[发明专利]柳树耐盐性状主效QTL的分子标记及应用在审
申请号: | 201811364868.4 | 申请日: | 2018-11-13 |
公开(公告)号: | CN109609672A | 公开(公告)日: | 2019-04-12 |
发明(设计)人: | 李敏;王莹;郭聪;谈峰;冯新民;马祥建;王奎山;沈悦;王永强 | 申请(专利权)人: | 江苏沿江地区农业科学研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 上海唯源专利代理有限公司 31229 | 代理人: | 曾耀先 |
地址: | 226000*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 分子标记 柳树 耐盐性状 特异性检测 主效QTL 耐盐性 分子标记辅助育种 应用 主效QTL位点 第二引物 第一引物 品质育种 有效选择 检测 进程 | ||
1.一种柳树耐盐性状主效QTL的分子标记,其特征在于,所述的柳树耐盐性状主效QTL位点的分子标记特异性检测柳树SNP位点M24340和柳树SNP位点M36640。
2.根据权利要求1所述的柳树耐盐性状主效QTL的分子标记,其特征在于,所述的柳树耐盐性状主效QTL位点的分子标记包括第一分子标记和第二分子标记,所述第一分子标记特异性检测所述柳树SNP位点M24340,所述第二分子标记特异性检测所述柳树SNP位点M36640。
3.根据权利要求2所述的柳树耐盐性状主效QTL的分子标记,其特征在于,所述第一分子标记是第一CAPS2分子标记,所述第一CAPS2分子标记包括SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示的第一引物对,所述第二分子标记是第二dCAPS2分子标记,所述第二dCAPS2分子标记包括SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示的第二引物对。
4.一种利用分子标记检测柳树耐盐性状的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)提取待测柳树的基因组DNA;
(2)采用上述的柳树耐盐性状主效QTL位点的分子标记对所述基因组DNA进行检测;
(3)当检测到所述柳树SNP位点M24340为C且检测到所述柳树SNP位点M36640为T时,所述待测柳树为耐盐性柳树,否则,所述待测柳树为非耐盐性柳树。
5.根据权利要求4所述的利用分子标记检测柳树耐盐性状的方法,其特征在于,在所述步骤(2)中,采用CAPS2/dCAPS2分子标记对所述基因组DNA进行检测的步骤包括:
(21)对所述基因组DNA采用所述第一引物对进行PCR扩增获得第一扩增产物,采用NsiI酶切所述第一扩增产物;
(22)对所述基因组DNA采用所述第二引物对进行PCR扩增获得第二扩增产物,采用NlaIII酶切所述第二扩增产物;
在所述步骤(3)中,若所述第一扩增产物酶切得到220bp和81bp的产物则表明检测到所述柳树SNP位点M24340为C,若所述第二扩增产物酶切得到67bp和24bp的产物则表明检测到所述柳树SNP位点M36640为T。
6.一种利用分子标记辅助耐盐性柳树育种的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(A)提取待测柳树的基因组DNA;
(B)采用上述的柳树耐盐性状主效QTL位点的分子标记对所述基因组DNA进行检测;
(C)当检测到所述柳树SNP位点M24340为C且检测到所述柳树SNP位点M36640为T时,所述待测柳树为耐盐性柳树,将所述耐盐性柳树应用于柳树品质育种。
7.根据权利要求6所述的利用分子标记辅助耐盐性柳树育种的方法,其特征在于,在所述步骤(B)中,采用CAPS2/dCAPS2分子标记对所述基因组DNA进行检测的步骤包括:
(B1)对所述基因组DNA采用所述第一引物对进行PCR扩增获得第一扩增产物,采用NsiI酶切所述第一扩增产物;
(B2)对所述基因组DNA采用所述第二引物对进行PCR扩增获得第二扩增产物,采用NlaIII酶切所述第二扩增产物;
在所述步骤(C)中,若所述第一扩增产物酶切得到220bp和81bp的产物则表明检测到所述柳树SNP位点M24340为C,若所述第二扩增产物酶切得到67bp和24bp的产物则表明检测到所述柳树SNP位点M36640为T。
8.根据权利要求1至3中任一权利要求所述的柳树耐盐性状主效QTL的分子标记在检测柳树耐盐性状中的应用。
9.根据权利要求1至3中任一权利要求所述的柳树耐盐性状主效QTL的分子标记在对柳树耐盐性进行选择中的应用。
10.根据权利要求1至3中任一权利要求所述的柳树耐盐性状主效QTL的分子标记在耐盐性柳树的分子标记辅助育种中的应用。
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