[发明专利]一对用于检测小麦赤霉病抗性的引物及其应用

说明书

本发明公开了一对检测小麦赤霉病抗性的引物及其应用，所述引物对核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示；本发明同时提供了上述引物对在预测小麦赤霉病抗性中的应用，即利用小麦全基因组DNA为模板，核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示的引物对进行PCR扩增，扩增产物在1％的琼脂糖凝胶上电泳后获得检测结果，若扩增产物中含有1000bp条带，则判定小麦品种赤霉病抗性至少达到中抗水平；反之，则判定为感赤霉病小麦品种；该方法可以应用于小麦赤霉病抗性材料筛选和分子标记辅助选择育种，以缩短育种时间。

技术领域

本发明属于小麦遗传育种和分子生物学领域，特别是一种检测小麦赤霉病抗性的引物对及其应用。

背景技术

赤霉病(Fusarium Head Blight)是危害小麦、大麦、燕麦和黑麦等作物的重要病害之一，影响麦类作物的产量和品质。赤霉病在我国长江中下游和东北地区小麦种植区大面积发生，在大流行年可减产20％。感染病菌后，麦粒携带的真菌毒素影响种子质量，危害人和动物的健康。耕作模式和栽培技术的改变难以解决病害的侵染和蔓延，药剂防治对控制赤霉病大发生和大流行取得了一定的效果，但同时增加了生产成本，化学药剂也不可避免的导致环境污染。利用赤霉病抗性基因进行品种改良是减轻赤霉病危害的有效途径。

分子标记辅助选择可以对小麦遗传育种中的材料进行早期选择，降低田间抗病性的鉴定成本，提高育种效率。小麦赤霉病是多个基因控制的复杂数量性状，单个分子标记辅助选择的的检测范围有限，其准确性有待提高。与Fhb1连锁的SSR标记Xgwm533离抗性QTL的物理距离较大，在不同的材料中此标记和抗性QTL存在分离。因此，利用Xgwm533进行辅助选择时，其检测结果存在一定的不确定性。分子标记UMN10由于需要昂贵的测序分析仪进行分析，分析方法比较繁琐，在大多数小麦遗传育种实验室使用不多。

小麦品种“苏麦3号”是世界上公认的赤霉病抗性较好的抗源之一，在其3B染色体短臂上发现了一个主效的抗赤霉病位点Fhb1，可解释表型变异率超过20％。在Fhb1区域，基因TaPFT编码一个含有2个凝集素结构域和ETX/MTX2毒结构域的融合蛋白，参与小麦赤霉病的抗性反应。但在含有不同抗性水平的种质资源中验证TaPFT的效应时，发现TaPFT不是参与赤霉病抗性的唯一基因，初步推测Fhb1区域的多个变异位点或基因参与了赤霉病抗性。因此，可以利用来源于其他变异位点的分子标记来进行小麦赤霉病的辅助选择，进一步提高选择的准确性。

发明内容

为了提高利用分子标记辅助选择小麦赤霉病抗性的准确性，本发明提供了一对用于PCR扩增新的变异序列设计了分子标记JAASM395的引物对，通过JAASM395引物对的PCR检测结果可以来判定小麦的赤霉病抗性，可以应用于小麦赤霉病抗性材料筛选和分子标记辅助选择育种。

本发明是通过以下技术方案实现的：

首先，本发明提供了一对用于检测小麦赤霉病抗性的引物对，其核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示。

其次，本发明还提供了上述引物对在检测小麦赤霉病抗性中的应用，其具体步骤为：利用小麦全基因组DNA为模板，以分子标记JAASM395的引物对(SEQ ID NO.1和SEQ IDNO.2)进行PCR扩增，扩增产物在质量百分数为1％的琼脂糖凝胶上电泳后获得检测结果，若扩增产物中含有1000bp条带，则判定小麦品种赤霉病抗性至少达到中抗水平；反之，则判定为感赤霉病小麦品种。

此外，本发明还提供了一种检测小麦赤霉病抗性的方法，其具体步骤为：以小麦DNA为模板，以核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示的引物对进行PCR扩增，扩增产物在1％的琼脂糖凝胶上电泳后获得检测结果，若扩增产物中含有1000bp条带，则判定小麦品种赤霉病抗性至少达到中抗水平；反之，则判定为感赤霉病小麦品种。