[发明专利]用于鉴别中华穿山甲和家猪蹄甲炮制甲片的DNA微型条形码引物在审
| 申请号: | 201811559808.8 | 申请日: | 2018-12-20 | 
| 公开(公告)号: | CN109486965A | 公开(公告)日: | 2019-03-19 | 
| 发明(设计)人: | 杨帆;李海峰;陈宏;孙敬;张瑾 | 申请(专利权)人: | 公安部物证鉴定中心 | 
| 主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6806;C12N15/11 | 
| 代理公司: | 广州胜沃园专利代理有限公司 44416 | 代理人: | 徐翔 | 
| 地址: | 100038 *** | 国省代码: | 北京;11 | 
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 微型条形码 穿山甲 甲片 猪蹄甲 鉴别 炮制 引物 测序 分子生物学领域 基因组DNA 基因片段 特异性强 引物扩增 系统树 构建 扩增 成功率 应用 | ||
1.用于鉴别中华穿山甲和家猪蹄甲炮制甲片的DNA微型条形码引物,其特征在于,包括特异性的COI-L 191引物对和特异性的COI-L 197引物对,其中,特异性COI-L 191引物对包括COI-L191-F上游引物和COI-L191-R下游引物,所述COI-L 197引物对包括COI-L197-F上游引物和COI-L197-R下游引物,上述引物的核苷酸序列分别为:
COI-L191-F上游引物:5'-AAAAAGGTTGTRTTYAGGTTGCG-3',
COI-L191-R下游引物:5'-AAATTAATAGCCCCTAGRATTGA-3';
COI-L197-F上游引物:5'-AAATTAATAGCCCCTAGRATTGA-3',
COI-L197-R下游引物:5'-AGTAGTCAGAAACTTATGTT-3'。
2.一种如权利要求1所述的用于鉴别中华穿山甲和家猪蹄甲炮制甲片的DNA微型条形码引物在鉴别中华穿山甲和家猪蹄甲炮制甲片中的应用,其特征在于,包括以下步骤:
S1、基于中华穿山甲和家猪的COI基因,设计特异性微型引物,得特异性COI-L191引物对,COI-L 197引物对;
S2、提取中华穿山甲和家猪蹄甲炮制甲片样品DNA,测定DNA的浓度与纯度,得高质量的全基因组DNA;
S3、以步骤S2所得高质量的全基因组DNA为模板,利用步骤S1所得特异性COI-L 191引物对或COI-L 197引物对,进行PCR扩增,得COI基因片段;
S4、将步骤S3所得COI基因片段利用琼脂糖凝胶电泳检测,然后进行双向测序,将测序结果利用Blast和NJ系统树比对,即可。
3.如权利要求2所述的DNA微型条形码引物在鉴别中华穿山甲和家猪蹄甲炮制甲片中的应用,其特征在于:所述步骤S2中提取中华穿山甲和家猪蹄甲炮制甲片样品DNA的具体操作为:
(1)取30-100mg炮制甲片样品,用体积分数为75%的乙醇水溶液除去表面杂质,剪碎后加入炮制甲片样品体积6倍的裂解缓冲液,得裂解液样品;
(2)向步骤(1)所得裂解液样品中加入10-30mg/mL蛋白酶K溶液,混匀,于50℃-60℃条件下放置2-4h,得混合液I;
(3)向步骤(2)所得混合液I中加入200μL体积分数为0.5%-1.0%的十二烷基硫酸钠水溶液,混匀,于50℃-75℃条件下放置30-60min,加入200μL无水乙醇,充分振荡混匀10-30s,得带絮状沉淀的混合液;
(4)将步骤(3)所得带絮状沉淀的混合液加入硅胶膜吸附柱中,离心20-40s后弃掉废液,向吸附柱中加入500μL缓冲液,离心20-40s,弃掉废液,向吸附柱中加入600μL体积分数为70%的乙醇水溶液,离心20-40s后弃掉废液,再次离心1-4min后弃掉废液,静置1-5min,得絮状沉淀;
(5)向步骤(4)所得絮状沉淀中加入50-200μL 10-200mM Tris-HCl缓冲液,室温放置1-5min后离心1-4min,即得。
4.如权利要求2所述的DNA微型条形码引物在鉴别中华穿山甲和家猪蹄甲炮制甲片中的应用,其特征在于,所述步骤(1)中的裂解缓冲液由10-200mM Tris-HCl和25-100mM EDTA组成。
5.如权利要求2所述的DNA微型条形码引物在鉴别中华穿山甲和家猪蹄甲炮制甲片中的应用,其特征在于,所述步骤(4),步骤(5)中的离心条件为10000rpm-14000rpm。
6.如权利要求2所述的DNA微型条形码引物在鉴别中华穿山甲和家猪蹄甲炮制甲片中的应用,其特征在于:所述步骤S2中测定DNA浓度是采用紫外分光光度计或酶标仪检测DNA溶液在260nm处的吸光值;所述测定DNA纯度是采用紫外分光光度计或酶标仪检测DNA溶液在260nm和280nm处的吸光值。
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