[发明专利]一种TOP2A基因的FISH探针的制备方法有效
申请号: | 201811558044.0 | 申请日: | 2018-12-19 |
公开(公告)号: | CN109609631B | 公开(公告)日: | 2020-01-24 |
发明(设计)人: | 许嘉森;吴诗扬;刘志明;朱蓉 | 申请(专利权)人: | 益善生物技术股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6841;C12Q1/6806;C12N15/10;C40B50/06 |
代理公司: | 44416 广州科沃园专利代理有限公司 | 代理人: | 徐翔 |
地址: | 510663 广东省广州市高新技术产业开*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 制备 探针 生物化学领域 生物化学 方法使用 检测领域 探针文库 不对称 灵敏度 扩增 酶切 打断 | ||
1.一种TOP2A基因的FISH探针文库的制备方法,其特征在于:所述的制备方法包括以下步骤:
(1)制备得到探针1;
(2)酶切打断步骤(1)获得的探针1,得到探针2;
(3)给步骤(2)获得的探针2添加接头,得到探针3;
(4)对步骤(3)获得的探针3进行不对称扩增,得到FISH探针文库;
所述的步骤(1)中的探针1为探针1A和探针1B;
所述的探针1A为针对TOP2A的基因的一条探针;
所述的探针1B为针对人类17号染色体着丝粒区域的一条探针;
所述的探针1A为1ng/μL的BAC克隆RP11-885J9;
所述的探针1B为1ng/μL的BAC克隆RP11-25J2;
所述步骤(2)中酶切打断所使用的酶为限制性内切酶混合液,所述的限制性内切酶混合液包括10000U/mLAluI、5000U/mLHpyCH4V、10000U/mLMluCI和10000U/mLBfaI,其体积比为1:2:0.5:0.4;
所述的步骤(3)中添加接头的方法为:通过T4 DNA连接酶将探针2和接头序列连接;
所述的接头序列为A1接头和A2接头,其中A2接头5’端第一个碱基C含有磷酸化修饰:
所述的A1接头的核苷酸序列为SEQ ID NO:1所示的序列:
5’-CCTCTGTATGCGCATCCTGTGAT-3’;
所述的A2接头的核苷酸序列为SEQ ID NO:2所示的序列:
5’-CCATCACATCTCTGAGTGTCTCCGA-3’;
所述的步骤(4)中不对称扩增的体系包括:dNTP、aminoallyl-dUTP、Epimark HotstratTaq DNA polymerase、引物和探针3;
所述的引物为:
正向引物的核苷酸序列为SEQ ID NO:3所示的序列:
5’-CCTCTGTATGCGCATCCTGTGAT-3’;
负向引物的核苷酸序列为SEQ ID NO:4所示的序列:
5’-TCGGAGACACTCAGAGATGTGATGG-3’;
所述的dNTP和aminoallyl-dUTP的摩尔比为4:1;
所述的dNTP中的dTTP和aminoallyl-dUTP的摩尔比为1:4;
所述的正向引物和负向引物的浓度分别为1μM和20μM。
2.一种TOP2A基因的FISH探针文库,其特征在于:所述的FISH探针文库采用权利要求1所述的制备方法构建而成。
3.一种用于检测TOP2A基因异常的试剂盒,其特征在于:所述的试剂盒包含权利要求2所述的探针文库。
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