[发明专利]一种枸杞自交亲和性的S-RNase基因鉴定方法在审
申请号: | 201811473001.2 | 申请日: | 2018-12-04 |
公开(公告)号: | CN109680089A | 公开(公告)日: | 2019-04-26 |
发明(设计)人: | 李彦龙;秦垦;戴国礼 | 申请(专利权)人: | 宁夏农林科学院枸杞工程技术研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895 |
代理公司: | 北京挺立专利事务所(普通合伙) 11265 | 代理人: | 陈列生 |
地址: | 750000 宁夏回族*** | 国省代码: | 宁夏;64 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 枸杞 自交亲和性 检测 基因组DNA 自交亲和 条带 基因 特异性PCR引物 子代 电泳条带 基因鉴定 检测结果 碱基组成 时间成本 特异基因 位点设计 杂交群体 枸杞植株 基因组 定植 幼苗 叶片 | ||
1.一种枸杞自交亲和性的S-RNase基因鉴定方法,其特征在于:
步骤1:以待检测枸杞基因组DNA为模板,利用一对专一设计的PCR引物,检测所述枸杞基因组中目标PCR扩增产物条带,所述一对专一设计的PCR引物的碱基组成分别为:
5’-GTGGGCAACCAAAAAGTGGGTTATG-3’和5’-GCCTTTTCGATATCATGAAGCA-3’;
步骤2:检测在枸杞基因组DNA中是否含有所述目标PCR扩增产物条带,即枸杞DNA中S-RNase基因中的一个特异基因型S2是否存在;
步骤3:根据步骤2的检测结果判断所检测枸杞植株是否为自交亲和枸杞,在所述枸杞基因组DNA中含有一个S-RNase基因的特异基因型S2,则所检测枸杞植株为自交亲和枸杞;在所述枸杞基因组DNA中不含有一个S-RNase基因的特异基因型S2,则所检测枸杞植株为自交不亲和枸杞。
2.根据权利要求1所述的一种枸杞自交亲和性的S-RNase基因鉴定方法,其特征在于:所述的S-RNase基因的一个特异基因型S2,其DNA全长781bp,碱基组成序列为
ATGTCTAAACCACAGCACACATCAGTTCTCTTCATGTTGCTTTTTGCTATTTCTTCTACTTATGGGAATTTCGAGTTATTGGAGCTCGTTTTGACGTGGCCACCAACTTTTTGCTACATGAACAATTGCAACAGATGGCCAATTCCAAACAATTTTACAATTCATGGGCTTTGGCCGGATAACAACTCCGTTATGCTGAATAACTGCGTGGGCAACCAAAAAGTGGGTTATGATATCATCATGGTAAATTACCAAACTAATTTTCTCAAATCTTCGTAATTCATTGATTCAAATGTCACCTTAGCGTTTGTTCATGTATTTATTGAATGAAGCCGTTTCAAAATGTATACAGGATGTCAGAAAACTAAGTGAGCTGGACAAACGCTGGCCTCAACTGAAATACGACTACCAAACTGGTATAGACGAACAATATCTCTGGAAAAAGGAATTCCTAAAACATGGAAGCTGTGGTATAAAGCGGTACCCACAGCCTGCATATTTTGATTTAGCCATGAATTTAAAAGACAAGTTTGATCTCTTGAGTACTCTCAGAAATCATGGGATTACTCCTGGTTCAACTTATCTGCTTCATGATATCGAAAAGGCCATAAAGACAGTTTCTATAAAGGTTCCTAGCCTCAAGTGCATTGAAAAATATCCTGGAGATGTGGAACTCAGTGAGATTGGTATATGTTTGGACCCAGAAGCAGAATATATGGTTCCTTGTCCTCGAACTGGGTCATGCCATAACAAGAGAACTAAGATAATTAAGTTCCGATGA,
DNA全长序列可以利用PCR引物5'-ATGTCTAAACCACAGCACACATC-3'和5'-TCATCGGAACTTAATTATCTTAGTTCTC-3'通过克隆测序获得。
3.枸杞杂交子代的早期筛选应用方法,其特征在于包含以下步骤:
(1)枸杞基因组DNA准备,选用约2mm2新鲜枸杞叶片、利用CTAB法、其它试剂盒提取的枸杞基因组DNA中的任意一项;
(2)PCR反应体系,总反应体积20μl,包含枸杞基因组DNA模板1μl,10×buffer 2 μl,dNTP0.4 μl,Taq DNA Polymerase 0.25μl,上、下游引物各0.8μl,ddH2O 14.75μl;
(3)PCR控温程序,94℃预变性3min;94℃变性30s;56℃退火30s;72℃延伸1min,36个循环;72℃后延伸10min;μl;
(4)条带检测,1%-2%琼脂糖凝胶电泳,胶红或者EB染色,紫外灯下拍照,显示有条带,则为自交亲和,没有条带则为自交不亲和。
4.根据权利要求3所述的枸杞杂交子代的早期筛选应用方法,其特征在于:步骤4中条带检测是以枸杞基因组DNA为PCR模板,条带大小为399bp。
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