[发明专利]一种多重RT-PCR检测试剂盒及应用有效
| 申请号: | 201811300318.6 | 申请日: | 2018-11-02 |
| 公开(公告)号: | CN109207641B | 公开(公告)日: | 2022-03-08 |
| 发明(设计)人: | 廖宁波;章荣华;张严峻;陈江;陈莉莉 | 申请(专利权)人: | 江西农业大学 |
| 主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/686;C12N15/11 |
| 代理公司: | 杭州天正专利事务所有限公司 33201 | 代理人: | 黄美娟;李世玉 |
| 地址: | 330045 江西省南*** | 国省代码: | 江西;36 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 多重 rt pcr 检测 试剂盒 应用 | ||
1.一种多重RT-PCR检测试剂盒,其特征在于所述试剂盒包括:
(1)RNA提取试剂,以大肠杆菌噬菌体MS2为RNA提取质控;
(2)PCR反应体系:含诺如病毒GI型、诺如病毒GII型和大肠杆菌噬菌体MS2各自的正向引物、反向引物和特异性探针;
诺如病毒GI型引物、特异性探针:
正向引物GI-F:5’-GGCAGATGATGAGCGTGAGG-3’
反向引物GI-R:5’-AGAAACCCCATCCAGACCCAAACT-3’
特异性探针Probe-P:5’-HEX-CACTTTATGGAGCAGAGTGAC-BHQ-3’;
诺如病毒GII型引物、特异性探针:
正向引物GII-F:5’-CTAGAAACGCTCCAGGTGAAAT-3’
反向引物GII-R:5’-TCTGGCCAAATGGGAAAGGTAA-3’
特异性探针Probe-P:5’-FAM-CCCTTGGGCCCTGATTTGA-TAMRAR-3’;
大肠杆菌噬菌体MS2引物、特异性探针:
正向引物MS-F:5’-ATTCCGACTGCGAGCTTATTGTT-3’
反向引物MS-R:5’-GGAGTTTGCTGCGATTGCTGAGG-3’
特异性探针Probe-P:5’-ROX-AATCGGGTTTCCATCTTTTAG-BHQ2-3’;
(3)PCR质控反应体系:以含SEQ ID NO.10所示核苷酸序列的质粒pcDA-NoV-GI、含SEQID NO.11所示核苷酸序列的质粒pcDA-NoV-GII及含SEQ ID NO.12所示核苷酸序列的质粒pcDA-MS2的混合质粒作为PCR质控反应模板;
SEQ ID NO.10所示核苷酸序列:
5’-ggcagatgatgagcgtgaggtggattacaatgagaagatcagttttgaggcgccccccactttatggagcagagtgacaaagtttgggtctggatggggtttct-3’;
SEQ ID NO.11所示核苷酸序列:
5’-ctagaaacgctccaggtgaaatactatggagcgcgcccttgggccctgatttgaatccttacctttcccatttggccaga-3’;
SEQ ID NO.12所示核苷酸序列:
5’-attccgactgcgagcttattgttaaggcaatgcaaggtctcctaaaagatggaaacccgattccctcagcaatcgcagcaaactcc-3’。
2.如权利要求1所述的多重RT-PCR检测试剂盒,其特征在于:所述PCR反应体系还包括反应缓冲液,逆转录酶,DNA聚合酶和DEPC水。
3.如权利要求1所述的多重RT-PCR检测试剂盒,其特征在于PCR反应体系为2×buffer12.5μL,逆转录酶和DNA聚合酶各0.5μL,20μmol/L正向引物0.3μL,20μmol/L反向引物0.3μL,20μmol/L特异性探针0.15μL,模板5μL,DEPC水补齐至25μL。
4.一种权利要求1所述多重RT-PCR检测试剂盒在制备同时检测诺如病毒GI型、诺如病毒GII型和大肠杆菌噬菌体MS2药物中的应用。
5.如权利要求4所述的应用,其特征在于所述应用的方法如下:
(1)RNA提取:向待测样本中加入大肠杆菌噬菌体MS2,提取混合病毒RNA;所述大肠杆菌噬菌体MS2加入量为1.3×105PFU/mL;
(2)PCR扩增反应:以步骤(1)混合病毒RNA为模板,加入反应缓冲液、逆转录酶、DNA聚合酶和DEPC水构成PCR反应体系,进行PCR扩增;PCR扩增条件:42℃逆转录反应30min;95℃预变性2min;95℃变性5s,58-64℃退火、延伸35s,39个循环,退火温度处同时收集荧光信号;同样条件下,以混合质粒作为PCR质控反应模板进行PCR扩增,以校准混合病毒RNA的扩增效率;
(3)步骤(2)中HEX荧光信号对应的Ct值小于等于30,则样品中含有诺如病毒GI型;若FAM荧光信号对应的Ct值小于等于30,则样品中含有诺如病毒GII型;若ROX荧光信号对应的Ct值小于等于30,则样品中含有大肠杆菌噬菌体MS2。
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