[发明专利]SCA基因突变检测的引物、试剂盒及方法

说明书

本发明涉及脊髓小脑共济失调基因测序诊断领域，具体而言，涉及一种SCA基因突变检测的引物、试剂盒及方法。本发明所提供的引物、试剂盒结合三代测序方法，可有效对SCA 1、2、3、6、7、8、12、17型基因的重复序列动态突变和/或中断重复进行检测。

技术领域

本发明涉及脊髓小脑共济失调基因测序诊断领域，具体而言，涉及一种SCA基因突变检测的引物、试剂盒及方法。

背景技术

脊髓小脑性共济失调(spinocerebellar ataxia，SCA)是一种最常见的神经系统遗传病，约占神经系统遗传性疾病的10％-15％^[1]，发病率约为3/10万。在临床医学各科室的遗传病中，以神经系统遗传病的病种最多，病因最复杂、异质性也最高，约占所有遗传病的60％以上。该系统的神经系统疾病是由三核苷酸或五核苷酸动态突变扩展引起的，多呈常染色体显性遗传，其病理改变主要是脊髓、小脑和脑干的神经元变性脱失与胶质增生^[2-3]，临床表现为小脑共济失调伴构音障碍、意向性震颤、锥体系及锥体外系症状等，具有极强的遗传异质性和基因多效性，还可累及脊神经、颅神经、交感神经、大脑皮质等^[4]。

根据该疾病的临床特点及其基因定位可分为SCA1-30，共30多种亚型，且大部分致病基因已得到克隆。其中SCA1/2/3/6/7/8/12/17亚型为常见的致病基因类型，多为其编码区CAG三核苷酸重复序列扩增突变异常增多导致^[5]。各亚型间具有高度临床异质性，临床表现复杂，易与其他神经系统疾病混淆，各亚型之间SCA的临床表现重叠，只依据临床表现较难对其做出明确诊断及分型。目前可通过PCR技术结合毛细管电泳或测序进行基因突变检测来明确诊断，如内中日友好医院、华西医科大学等均是通过PCR技术结合毛细管电泳或测序证实脊髓小脑共济失调的亚型。目前，国内外基因诊断技术日趋成熟，特别是毛细管电泳片段长度分析检测方便、经济，亦可较准确地检测计算出CAG重复数，不仅可以为动态突变的遗传性疾病提供可靠的基因诊断^[6]，而且也可用于大批量标本的检测。

据报道脊髓小脑共济失调病例中，SCA3是最常见的亚型，其次为SCA1/2/6/7/8/12/17。SCA各个亚型的发病率在不同国家不同地区甚至是不同人群的发病率亦有差别^[5,7]，我国目前报道的SCA病例中，SCA3亚型最为常见，占54.6-72.5％，其次为SCA2(5.7-6.7％)，SCA1(5.9％)，SCA6(1.6-3.3％)，SCA7(0.8-4.8％)^[8]。

总体而言，SCA3、SCA2及SCA1为我国常见亚型。目前，诊断该病主要依据基因检测，明确致病基因CAG三碱基的重复数来确诊，因此界定SCA相关基因CAG的重复数/范围对疾病的诊断及分型具有重大意义。

有鉴于此，特提出本发明。

附：参考文献

[1]蔡美英,兰风华.遗传性共济失调的分子病理学研究进展[J].解放军医学杂志,2008(05):624-625.

[2]Martindale J E.Diagnosis of Spinocerebellar Ataxias Caused byTrinucleotide Repeat Expansions[J].Curr Protoc Hum Genet,2017,92:9-30.

[3]Orr H T,Zoghbi H Y.Trinucleotide repeat disorders[J].Annu RevNeurosci,2007,30:575-621.