[发明专利]一种简易的斑点杂交加样方法在审
申请号: | 201811311187.1 | 申请日: | 2018-11-06 |
公开(公告)号: | CN109504742A | 公开(公告)日: | 2019-03-22 |
发明(设计)人: | 曹祖兵;王怡青;童旭;张丹丹;宁伟;齐昕;许腾腾;高迪;张运海 | 申请(专利权)人: | 安徽农业大学 |
主分类号: | C12Q1/6834 | 分类号: | C12Q1/6834 |
代理公司: | 北京轻创知识产权代理有限公司 11212 | 代理人: | 沈尚林 |
地址: | 230001 *** | 国省代码: | 安徽;34 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 加样 硝酸纤维素膜 斑点杂交 金属浴 简易 成纤维细胞 技术优化 预热金属 重大意义 重物 细胞RNA 美纹纸 烘烤 裁剪 多管 耗材 灰度 枪头 压住 整合 猪耳 盛装 | ||
1.一种简易的斑点杂交加样方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)猪耳缘成纤维细胞的培养;
(2)细胞RNA的提取、浓度的测定以及调整;
(3)添加样品:预热金属浴至85℃,并将硝酸纤维素膜裁剪至所需要的合适大小;通过美纹纸将硝酸纤维素膜固定于层板上;在硝酸纤维素膜上于85℃烘烤下进行加样;加样后用重物压住层板,以使硝酸纤维素膜和金属浴紧密接触;
(4)进行斑点杂交;
(5)分析结果,比较灰度值。
2.根据权利要求1所述的简易的斑点杂交加样方法,其特征在于,步骤(1)中,猪耳缘成纤维细胞培养的具体步骤如下:
①解冻两管冻存于液氮中的猪耳缘成纤维细胞于两个直径9cm的培养皿中,在温度为37℃,CO2体积分数为5%的平衡箱中培养;
②培养一定时间后,在显微镜下观察,待贴壁的细胞面积达到皿底面积的95%时,对照组更换新的培养基,试验组更换含有浓度为20mM的环亮氨酸的培养基,继续在平衡箱中培养48h。
3.根据权利要求1所述的简易的斑点杂交加样方法,其特征在于,步骤(2)中,细胞RNA的提取、浓度的测定以及调整的具体步骤如下:
①在显微镜下观察对照组和试验组的细胞是否生长良好,若细胞表现为贴壁,且面积达到皿底面积的95%,则进行RNA的提取;
RNA的提取分三组,分别是:
293T-作为阳性对照,作用是用于检测样品是否附着于硝酸纤维素膜上,以及成像是否正常等;
对照组-用作空白对照的猪耳缘成纤维细胞;
试验组-添加环亮氨酸处理48h之后的猪耳缘成纤维细胞;
②先提取RNA,对三组RNA的浓度进行测定,再调整RNA浓度,使得三组RNA的浓度一致;
③提取293T细胞的RNA具体过程如下,其他两组RNA提取方法与之相同:
a.预处理:将无RNA酶的枪头放入超净台中紫外照射30min,打开金属浴55℃,预热DEPC水;
b.将293T细胞的培养液PAF弃掉,然后用PBS清洗两遍,弃掉PBS后加入1mL的Trizol裂解细胞;
c.将装有RNA样品的1.5mL离心管放在涡旋震荡仪上震荡30s-60s,随后置于冰上静止2min;
d.将裂解后的细胞-Trizol混合物移入1.5mL离心管中,再加入400μL的氯仿,迅速混匀,震荡2min,然后迅速插在冰上静止,随后在4℃下,转速13000rpm离心10min,离心后,将该离心管静置于冰上,用吸取上层水相清液,将清液置于另一1.5mL离心管中,并放于冰上;
e.向上步装有清液的离心管中加入40μL异丙醇,充分混匀后置于-80℃冰箱30min后取出,在4℃下,转速12000rpm离心15min;
f.弃掉上步的上层清液,留下底部白色沉淀,加入体积分数为75%的RNAse free乙醇800μL洗涤沉淀,4℃下,转速12000rpm离心10min;
g.重复上述步骤一次;
h.将离心管在4℃下转速为12,000rpm离心2min,将剩余的75%RNAse free乙醇吸走,留下沉淀,再静置2min以确保乙醇完全挥发;
i.取31μL加热至55℃的DEPC水于上步的RNA沉淀中,用移液器吹打混匀至沉淀完全溶解后,吸取1μL于分光光度计中,测量浓度并记录相关数值;
j.将所有组的RNA样品的浓度调一致,用于斑点杂交。
4.根据权利要求1所述的简易的斑点杂交加样方法,其特征在于,步骤(4)中,斑点杂交的具体步骤如下:
①RNA变性:使三组RNA样品在95℃下变性10min,以破坏其二三级结构,然后迅速置于冰上冷却2min,使其结构稳定在一级结构;
②在进行步骤①的同时将硝酸纤维素膜于金属浴85℃中预热,待步骤①的RNA样品处理好之后用无RNA酶的枪头进行梯度加样,第一排点1μL,第二排点2μL,然后85℃烘烤6h;
③将梯度加样后的三组RNA样品于水平摇床中用质量分数为5%的BSA常温封闭2h;
④加m6A一抗于5%BSA中,按1:5000的体积比进行稀释,置于4℃摇床上12h以上;
⑤次日早晨,常温下在水平摇床中用1XPBST洗一抗,6次,6min/次;
⑥将二抗以3:10000的体积比进行稀释于水中,再将该稀释后的二抗与质量分数为5%的牛奶混合,水平摇床,常温,105min;
⑦常温下在水平摇床中用1XPBST洗二抗,5次,5min/次;
⑧配制显影液,将NcmECL Ultra Enhancer Reagent(A)和NcmECL Ultra Stabilizedperoxide Reagent(B)按体积比例1:1混合;
⑨进行放射自显影。
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