[发明专利]tRNA相关肺腺癌预后模型及其应用在审
申请号: | 201811304666.0 | 申请日: | 2018-11-04 |
公开(公告)号: | CN109337979A | 公开(公告)日: | 2019-02-15 |
发明(设计)人: | 匡牧宇;孙艺华;张辉标;郑迪凡;周子琅;李多;邓超 | 申请(专利权)人: | 华东医院 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6851 |
代理公司: | 上海精晟知识产权代理有限公司 31253 | 代理人: | 冯子玲 |
地址: | 200040 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 肺腺癌 预后 应用 预后预测 试剂盒 筛选 生物医学检测 正常肺组织 表达水平 评分模型 预后判断 肺组织 制备 检测 | ||
本发明属于生物医学检测技术领域,尤其为tRNA相关肺腺癌预后模型及其应用,包括提供了检测组织中tRNA表达水平在肺腺癌预后判断中的应用,它由以下步骤完成:步骤一:肺腺癌及正常肺组织tRNA定量;步骤二:tRNA与肺腺癌预后相关性;步骤三:tRNA相关预后评分模型建立;本发明,通过qPCR芯片对50对肺腺癌及其对应癌旁肺组织进行筛选,揭示了其对应组织的tRNA定量表达情况,本发明的目的在于筛选与肺腺癌患者预后相关的特定tRNA分子,并且提供一种诊治肺腺癌的tRNA预后模型,本发明的另一目的在于提供特定tRNA组合在制备肺腺癌预后预测试剂盒中的应用,本发明阐述了该预后模型在肺腺癌预后预测及相关试剂盒在肺腺癌诊治、预后中的应用。
技术领域
本发明属于生物医学检测技术领域,具体涉及tRNA相关肺腺癌预后模型及其应用。
背景技术
根据最新的流行病学调查数据显示,肺癌是发病率和肿瘤相关致死率最高的恶性肿瘤之一,而其中最常见的病理类型是肺腺癌,在临床工作中,TNM分期为最常用的肺癌分期方法,用于指导临床治疗和评估预后,但值得注意的是,在临床工作中,即使同期肺腺癌患者的术后生存率和无复发生存率也存在着明显差异,近年来,随着测序技术的快速发展,一些研究人员发现驱动基因和分子病理亚型的突变极大地影响了肺腺癌患者的预后,2015年WHO肺癌分类的重点描述了分子标志物在肺腺癌的诊断和治疗中的重要作用,然而,肺腺癌发生发展的分子机制仍不清楚,为了更准确地预测肺腺癌患者的生存,我们仍需要确定研究的新视角。
转运RNA(转移核糖核酸,tRNA)是一种携带和运输氨基酸的小分子核糖核酸,tRNA是由长度为70-90个碱基构成的核苷酸链,折叠成三叶草形状。近年来,研究证实,除氨基酸转运外,tRNA还可通过影响细胞增殖,分化,凋亡和代谢来参与细胞生物学功能的调节,近年来,tRNA与肿瘤的关系逐渐受到关注,并取得了一些标志性的进展,有研究表明,特异性tRNA可以驱动癌基因表达,某些特定tRNA(甲硫氨酸tRNA)表达水平的上调可导致肿瘤发生,此外,肿瘤细胞可通过调节tRNA的表达来调节肿瘤生长,在临床应用方面,tRNA被证实可以作为乳腺癌的生物标志物。
据本发明申报人所知,tRNA与肺腺癌患者预后之间的关系尚无研究人员报道,迄今为止,tRNA表达失调与肺腺癌之间的关系目前尚不清楚,申请者研究了tRNA在肺腺癌和相应的癌旁组织中的表达谱,筛选出与肺腺癌患者预后相关的tRNA分子,并且进一步扩大样本检测,表明tRNA-CysTT-1、mt-tRNA-Ser-GCT和tRNA-Tyr-ATA与肿瘤相关预后CSS相关,并构建了首个tRNA相关肺腺癌预后模型,tRNA相关研究目前是一个新兴领域,我们希望这种预后模型可用于指导临床肺腺癌的个体化治疗策略,并根据预后模型中相关的tRNA分子进一步开发用于肺腺癌诊治、预后检测相关试剂盒。
发明内容
为解决上述背景技术中提出的问题。本发明提供了tRNA相关肺腺癌预后模型及其应用,具有用于指导临床肺腺癌的个体化治疗的特点。
为实现上述目的,本发明提供如下技术方案:tRNA相关肺腺癌预后模型及其应用,包括提供了检测组织中tRNA表达水平在肺腺癌预后判断中的应用,它由以下步骤完成:
步骤一:肺腺癌及正常肺组织tRNA定量;
步骤二:tRNA与肺腺癌预后相关性;
步骤三:tRNA相关预后评分模型建立。
优选的,所述肺腺癌及正常肺组织tRNA定量的步骤包括:
步骤一:确定研究对象;所使用的50对肺腺癌组织及癌旁正常肺组织组织样本来自胸外科进行手术的患者,患者诊断以最终石蜡切片诊断为准,所纳入的样本均为肺腺癌,患者的基本信息及预后信息完备;
步骤二:组织RNA提取步骤同常规;
步骤三:RNA的去甲基化;步骤为:
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