[发明专利]VQRn-Cas9&PmCDA1&UGI碱基编辑系统在植物基因编辑中的应用在审
申请号: | 201811619487.6 | 申请日: | 2018-12-28 |
公开(公告)号: | CN109652440A | 公开(公告)日: | 2019-04-19 |
发明(设计)人: | 杨进孝;张成伟;徐雯;王飞鹏;赵思 | 申请(专利权)人: | 北京市农林科学院 |
主分类号: | C12N15/82 | 分类号: | C12N15/82;C12N15/10;C12N9/22;C12N9/78;C12N15/55;A01H5/00;A01H6/46 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 关畅;魏少伟 |
地址: | 100097 北京市海淀区曙*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 编辑系统 碱基 靶点序列 植物基因 替换 应用 转录 | ||
1.成套试剂,由M1、M2、M3和M4组成:
M1、VQRn-Cas9或与所述VQRn-Cas9相关的生物材料;
M2、PmCDA1或与所述PmCDA1相关的生物材料;
M3、UGI或与所述UGI相关的生物材料;
M4、如式I所示的sgRNA或与式I所示sgRNA相关的生物材料;
靶点序列转录的RNA-sgRNA骨架
(式I)
所述sgRNA骨架为将序列1的第571-646位或序列7中的T替换为U得到的RNA;
与式I所示sgRNA相关的生物材料,为下述G1)至G5)中的任一种:
G1)转录式I所示的sgRNA的核酸分子;
G2)含有G1)所述核酸分子的表达盒;
G3)含有G1)所述核酸分子的重组载体、或含有G2)所述表达盒的重组载体;
G4)含有G1)所述核酸分子的重组微生物、或含有G2)所述表达盒的重组微生物、或含有G3)所述重组载体的重组微生物;
G5)含有G1)所述核酸分子的转基因细胞系、或含有G2)所述表达盒的转基因细胞系。
2.根据权利要求1所述的成套试剂,其特征在于:
所述VQRn-Cas9为如下A1)、A2)或A3):
A1)氨基酸序列是序列3的蛋白质;
A2)将序列表中序列3所示的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且具有相同功能的蛋白质;
A3)在A1)或A2)的N端或/和C端连接标签得到的融合蛋白质;
与所述VQRn-Cas9相关的生物材料,为下述B1)至B5)中的任一种:
B1)编码所述VQRn-Cas9的核酸分子;
B2)含有B1)所述核酸分子的表达盒;
B3)含有B1)所述核酸分子的重组载体、或含有B2)所述表达盒的重组载体;
B4)含有B1)所述核酸分子的重组微生物、或含有B2)所述表达盒的重组微生物、或含有B3)所述重组载体的重组微生物;
B5)含有B1)所述核酸分子的转基因细胞系、或含有B2)所述表达盒的转基因细胞系;
所述PmCDA1为如下C1)、C2)或C3):
C1)氨基酸序列是序列4的蛋白质;
C2)将序列表中序列4所示的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且具有相同功能的蛋白质;
C3)在C1)或C2)的N端或/和C端连接标签得到的融合蛋白质;
与所述PmCDA1相关的生物材料,为下述D1)至D5)中的任一种:
D1)编码所述PmCDA1的核酸分子;
D2)含有D1)所述核酸分子的表达盒;
D3)含有D1)所述核酸分子的重组载体、或含有D2)所述表达盒的重组载体;
D4)含有D1)所述核酸分子的重组微生物、或含有D2)所述表达盒的重组微生物、或含有D3)所述重组载体的重组微生物;
D5)含有D1)所述核酸分子的转基因细胞系、或含有D2)所述表达盒的转基因细胞系;
所述UGI为如下E1)、E2)或E3):
E1)氨基酸序列是序列5的蛋白质;
E2)将序列表中序列5所示的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且具有相同功能的蛋白质;
E3)在E1)或E2)的N端或/和C端连接标签得到的融合蛋白质;
与所述UGI相关的生物材料,为下述F1)至F5)中的任一种:
F1)编码所述UGI的核酸分子;
F2)含有F1)所述核酸分子的表达盒;
F3)含有F1)所述核酸分子的重组载体、或含有F2)所述表达盒的重组载体;
F4)含有F1)所述核酸分子的重组微生物、或含有F2)所述表达盒的重组微生物、或含有F3)所述重组载体的重组微生物;
F5)含有F1)所述核酸分子的转基因细胞系、或含有F2)所述表达盒的转基因细胞系。
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