[发明专利]一种流感病毒抗原变化的预测方法

权利要求书

1.一种流感病毒抗原变化的预测方法，该方法的特征在于包括：

S1：流感病毒编码；

对流感病毒序列集合P={P₁,P₂,P₃,…, P_l}中任意两条不同流感病毒(P_i,P_j)进行对比建模，得到对比编码，m是流感病毒序列的氨基酸数量；最后得到条对比序列：

其中，第k位的对比编码由氨基酸对的抗原变化编码和氨基酸特征编码组成；

S2：搭建深度神经网络的流感病毒抗原变化预测模型；

预测模型包括输入层、CNN层、门控RNN层和输出层；其中，输入层依次输入训练样本集中两两流感病毒对比序列C以及抗原变化标签Y；CNN层将输入序列C，经过卷积操作、池化操作转换为序列X；门控RNN层将序列X转换为序列H；输出层将序列H，转换为抗原变化预测序列；

S3：定义目标函数，用训练集训练模型，得到更新之后的模型参数为θ^*；

S4：对深度神经网络的流感病毒抗原变化预测模型，以及模型参数θ^*，将两条不同流感病毒(P_i,P_j)的对比特征编码c输入模型，使用标签作为(P_i,P_j)的抗原变化预测，其中，Y_c是所有抗原变化标签集合，是模型参数和编码c条件下抗原变化标签的概率函数，y^*是在中使函数最大化的标签。

2.根据权利要求1所述的一种流感病毒抗原变化的预测方法，其特征在于：

的抗原变化编码为20维二进制串，每一维和一个氨基酸一一对应；如果上发生变异则该位对应的变异编码中有且仅有两位取1，其它取0，如果上没有发生变异，则该位上对应的变异编码中有且仅有一位取1，其它取0。

3.根据权利要求1所述的一种流感病毒抗原变化的预测方法，其特征在于：

的特征编码是一位的二进制编码，其中0表示第k位氨基酸在病毒几何结构的内部，1表示第k位氨基酸在病毒的几何结构的表面。