[发明专利]一种细胞水平蛋白高通量检测方法

说明书

本发明提供了一种细胞水平蛋白高通量检测方法。具体地，本发明的方法包括以下步骤：(a)对外周血中的细胞进行富集得到富集的细胞；(b)将富集的细胞、偶联有寡核苷酸的待检蛋白抗体、细胞鉴定标志物进行孵育；(c)将孵育后的细胞加载到微孔芯片上；(d)对细胞进行分选，获得带有细胞鉴定标志物的目的细胞；(e)对抗体上偶联的寡核苷酸进行扩增，从而得到扩增产物；(f)对扩增产物进行测序；(g)对测序结果进行分析，从而获得单细胞水平蛋白高通量的测序结果。本发明的细胞单细胞水平蛋白检测方法灵敏度高、特异性好、通量高，可以准确地检测到痕量蛋白。

技术领域

本发明属于生物技术领域，具体涉及一种细胞水平蛋白高通量检测方法。

背景技术

在常规癌症诊断中，组织活检有一定局限性，并且会给患者带来一定的创伤和痛苦。液态活检领域的循环肿瘤细胞CTC检测技术为癌症诊断提供了新思路。CTC是从肿瘤原位灶脱落并进入并进入外周循环血中的肿瘤细胞，对循环血中CTC进行富集、鉴定、分离，可提前优于影像学发现肿瘤。对CTC表型研究和功能信息研究可为肿瘤细胞的鉴定、分类、追踪用药和实时疗效监测提供手段。

目前对CTC蛋白质组研究的较少，主要是缺乏稀有细胞蛋白质高通量检测手段。流式细胞术是目前常用的单细胞多种蛋白同步检测方法，但是由于存在光谱重叠现象，检测蛋白种类有限。质谱检测法可一次检测超过30种蛋白，但是无法对稀有的少量细胞进行检测。与荧光标记或质谱信息相比，用寡核苷酸做标记信号，可更灵敏、更高通量的检测蛋白。

寡核苷酸做信号标记抗体，其优点在于，与目的细胞孵育并收集目的细胞单细胞后，加入引物进行PCR，可对微量的信号放大，更有利于检测到痕量蛋白，并且可通过设计不同的序列或不同长度的寡核苷酸链以区分不同的抗体，8个碱基即可形成65536(4⁸)种信号，可以实现真正意义上的高通量检测。

然而，CTC在外周血中含量极少，处理操作过程中易造成丢失，增加CTC富集捕获的难度。

因此，本领域迫切需要开发一种高效快速捕获CTC单细胞，并且对大量单细胞蛋白质组进行同步高通量检测的方法。

发明内容

本发明公开了一种能最大限度防止CTC丢失的，微控芯片辅助的基于寡核苷酸条形码和下一代测序技术的循环肿瘤细胞单细胞水平蛋白高通量检测方法。

在本发明的第一方面，提供了一种细胞水平蛋白高通量检测方法，其特征在于，包括以下步骤：

(a)对外周血中的细胞进行富集，从而得到富集的细胞；

(b)将步骤(a)中富集的细胞、偶联有寡核苷酸的待检蛋白抗体、细胞鉴定标志物进行孵育；

(c)将步骤(b)中孵育后的细胞加载到微孔芯片上，从而使得所述微孔芯片上每个孔中有不多于一个细胞；

(d)对所述细胞进行分选，获得带有细胞鉴定标志物的目的细胞；

(e)对抗体上偶联的寡核苷酸进行扩增，从而得到扩增产物；

(f)对步骤(e)的扩增产物进行测序；

(g)对测序结果进行分析，从而获得单细胞水平蛋白高通量的测序结果。

在另一优选例中，所述细胞选自下组：血液中循环肿瘤细胞、其他液体样本如胸腔积液、脑脊液中的肿瘤细胞、血液与体液样本中的其他与疾病相关的细胞。

在另一优选例中，所述寡核苷酸为barcode序列。

在另一优选例中，所述barcode序列为不同的序列。

在另一优选例中，所述细胞鉴定标志物包括循环肿瘤细胞鉴定标志物，包括能够鉴定循环肿瘤细胞的荧光标记抗体或分子。