瘤和患者特异性突变的基因、肿瘤相关基因或癌症特异性基因。

10.一种监测患有癌症的个体的治疗的方法，该方法包括：

从该个体获得血液并从该血液中分离cfRNA，其中该cfRNA编码检查点抑制基因，或者其中该cfRNA编码肿瘤相关基因或癌症特异性基因，或者其中该cfRNA编码具有肿瘤和患者特异性突变的基因；

使用定量PCR方法对该cfRNA进行定量；以及

使用该cfRNA的量更新患者记录。

11.如权利要求10所述的方法，其中该检查点抑制基因是PD-L1、TIM3或LAG3。

12.如权利要求10所述的方法，其中该肿瘤相关基因或癌症特异性基因是CEA、MUC1、brachyury、HER2、PCA3或AR-V7。

13.如权利要求10所述的方法，其中该具有肿瘤和患者特异性突变的基因编码新表位。

14.如权利要求10所述的方法，其中该分离cfRNA的步骤使用RNA稳定化和细胞保存。

15.如权利要求10所述的方法，其中该定量PCR方法包括实时PCR。

16.如权利要求10所述的方法，其中该定量步骤使用β-肌动蛋白作为内标。

17.如权利要求10所述的方法，其中当HER2相对于β-肌动蛋白而言cfRNA的量为ΔΔCT>5，或PCA3相对于β-肌动蛋白而言cfRNA的量为ΔΔCT>10时，更新该患者记录。

18.一种检测前列腺癌的方法，该方法包括：

从个体获得血液并从该血液中分离cfRNA，其中该cfRNA编码PCA3、或雄激素受体的剪接变体7；

使用定量PCR方法对该cfRNA进行定量；以及

当该cfRNA量高于阈值水平时，将该个体诊断为患有癌症。

19.如权利要求18所述的方法，其中当PCA3 cfRNA的量相对于β-肌动蛋白而言为ΔΔCT>10时，将该个体诊断为患有癌症。