[发明专利]一种血清胰腺癌外泌体特异蛋白及其再验证过程在审
申请号: | 201811643412.1 | 申请日: | 2018-12-29 |
公开(公告)号: | CN109856259A | 公开(公告)日: | 2019-06-07 |
发明(设计)人: | 肖明兵;陈晓阳;季洁;瞿利帅;刘金霞;焦钰洁;江枫;钱坤艳;纪易斐 | 申请(专利权)人: | 南通大学附属医院 |
主分类号: | G01N30/02 | 分类号: | G01N30/02 |
代理公司: | 北京科家知识产权代理事务所(普通合伙) 11427 | 代理人: | 徐思波 |
地址: | 226019*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 蛋白 血清 胰腺癌 验证过程 制备 蛋白质印迹分析 透射电子显微镜 标志物蛋白 诊断胰腺癌 超微结构 分离血清 高通量 体表面 无干扰 小分子 异构体 检测 检查 | ||
1.一种血清胰腺癌外泌体特异蛋白,其特征在于,包括蛋白ADAM10、蛋白CFHR1、蛋白APOA4、蛋白Testicular tissue protein Li 70、蛋白HEL-S-78p、蛋白PGLYRP2、蛋白IGFALS、蛋白BCHE、蛋白ANPEP、蛋白LBP、蛋白C9、蛋白PZP、蛋白ANXA11。
2.一种根据权利要求1所述的血清胰腺癌外泌体特异蛋白的再验证过程,其特征在于,包括以下步骤:S1、分离血清样品中的无外泌体血清与外泌体;S2、采用步骤S1分离得到的外泌体,制备出外泌体PBS溶液;S3、通过透射电子显微镜来检查外泌体的超微结构;S4、通过蛋白质印迹分析来检测一些外泌体表面标志物蛋白的表达。
3.根据权利要求2所述的一种血清胰腺癌外泌体特异蛋白的再验证过程,其特征在于,所述步骤S1、分离血清样品中的无外泌体血清与外泌体,具体包括以下过程:将血清样品解冻并在4℃下以小高速离心机10000g离心30分钟,从而除去样品中的非外泌体微泡;将去除非外泌体微泡后的上清液以小高速离心机110000g离心70分钟后,将无外泌体血清分离至另一试管保存待检,外泌体沉淀重悬于4ml PBS中。
4.根据权利要求2所述的一种血清胰腺癌外泌体特异蛋白的再验证过程,其特征在于,所述步骤S2、制备出外泌体PBS溶液,具体包括以下过程:将步骤S1所得的外泌体重悬液在4℃下以小高速离心机110000g超速离心70分钟,使悬浮液中外泌体沉淀;将最终的外泌体沉淀重悬于200μl的PBS中,得到外泌体PBS溶液。
5.根据权利要求2所述的一种血清胰腺癌外泌体特异蛋白的再验证过程,其特征在于,所述步骤S4、蛋白质印迹分析来检测一些外泌体表面标志物蛋白的表达过程,包括以下步骤:(1)蛋白定量;(2)胰酶酶解;(3)液相色谱-质谱联用分析;(4)数据处理;
其中,所述步骤(1)蛋白定量的过程,使用BCA试剂盒进行蛋白浓度测定;
其中,所述步骤(2)胰酶酶解,具体包括以下过程:蛋白溶液中加入二硫苏糖醇使其终浓度为5mM,56℃还原30min;之后加入碘代乙酰胺使其终浓度为11mM,室温避光孵育15min;最后将样品的尿素浓度稀释至低于2M;以胰酶:蛋白之比为1:50的质量比例加入胰酶,37℃酶解过夜;再以胰酶:蛋白之比1:100的质量比例加入胰酶,继续酶解4h;
其中,所述步骤(3)液相色谱-质谱联用分析,具体包括以下过程:a、肽段用液相色谱流动相A相溶解后使用EASY-nLC 1000超高效液相系统进行分离;流动相A为含0.1%甲酸和2%乙腈的水溶液;流动相B为含0.1%甲酸和90%乙腈的水溶液;液相梯度设置:0~40min,7%-25%B;40~52min,25%-35%B;52~56min,35%-80%B;56~60min,80%B,流速维持在450nL/min;b、肽段经由超高效液相系统分离后被注入NSI离子源中进行电离然后进QExactiveTM Plus质谱进行分析;离子源电压设置为2.0kV,肽段母离子及其二级碎片都使用高分辨的Orbitrap进行检测和分析;一级质谱扫描范围设置为350~950m/z,扫描分辨率设置为70,000;二级质谱Orbitrap扫描分辨率设置为17500;c、数据采集模式使用数据非依赖型扫描程序,HCD碰撞池的碎裂能量设置为27;一级质谱自动增益控制设置为3E6,最大离子注入时间设置为50ms;二级质谱自动增益控制设置为1E5,最大离子注入时间设置为150ms,隔离窗口设置为1.6m/z;
其中,所述步骤(4)数据处理,具体包括以下过程:肽段参数:蛋白酶设置为Trypsin,最大漏切位点数设置为0,肽段长度设置为7~25个氨基酸残基,设置半胱氨酸烷基化为固定修饰;Transition参数:母离子电荷设置为2、3,子离子电荷设置为1,离子类型设置为b、y;碎片离子选择从第三个开始到最后一个,离子匹配的质量误差容忍度设置为0.02Da。
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