[发明专利]一种检测芸薹种蔬菜叶缘裂刻性状的SNP分子标记及其应用

说明书

本发明属于生物技术领域，具体涉及一种检测芸薹种蔬菜叶缘裂刻性状的SNP分子标记及其应用。所述SNP分子标记选自：(a)Bra009510基因的模板链第358位核酸多态性为G或A；(b)芸薹种蔬菜保持叶全缘性状品种中与Bra009510同源的同源基因中，与SEQ ID NO.1第358位相对应的核酸多态性为G，和/或芸薹种叶缘裂刻性状品种中与Bra009510同源的同源基因中，与SEQ ID NO.1第358位相对应的核酸多态性为A；所述芸薹种蔬菜保持叶全缘性状品种和/或芸薹种蔬菜叶缘裂刻性状品种选自：自然界的品种、杂交品种、人工诱变品种；其中，所述Bra009510基因的模板链的序列如SEQ ID NO.1所示。利用本发明所提供的分子标记及其所对应的引物无论在叶缘裂刻还是在全缘材料中的选择准确率均为100％，可用于分子标记辅助选择育种。

技术领域

本发明属于生物技术领域，具体涉及一种检测芸薹种蔬菜叶缘裂刻性状的SNP分子标记及其应用。

背景技术

芸薹种蔬菜包括大白菜、芜菁和小白菜，具有种类多、遗传资源丰富、栽培面积广、生长周期短等特点，是我国蔬菜的重要组成部分。作为重要的叶菜类蔬菜，叶缘形态直接影响芸薹种蔬菜的商品性，而且随着市场需求变化，研究叶缘形态的分子机理，创制芸薹属蔬菜叶形特异新种质是解决市场对芸薹属蔬菜品种多样化需求的有效手段。

叶缘裂刻是植物对环境适应性的一种表现。首先，叶缘适度裂刻可以改变植株的株型，提高植物通风透光性，增强植株整体的光合作用效率，在一定程度上减缓病虫害的发生；其次，叶缘适度裂刻能够提高植物对高温、干旱等逆境胁迫的适应性；因此，研究芸薹种蔬菜叶缘裂刻调控的分子机制，对于培育商品价值高、环境适应性强的新品种具有重要意义。目前，关于叶缘发育的研究主要集中在拟南芥、番茄等模式植物上，芸薹种中叶缘裂刻基因克隆、调控机理等基础研究还十分薄弱。

曾国平和曹寿椿 (1996) 对不结球白菜的叶缘裂刻性状探究表明：不结球白菜叶缘裂刻对不裂表现为显性，是受一对核基因控制的质量性状。葛颂和洪德元 (1995) 对泡沙参复合体研究表明叶缘锯齿数目和深度属于数量性状，由多对基因控制。在白菜中，A10染色体末端是一个控制白菜类作物叶缘裂刻主效QTL（或基因）的 “Hotspot”区间。惠麦侠（2011）利用“矮抗青” F4:7重组近等基因系群体在 A10 染色体上标记位置为Bra009533-Bra009495处定位了一个199-kb的区间。Wang等（2015）利用叶缘有裂刻的欧洲白菜型油菜与叶缘无裂刻的大白菜杂交获得的 F₂ 及 F_2:3 家系在 A10 染色体上定位到一个控制叶裂的主效 QTL，位于标记 BrID10909-BrID10233 之间。本实验室利用 DH 群体及 F₂ 群体，根据亲本的重测序数据发展分子标记，在 A10 染色体上定位到控制叶裂的主效 QTL，位于标记 A1015686749- A1015850960 之间 164-kb 的区间。

利用与目标性状共分离的分子标记进行标记辅助选择（MAS）在遗传育种中是十分有效的方法，分子标记是在 DNA 水平上对目标性状进行选择，具有高效、快速、不受环境影响等优点，可以在幼苗期进行选择，加快育种过程。 SNP 标记具有遗传稳定性高，多态性丰富，检测易实现自动化等特点，是目前最具发展潜力的分子标记，在基于分子标记辅助选择（MAS）技术的育种工作中发挥越来越重要的作用。芸薹种蔬菜的叶缘裂刻性状只有在真叶发育完全时期才能充分显现，用传统的方法受发育时期限制，且效率低。

所以，目前芸薹属蔬菜育种的科研和实践中，需要利用分子标记进行基因型鉴定，这样可以在早期对幼苗(甚至对种子)进行检测和选择，可以减少工作量，加快育种进程；因此开发与芸薹属蔬菜叶缘裂刻相关的分子标记显得尤为重要。

发明内容

本发明所要解决的技术问题是如何鉴别待测芸薹种蔬菜的叶型，是否为叶缘裂刻的芸薹种蔬菜。

本发明的目的是通过以下技术方案实现的。