[发明专利]一种确定肿瘤免疫治疗标志物的存储介质、设备及装置

权利要求书

1.一种存储有计算机程序的计算机可读存储介质，所述计算机程序被执行时可以实现方法步骤，所述方法步骤包括：

根据个体的mRNA表达数据，基于GSVA算法获取抗原递呈指数；

根据式I计算获得APS_normalized

式I中：

APS_normalized指标准化的抗原递呈指数；

APS指抗原递呈指数；

APS_{pancan_min}指与个体所对应的肿瘤患者的群体中APS的最低值；

APS_{pancan_max}指与个体所对应的肿瘤患者的群体中APS的最大值；

根据式II计算获得肿瘤免疫原性指数

TIGS＝APS_normalized×ln(TMB+1) (式II)；

式II中：

TIGS指肿瘤免疫原性指数；

TMB指肿瘤突变负荷，即每百万碱基中被检测出的体细胞基因编码错误、碱基替换、基因插入或缺失错误的总数。

2.如权利要求1所述的计算机可读存储介质，其特征在于，所述个体选自接受肿瘤免疫治疗的动物。

3.如权利要求2所述的计算机可读存储介质，其特征在于，所述接受肿瘤免疫治疗的动物为人类。

4.如权利要求2所述的计算机可读存储介质，其特征在于，所述肿瘤免疫治疗包括免疫检查点抑制剂治疗。

5.如权利要求2所述的计算机可读存储介质，其特征在于，所述肿瘤免疫治疗包括向个体施用抗PD-1抗体、PD-L1抗体、CTLA-4抗体中的一种或多种的治疗方法。

6.如权利要求1所述的计算机可读存储介质，其特征在于，个体的mRNA表达数据和/或TMB来源于肿瘤样本。

7.如权利要求4所述的计算机可读存储介质，其特征在于，所述肿瘤选自黑色素瘤、肺癌、尿路上皮癌、头颈癌、肾癌、淋巴瘤、前列腺癌、乳腺癌、神经胶质瘤、子宫颈癌、子宫内膜癌、食管癌、肝癌、间皮瘤、卵巢癌、胰腺癌、副神经节瘤、结肠癌、肉瘤、胃癌、睾丸生殖细胞肿瘤、甲状腺癌、或胸腺瘤。

8.如权利要求1所述的计算机可读存储介质，其特征在于，用于计算APS的基因包括PSMB5、PSMB6、PSMB7、PSMB8、PSMB9、PSMB10、TAP1、TAP2、ERAP1、ERAP2、CANX、CALR、PDIA3、TAPBP、B2M、HLA-A、HLA-B和HLA-C中的至少14个基因。

9.如权利要求1所述的计算机可读存储介质，其特征在于，APS_{pancan_min}＝-1～-0.86。

10.如权利要求1所述的计算机可读存储介质，其特征在于，APS_{pancan_max}＝0.88～1。