[发明专利]一种用于检测乳腺肿瘤良恶性程度的分级模型及其应用在审
申请号: | 201811281044.0 | 申请日: | 2018-10-30 |
公开(公告)号: | CN109837342A | 公开(公告)日: | 2019-06-04 |
发明(设计)人: | 成彤 | 申请(专利权)人: | 立森印迹诊断技术(无锡)有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/11 |
代理公司: | 北京品源专利代理有限公司 11332 | 代理人: | 巩克栋 |
地址: | 214135 江苏省无*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 乳腺肿瘤 印记基因 分级 检测 印记 直观 缺失表达 细胞样本 异常表达 原位标记 表达量 拷贝数 应用 表现 量化 诊断 基因 | ||
1.一种用于乳腺肿瘤的印记基因分级模型,其特征在于,所述模型通过计算印记基因的总表达量、印记基因缺失表达量和印记基因拷贝数异常表达量在乳腺肿瘤中的变化对印记基因的表达状态进行分级;
其中,所述印记基因为Z1、Z3、Z8、Z11或Z16中的任意一个或至少两个的组合,所述印记基因Z1为Gnas,所述印记基因Z3为Peg10,所述印记基因Z8为Dcn,所述印记基因Z11为Grb10,所述印记基因Z16为Snrpn/Snurf。
2.根据权利要求1所述的印记基因分级模型,其特征在于,所述模型计算印记基因的方法如下:
计算Z1、Z3、Z8、Z11或Z16中的任意一个,优选为Z1、Z8或Z11中的任意一个,进一步优选为Z8或Z11;
优选地,所述模型计算印记基因的方法为:计算Z1、Z3、Z8、Z11或Z16中的任意两个,优选为Z1和Z8的组合,Z8和Z11的组合,Z1和Z16的组合或Z11和Z16的组合。
3.根据权利要求1或2所述的印记基因分级模型,其特征在于,所述印记基因还包括Z5、Z9、Z10或Z13中的任意一个或至少两个的组合;其中,所述印记基因Z5为Mest,所述印记基因Z9为Dlk1,所述印记基因Z10为Gatm,所述印记基因Z13为Sgce;
优选地,所述模型计算印记基因的方法为:计算印记基因的组合,计算Z1、Z3、Z5、Z8、Z9、Z10、Z11、Z13和Z16的九个印记基因的组合。
4.根据权利要求1-3中任一项所述的印记基因分级模型,其特征在于,所述计算印记基因的总表达量、印记基因缺失表达量和印记基因拷贝数异常表达量的公式如下:
总表达量=(b+c+d)/(a+b+c+d)×100%;
正常印记基因表达量=b/(b+c+d)×100%;
印记基因缺失基因表达量=c/(b+c+d)×100%;
印记基因拷贝数异常的基因表达量=d/(b+c+d)×100%;
其中,所述a为将细胞进行苏木素染色后,细胞核内不存在标记,印记基因没有表达的细胞核;所述b为将细胞进行苏木素染色后,细胞核内存在一个红色/棕色标记,印记基因存在的细胞核;所述c为将细胞进行苏木素染色后,细胞核内存在两个红色/棕色标记,印记基因缺失的细胞核;所述d为将细胞进行苏木素染色后,细胞核内存在两个以上红色/棕色标记,印记基因拷贝数异常的细胞核。
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