[发明专利]SCA基因突变检测的引物、试剂盒及方法在审
| 申请号: | 201811641191.4 | 申请日: | 2018-12-29 |
| 公开(公告)号: | CN111378653A | 公开(公告)日: | 2020-07-07 |
| 发明(设计)人: | 高玉梅;贺希文;郎娜;梁帆;王洋;汪德鹏 | 申请(专利权)人: | 北京希望组生物科技有限公司 |
| 主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/6883;C12Q1/6858 |
| 代理公司: | 北京超凡志成知识产权代理事务所(普通合伙) 11371 | 代理人: | 孙海杰 |
| 地址: | 102200 北京市昌平区*** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | sca 基因突变 检测 引物 试剂盒 方法 | ||
1.一种引物对组合产品,其选自下列引物对中的至少一对:
SEQ ID NO:1和2、SEQ ID NO:3和4、SEQ ID NO:5和6、SEQ ID NO:7和8、SEQ ID NO:9和10、SEQ ID NO:11和12、SEQ ID NO:13和14、SEQ ID NO:15和16。
2.根据权利要求1所述的引物对组合产品,其中的部分或全部引物连接有barcode序列,以在扩增时用于区分不同样品。
3.一种试剂盒,其包含权利要求1或2所述的引物对组合产品。
4.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括基因组DNA提取体系、PCR反应缓冲液、无核酸酶的水、DNA聚合酶、分子量marker中的一种或多种;
优选的,所述DNA聚合酶选自Taq、Bst、Vent、Phi29、Pfu、Tru、Tth、Tl1、Tac、Tne、Tma、Tih、Tf1、Pwo、Kod、Sac、Sso、Poc、Pab、Mth、Pho、ES4 DNA聚合酶、Klenow片段中的任一种。
5.根据权利要求3或4任一项所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒中还包括末端修复酶、末端修复缓冲液、扩增或连接接头、接头链接缓冲液、DNA连接酶中的一种或多种。
6.组合物,其含有使用权利要求1或2所述的引物对组合产品、或权利要求3~5任一项所述的试剂盒扩增人DNA模板所得到的扩增子。
7.根据权利要求6所述的组合物,所述人DNA模板来自人的血液、血浆、细胞培养上清、唾液、精液、组织(例如羊水或绒毛)、组织裂解液、骨骼或毛发。
8.一种检测SCA基因重复序列动态突变和/或中断重复的非诊断目的方法,其特征在于,包括:
a)制备权利要求6或7所述的组合物;以及
b)用三代测序平台对扩增产物进行检测;
优选的,在进行三代测序时,对所述组合物中的扩增子的两端进行末端修复,再向经过末端修复的DNA两端连接扩增接头以构建三代测序的文库模型并上机测序。
9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,将三代测序的文库模型进行纯化后再上机测序。
10.权利要求1或2所述的引物对组合产品、或权利要求3~5所述的试剂盒在制备脊髓小脑性共济失调的诊断剂中的应用。
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