[发明专利]利用CRISPR-Cas9系统制得基因点突变动物模型胚胎的靶序列组、载体和方法有效
申请号: | 201811640522.2 | 申请日: | 2018-12-29 |
公开(公告)号: | CN109679953B | 公开(公告)日: | 2022-08-16 |
发明(设计)人: | 黎肖容;郑生华;陈清清;毛润媛;喻潇 | 申请(专利权)人: | 广州赛业百沐生物科技有限公司 |
主分类号: | C12N15/113 | 分类号: | C12N15/113;C12N15/85;C12N15/90;A01K67/027 |
代理公司: | 广州容大知识产权代理事务所(普通合伙) 44326 | 代理人: | 刘新年 |
地址: | 510663 广东省广州市黄埔区神舟*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 利用 crispr cas9 系统 基因 突变 动物 模型 胚胎 序列 载体 方法 | ||
1.一种非诊断和治疗目的地利用CRISPR-Cas9系统制备Nedd8基因点突变小鼠模型胚胎的方法,其特征在于,所述方法包括:
步骤1.小鼠Nedd8基因的sgRNA设计,包括:
步骤1.1在NCBI的数据库中提取小鼠Nedd8基因ATG的上游和下游各50bp的序列,如下所示,设计靶标位点:
agcgggagaagcagcactctagccgcctgcaaccccaacctgggaagaagatgctaattaaagtgaaggtgggagcgtttccagactttccaagactcggtgc,得到包含ATG的gRNA对:
pair4-g7:ttaattagcatcttcttcccagg;
pair4-g8:gaagatgctaattaaagtgaagg;
具体序列如SEQ ID NO:7和SEQ ID NO:8所示;
步骤1.2在NCBI的数据库中提取小鼠Nedd8基因K27的上游和下游各50bp的序列,如下所示,设计靶标位点:
taattctaagcagcctctgaccacttgtttctccaaaggtggagcgaatcaaggagcgtgtggaagaaaaagaagggattcccccccagcagcagcggctcat,得到包含K27的gRNA对:
pair9-g17:tccttgattcgctccacctttgg;
pair10-g20:ggagcgaatcaaggagcgtgtgg;
具体序列如SEQ ID NO:17和SEQ ID NO:20所示;
步骤2.Donor oligo设计包括:
步骤2.1以Nedd8基因的N端为靶点,两端各60bp为同源臂,下划线处序列为HA序列,加粗字体序列为Flag序列,设计Donor oligo序列并合成:
Donor oligo 1:
cgaccacagcgggagaagcagcactctagccgcctgcaaccccaacctgggaagaagatg
步骤2.2以Nedd8基因的K27为靶点,突变点K27R(AAGCGT),两端各60bp为同源臂,下划线加粗字体为突变序列,设计Donor oligo序列并合成:
Donor oligo 2:
agtatttgtctaattctaagcagcctctgaccacttgtttctccaaaggtggagcgaatccgtgagcgtgtggaagaaaaagaagggattcccccccagcagcagcggctcatctacagtggc;
步骤3.构建可表达sgRNA的Cas9-D10A质粒;
步骤3.1合成上述包含ATG的gRNA对和包含K27的gRNA对靶序列引物:
Pair4-g7-F:caccgttaattagcatcttcttccc;
Pair4-g7-R:aaacgggaagaagatgctaattaac;
Pair4-g8-F:caccggaagatgctaattaaagtga;
Pair4-g8-R:aaactcactttaattagcatcttcc;
Pair9-g17-F:caccgtccttgattcgctccacctt;
Pair9-g17-R:aaacaaggtggagcgaatcaaggac;
Pair10-g20-F:caccgggagcgaatcaaggagcgtg;
Pair10-g20-R:aaaccacgctccttgattcgctccc;
步骤3.2将各对gRNA对靶序列上下游引物退火获得带粘性末端的双链DNA片段,连入经BbsI酶切的pX335-Bsal载体中,测序验证;
步骤4.体外转录sgRNA和Cas9-D10A mRNA;
步骤5.原核注射,包括:
将预混好的Cas9-D10A mRNA和Donor oligo序列的混合物直接注入单细胞受精卵的一细胞的胞浆内,调整合适的注射量,以溶液明显流入胞浆而不至于导致细胞死亡为止;等受精卵发育成二细胞,把预混好的sgRNA混合物直接注入二细胞中;注射后将受精卵放置在含SCR7的KSOM培养基内培养。
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