[发明专利]呼吸道病原体快速荧光PCR检测试剂盒及其引物探针组合在审

专利信息
申请号: 201811231737.9 申请日: 2018-10-22
公开(公告)号: CN109207639A 公开(公告)日: 2019-01-15
发明(设计)人: 陈峰;吴海磊;杨庆贵;杨国平 申请(专利权)人: 南通国际旅行卫生保健门诊部
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/6851;C12N15/11
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 226000 *** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 呼吸道病原体 扩增 对照试剂 检测试剂 检测引物 快速荧光 引物探针 试剂盒 芯片 实时荧光PCR 探针混合液 微流控芯片 发热症状 反转录酶 扩增检测 阳性对照 阴性对照 扩增仪 微流控 微流体 一次性 组合本 呼吸道 冻干 分装 孔道 筛查 探针 传染病 干预
【权利要求书】:

1.一种呼吸道病原体快速荧光PCR检测试剂盒,包括扩增芯片和对照试剂,所述的扩增芯片由预分装并冻干在微流控芯片孔内的检测试剂构成;所述的对照试剂包含阴性对照和阳性对照;

所述的检测试剂包括成分为RT-PCR反应液,成分为Buffer、2.0mM dNTPs、1U/μL TaqDNA聚合酶,2U/μL M-MLV反转录酶,0.3U/μLRRI和9种呼吸道病原体16个型别检测引物探针。

2.根据权利要求1所述的呼吸道病原体快速荧光PCR检测试剂盒,其特征在于,所述的Taq DNA聚合酶选自Ex Taq HS、Platinum II Taq HS DNA polymerase、AmpliTaq GoldDNA polymerase中的任意一种;所述的反转录酶选自PrimerScript II RTase、PrimerScript RTase、Superscript IV中的任意一种。

3.根据权利要求1所述的呼吸道病原体快速荧光PCR检测试剂盒,其特征在于,所述的Buffer包括10mM Tris-HCl,15mM KCl,3.5mM MgCl2

4.一种根据权利要求1-3中任意一项所述的呼吸道病原体快速荧光PCR检测试剂盒的引物探针组合,其特征在于,微流体芯片含有16个反应孔,每孔可检测一种病原体型别,由相应的病原体检测引物探针和内参基因引物探针构成;

所述的9种呼吸道病原体包括甲型流感病毒、乙型流感病毒、副流感病毒、冠状病毒、呼吸道合胞病毒、呼吸道腺病毒、人偏肺病毒、人博卡病毒和鼻病毒;

所述的9种呼吸道病原体16个型别检测引物和探针的具体序列和序号如下:

甲型流感病毒上游引物F:CGAGGTCGAAACGTAYGTTCT SEQ ID NO.1

甲型流感病毒下游引物R:GGTCTTGTCTTTAGCCATTCCA SEQ ID NO.2

甲型流感病毒探针P:5’-荧光报告基团-CCCCCTCAAAGCCGAGATCGC-荧光淬基团-3’SEQID NO.3

乙型流感病毒上游引物F:CTTGTTGCCACTGATGATCTTA SEQ ID NO.4

乙型流感病毒下游引物R:ACTCCCACCGCAGTTTCAG SEQ ID NO.5

乙型流感病毒探针P:5’-荧光报告基团-CCATCGGATCCTCAACTCACTCTTC-荧光淬基团-3’SEQ ID NO.6

副流感病毒1型上游引物F:ACTAGGTGTGACAGACACAGCAA SEQ ID NO.7

副流感病毒1型下游引物R:TCCCCTATCAGCRGTGTCC SEQ ID NO.8

副流感病毒1型探针P:5’-荧光报告基团-TGCCACTTCTATRGCTCCACCA-荧光淬基团-3’SEQ ID NO.9

副流感病毒2型上游引物F:ATGGGCCACAATCAATCCT SEQ ID NO.10

副流感病毒2型下游引物R:GCGACCACCATATACAGGAA SEQ ID NO.11

副流感病毒2型探针P:5’-荧光报告基团-CCTAGATGATAGATCCCGCTTCC-荧光淬基团-3’SEQ ID NO.12

副流感病毒3型上游引物F:GGACCACGCGCTCCATTCATCT SEQ ID NO.13

副流感病毒3型下游引物R:CCACTCCCATTGCATAACTCC SEQ ID NO.14

副流感病毒3型探针P:5’-荧光报告基团-ATAGTTGCCTGGTGCGAACTCACCA-荧光淬基团-3’SEQ ID NO.15

副流感病毒4型上游引物F:CCCACTGGATCTGAAGAGAG SEQ ID NO.16

副流感病毒4型下游引物R:AATTTTCCTKGCATCTGTTTG SEQ ID NO.17

副流感病毒4型探针P:5’-荧光报告基团-TCYAACATCCTRCCCTGCTGCTTGT-荧光淬基团-3’SEQ ID NO.18

冠状病毒NL63上游引物F:ATTCCCAGGAATCTTGTCCCTA SEQ ID NO.19

冠状病毒NL63下游引物R:CTTTAGGAGGCAAATCAACACG SEQ ID NO.20

冠状病毒NL63探针P:5’-荧光报告基团-CGCCAACGCTCTTGAACATTCC-荧光淬基团-3’SEQID NO.21

冠状病毒OC43上游引物F:ACCGTATGCTAAAGACCAG SEQ ID NO.22

冠状病毒OC43下游引物R:CCTCATCGCTACTTGGGTCC SEQ ID NO.23

冠状病毒OC43探针P:5’-荧光报告基团-CTGATGTCAATACCCCGGCTG-荧光淬基团-3’SEQID NO.24

冠状病毒229E上游引物F:TGAAGGTGTTGTCTGGGTTGCT SEQ ID NO.25

冠状病毒229E下游引物R:GATTGAAGTGTGGTATCTCTG SEQ ID NO.26

冠状病毒229E探针P:5’-荧光报告基团-CTTGCGCCTAACACCGTAACC-荧光淬基团-3’SEQID NO.27

冠状病毒HKU1上游引物F:ACAGCTGATGGTCAACAAAAG SEQ ID NO.28

冠状病毒HKU1下游引物R:CGTGGGCATCACCATAGGA SEQ ID NO.29

冠状病毒HKU1探针P:5’-荧光报告基团-CTATCTCGGTACCGGYCCATATGCC-荧光淬基团-3’SEQ ID NO.30

中东呼吸综合症MERS-CoV上游引物F:ACTAATCGCCAGTACCATCAG SEQ ID NO.31

中东呼吸综合症MERS-CoV下游引物R:GTAGTACCAATGACGCAAGT SEQ ID NO.32

中东呼吸综合症MERS-CoV探针P:5’-荧光报告基团-AGTCCATGGCTGCAACTCGTG-荧光淬基团-3’SEQ ID NO.33

呼吸道合胞病毒上游引物F:ATGGGGCAAATATGGAAACA SEQ ID NO.34

呼吸道合胞病毒下游引物R:GCACCCATATTGTTAGTGATGC SEQ ID NO.35

呼吸道合胞病毒基因探针P:5’-荧光报告基团-CTTCACGAGGGCTCCACATACACA-荧光淬基团-3’SEQ ID NO.36

呼吸道腺病毒上游引物F:CACCCCCTCGATGATGC SEQ ID NO.37

呼吸道腺病毒下游引物R:CTCAGGTACTCCGAAGCATCCT SEQ ID NO.38

呼吸道腺病毒探针P:5’-荧光报告基团-TACATGCACATCGCCGG-荧光淬基团-3’SEQ IDNO.39

人偏肺病毒上游引物F:AARCATGCTATATTAAAAGAGTCTC SEQ ID NO.40

人偏肺病毒下游引物R:CCTATYTCTGCAGCATATTTGTAATC SEQ ID NO.41

人偏肺病毒探针P:5’-荧光报告基团-CAACHGCAGTGACACCYTCATCATTGCA-荧光淬基团-3’SEQ ID NO.42

人博卡病毒上游引物F:GAAGAGACACTGGCAGACAAC SEQ ID NO.43

人博卡病毒下游引物R:CCACTGTGTCGGATCGG SEQ ID NO.44

人博卡病毒探针P:5’-荧光报告基团-CTGCGGCTCCTGCTCCTGTG-荧光淬基团-3’SEQ IDNO.45

鼻病毒上游引物F:GACATGGTGYGAAGAGYCTATTG SEQ ID NO.46

鼻病毒下游引物R:AAACACGGACACCCAAAGTAGT SEQ ID NO.47

鼻病毒探针P:5’-荧光报告基团-CCGGCCCCTGAATGCGGCTAAT-荧光淬基团-3’SEQ IDNO.48

人内参基因β-actin基因上游引物F:CGAGCGCGGCTACAGCT SEQ ID NO.49

人内参基因β-actin基因下游引物R:TCCTTAATGTCACGCACGATTT SEQ ID NO.50人内参基因β-actin基因探针P:5’-荧光报告基团-ACCACCACGGCCGAGCGG-荧光淬基团-3’SEQ IDNO.51。

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