[发明专利]一种多重RT-PCR检测试剂盒及应用有效

专利信息
申请号: 201811300318.6 申请日: 2018-11-02
公开(公告)号: CN109207641B 公开(公告)日: 2022-03-08
发明(设计)人: 廖宁波;章荣华;张严峻;陈江;陈莉莉 申请(专利权)人: 江西农业大学
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/686;C12N15/11
代理公司: 杭州天正专利事务所有限公司 33201 代理人: 黄美娟;李世玉
地址: 330045 江西省南*** 国省代码: 江西;36
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摘要:
搜索关键词: 一种 多重 rt pcr 检测 试剂盒 应用
【权利要求书】:

1.一种多重RT-PCR检测试剂盒,其特征在于所述试剂盒包括:

(1)RNA提取试剂,以大肠杆菌噬菌体MS2为RNA提取质控;

(2)PCR反应体系:含诺如病毒GI型、诺如病毒GII型和大肠杆菌噬菌体MS2各自的正向引物、反向引物和特异性探针;

诺如病毒GI型引物、特异性探针:

正向引物GI-F:5’-GGCAGATGATGAGCGTGAGG-3’

反向引物GI-R:5’-AGAAACCCCATCCAGACCCAAACT-3’

特异性探针Probe-P:5’-HEX-CACTTTATGGAGCAGAGTGAC-BHQ-3’;

诺如病毒GII型引物、特异性探针:

正向引物GII-F:5’-CTAGAAACGCTCCAGGTGAAAT-3’

反向引物GII-R:5’-TCTGGCCAAATGGGAAAGGTAA-3’

特异性探针Probe-P:5’-FAM-CCCTTGGGCCCTGATTTGA-TAMRAR-3’;

大肠杆菌噬菌体MS2引物、特异性探针:

正向引物MS-F:5’-ATTCCGACTGCGAGCTTATTGTT-3’

反向引物MS-R:5’-GGAGTTTGCTGCGATTGCTGAGG-3’

特异性探针Probe-P:5’-ROX-AATCGGGTTTCCATCTTTTAG-BHQ2-3’;

(3)PCR质控反应体系:以含SEQ ID NO.10所示核苷酸序列的质粒pcDA-NoV-GI、含SEQID NO.11所示核苷酸序列的质粒pcDA-NoV-GII及含SEQ ID NO.12所示核苷酸序列的质粒pcDA-MS2的混合质粒作为PCR质控反应模板;

SEQ ID NO.10所示核苷酸序列:

5’-ggcagatgatgagcgtgaggtggattacaatgagaagatcagttttgaggcgccccccactttatggagcagagtgacaaagtttgggtctggatggggtttct-3’;

SEQ ID NO.11所示核苷酸序列:

5’-ctagaaacgctccaggtgaaatactatggagcgcgcccttgggccctgatttgaatccttacctttcccatttggccaga-3’;

SEQ ID NO.12所示核苷酸序列:

5’-attccgactgcgagcttattgttaaggcaatgcaaggtctcctaaaagatggaaacccgattccctcagcaatcgcagcaaactcc-3’。

2.如权利要求1所述的多重RT-PCR检测试剂盒,其特征在于:所述PCR反应体系还包括反应缓冲液,逆转录酶,DNA聚合酶和DEPC水。

3.如权利要求1所述的多重RT-PCR检测试剂盒,其特征在于PCR反应体系为2×buffer12.5μL,逆转录酶和DNA聚合酶各0.5μL,20μmol/L正向引物0.3μL,20μmol/L反向引物0.3μL,20μmol/L特异性探针0.15μL,模板5μL,DEPC水补齐至25μL。

4.一种权利要求1所述多重RT-PCR检测试剂盒在制备同时检测诺如病毒GI型、诺如病毒GII型和大肠杆菌噬菌体MS2药物中的应用。

5.如权利要求4所述的应用,其特征在于所述应用的方法如下:

(1)RNA提取:向待测样本中加入大肠杆菌噬菌体MS2,提取混合病毒RNA;所述大肠杆菌噬菌体MS2加入量为1.3×105PFU/mL;

(2)PCR扩增反应:以步骤(1)混合病毒RNA为模板,加入反应缓冲液、逆转录酶、DNA聚合酶和DEPC水构成PCR反应体系,进行PCR扩增;PCR扩增条件:42℃逆转录反应30min;95℃预变性2min;95℃变性5s,58-64℃退火、延伸35s,39个循环,退火温度处同时收集荧光信号;同样条件下,以混合质粒作为PCR质控反应模板进行PCR扩增,以校准混合病毒RNA的扩增效率;

(3)步骤(2)中HEX荧光信号对应的Ct值小于等于30,则样品中含有诺如病毒GI型;若FAM荧光信号对应的Ct值小于等于30,则样品中含有诺如病毒GII型;若ROX荧光信号对应的Ct值小于等于30,则样品中含有大肠杆菌噬菌体MS2。

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