[发明专利]用于预测直肠癌局部切除手术后复发风险的组合物、微阵列和计算机系统

权利要求书

1.一种用于预测中国人群中直肠癌局部切除手术后复发风险的组合物，其由特异性结合至WDR43、RAB31、FASN、TYMS、SNX2、DAP3、MRPS18C、FANCL、CIDECP、HNRNPH1和CMSS1基因的部分连续序列的寡核苷酸组成，其中所述寡核苷酸的序列如SEQ ID NO:1-33所示。

2.根据权利要求1所述的用于预测中国人群中直肠癌局部切除手术后复发风险的组合物，其中所述寡核苷酸被设计为能够将其一末端固定结合至基材，且至少部分序列能够特异性结合至WDR43、RAB31、FASN、TYMS、SNX2、DAP3、MRPS18C、FANCL、CIDECP、HNRNPH1和CMSS1基因的部分连续序列，从而能够在样品中捕获所需的基因。

3.一种用于预测中国人群中直肠癌局部切除手术后复发风险的微阵列，其包括根据权利要求1或2所述的组合物和基材，所述基材的表面具有多个相互独立设置的多个位点。

4.根据权利要求3所述的用于预测中国人群中直肠癌局部切除手术后复发风险的微阵列，其中各位点分别具有能够与所述寡核苷酸结合的反应性官能团；或者各位点分别结合所述寡核苷酸中的一种。

5.根据权利要求3或4所述的用于预测中国人群中直肠癌局部切除手术后复发风险的微阵列，其中各位点以相临位点之间的间隔在0.1-20μm范围内的方式规则排列，各位点的面积小于1μm²。

6.一种用于预测中国人群中直肠癌局部切除手术后复发风险的计算机系统，其包括：

a. 用于接收对象数据的输入装置，其中所述对象数据包括来自根据权利要求3-5任一项所述的微阵列的基因检测数据；

b. 具有数据库的存储器，其用于存储至少所述基因检测数据；

c. 处理器，其与存储器进行通信，且被配置为：

利用所述基因检测数据通过算法模型计算评估值F(x)；和

d. 配置为根据所述评估值F(x)判定的结果发送通知的输出装置；

其中所述算法模型为：

F(x)=29.3341-0.7416 * WDR43+0.9450 * RAB31+2.9083 * FASN-0.5904 * TYMS-3.0449 * SNX2-2.5533 * DAP3+3.7309 * pt+1.9524 * MRPS18C+1.0107 * FANCL-6.5343 * CIDECP-1.1939 * HNRNPH1+0.1941 * CMSS1；

所述处理器进一步被配置为：通过下式得到P(x)值：

P(x)＝1/(1+exp(-F(x)))，

且将所得P(x)值与参考值0.37进行比较，当P(x)高于0.37时判定直肠癌局部切除手术后复发风险高，当P(x)低于或等于0.37判定直肠癌局部切除手术后复发风险低。