[发明专利]一种细胞水平蛋白高通量检测方法在审
| 申请号: | 201811294884.0 | 申请日: | 2018-11-01 |
| 公开(公告)号: | CN109444425A | 公开(公告)日: | 2019-03-08 |
| 发明(设计)人: | 施奇惠;邓宇亮;王春英 | 申请(专利权)人: | 上海交通大学 |
| 主分类号: | G01N33/68 | 分类号: | G01N33/68;C12Q1/6869 |
| 代理公司: | 上海一平知识产权代理有限公司 31266 | 代理人: | 徐迅;马莉华 |
| 地址: | 200240 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 细胞 测序 富集 单细胞水平 高通量检测 蛋白 寡核苷酸 扩增产物 细胞鉴定 细胞水平 标志物 孵育 偶联 蛋白检测 蛋白抗体 痕量蛋白 高通量 灵敏度 分选 加载 扩增 通量 微孔 芯片 对抗 检测 分析 | ||
1.一种细胞水平蛋白高通量检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
(a)对外周血中的细胞进行富集,从而得到富集的细胞;
(b)将步骤(a)中富集的细胞、偶联有寡核苷酸的待检蛋白抗体、细胞鉴定标志物进行孵育;
(c)将步骤(b)中孵育后的细胞加载到微孔芯片上,从而使得所述微孔芯片上每个孔中有不多于一个细胞;
(d)对所述细胞进行分选,获得带有细胞鉴定标志物的目的细胞;
(e)对抗体上偶联的寡核苷酸进行扩增,从而得到扩增产物;
(f)对步骤(e)的扩增产物进行测序;
(g)对测序结果进行分析,从而获得单细胞水平蛋白高通量的测序结果。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述细胞选自下组:血液中循环肿瘤细胞、其他液体样本如胸腔积液、脑脊液中的肿瘤细胞、血液与体液样本中的其他与疾病相关的细胞。
3.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述寡核苷酸为barcode序列。
4.如权利要求3所述的方法,其特征在于,所述barcode序列为不同的序列。
5.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述细胞鉴定标志物包括循环肿瘤细胞鉴定标志物,包括能够鉴定循环肿瘤细胞的荧光标记抗体或分子。
6.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述细胞鉴定标志物选自下组:荧光素APC标记的CD45抗体(anti-CD45-APC)、荧光素PE标记的EpCAM抗体(anti-EpCAM-PE)、荧光葡萄糖类似物2-NBDG。
7.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述寡核苷酸链中可变区为N个随意碱基,N为4-100,较佳地为5-60,更佳地,6-20。
8.如权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(f)中建库引物为人工合成单链核苷酸,包含P5接头(illumina)、P7接头(illumina)、测序引物、N个碱基单细胞标签,其中N个随意碱基,N为4-100,较佳地为5-60,更佳地,6-20。
9.如权利要求8所述的方法,其特征在于,所述单细胞标签与P5接头合成在同一条链上。
10.如权利要求8所述的方法,其特征在于,所述单细胞标签与P7接头合成在同一条链上。
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