[发明专利]一种基于生物条形码的microRNA-7a电化学检测方法及应用在审
| 申请号: | 201811225478.9 | 申请日: | 2018-10-20 |
| 公开(公告)号: | CN109295169A | 公开(公告)日: | 2019-02-01 |
| 发明(设计)人: | 朱文远;梁晓琳;周琳莹;李丹;温其霖;潘宏程 | 申请(专利权)人: | 桂林理工大学 |
| 主分类号: | C12Q1/682 | 分类号: | C12Q1/682;C12Q1/6886 |
| 代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
| 地址: | 541004 广西壮*** | 国省代码: | 广西;45 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 捕获探针 信号探针 条形码 目标物 修饰 电化学检测 生物条形码 亚甲基蓝 金电极 三明治 应用 杂交 癌症标记物 二硫苏糖醇 链霉亲和素 生物传感器 磁珠标记 定量检测 纳米标记 信号电流 巯基修饰 释放 灵敏度 检测 | ||
1.一种基于生物条形码的microRNA-7a电化学检测方法,其特征在于具体步骤为:
(1)纳米金合成制备:移取100 mL质量百分比浓度为0.01%的氯金酸溶液倒入圆底烧瓶中,将其放置油浴锅中加热煮沸后迅速加入3 mL 质量百分比浓度为1%的柠檬酸钠溶液作为还原剂,继续加热15分钟,观察溶液的颜色从最初的淡黄色逐渐变成酒红色,最后停止加热冷却至室温,并且全程处于搅拌状态下进行,得浓度为5.8 nmol/mL金纳米溶液;纳米金的粒径为16nm;
(2)金标记识别信号探针以及条形码即Au-RP1-barcode的制备:取2.5μL浓度为10 μmol/L的信号探针RP1与50μL~275μL浓度为10 μmol/L的条形码混合后加入202.5 μL含10mmol/L 三(2-羧乙基)膦浓度为10 mmol/L pH 5.8~7.4的磷酸盐缓冲溶液中活化2小时,活化完毕后加入0.5 mL步骤(1)所得的浓度为5.8 nmol/mL金纳米溶液,立即震荡均匀并迅速裹上锡纸避光孵育16小时;接着加入9.1 μL质量百分比浓度为10% 的十二烷基硫酸钠溶液,使最终质量百分比浓度为0.1 %;再加入101.6μL浓度为0.1mol/L pH 7.4 磷酸盐缓冲溶液,使其最终浓度为10 mmol/L;再加入53.5μL浓度为2 mol/L 的NaCl溶液,使其最终浓度为0.1mol/L;在孵育24小时后使用高速离心机离心,10000 转/分钟,20分钟,分散至含0.1 mol/L NaCl浓度为10 mmol/L pH 7.4磷酸盐缓冲溶液中并重复清洗3次,去掉上清液,最后分散0.5 mL至含0.1 mol/L NaCl浓度为10 mmol/L pH 7.4 磷酸盐缓冲溶液中,震荡均匀,放置在4℃的黑暗环境中得Au-RP1-barcode溶液;
所述的信号探针RP1为巯基修饰的DNA序列,其碱基序列为:5´-SH-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTAACTATACAAC-3´;
(3)磁珠标记捕获探针即MB-CP1的制备:量取1 mg磁珠置于离心管中,经过磁性分离,弃去上清液,然后用100 μL TTL缓冲溶液清洗1次,接着分散至200 μL TTL缓冲溶液中,然后往溶液中加入50 μL浓度为10 μmol/L捕获探针CP1,在室温下轻微震荡孵育15分钟,以使生物素修饰的捕获探针CP1与链霉亲和素包被的磁珠MB轻缓而充分地结合,最后使用100μLTT 缓冲溶液清洗2次,磁性分离,弃去上清液,分散至500 μL含0.2mol/L NaCl浓度为10mmol/L pH 7.4 PBS溶液中得浓度为10mg/mL的MB-CP1溶液;
所述的捕获探针CP1为修饰生物素的DNA序列,其碱基序列为: 5´-CTACTACCTCATTTTTTTTTTTTTTTTTTTT-biotin-3´;
所述TTL缓冲溶液包含100 mmol/L Tris-HCl、pH 8.0,体积百分比浓度为的0.1%Tween® 20以及1mol/L LiCl ;
所述TT 缓冲溶液包含250 mmol/L Tris-HCl、pH 8.0,体积百分比浓度为0.1% Tween® 20;
(4)探针杂交以及条形码释放:移取10 μL步骤(2)所得浓度为5.8 nmol/mL Au-RP1-barcode溶液、10 μL步骤(3)所得浓度为10mg/mL的MB-CP1溶液和10 μL浓度范围为1fmol/L~1pmol/L的目标物,震荡混匀后置于PCR仪中在30 ℃下孵育45分钟,磁性分离,用含0.1mol/L NaCl、0.1% 十二烷基硫酸钠10 mmol/L pH 7.4 磷酸盐缓冲溶液,振荡清洗三次后,将收集的磁珠分散至10 uL浓度为 0.5 mol/L的二硫苏糖醇溶液中,在50℃下反应15分钟,再在25℃下保持45分钟,最后经过磁性分离,取上清液,得条形码,4℃冷藏备用;
(5)生物传感器的组装以及目标物检测:取4 μL浓度为10 umol/L 捕获探针CP2与72uL浓度为10 mmol/L pH 5.8~7.4磷酸盐缓冲溶液混合,然后加入4 uL含10 mmol/L三(2-羧乙基)膦浓度为10 mmol/L pH 5.8~7.4 磷酸盐缓冲溶液,振荡均匀,室温下活化2小时;在已经处理好的金电极表面滴加10 uL活化后的捕获探针CP2,在室温下孵育反应16小时;用浓度为10 mmol/L pH 5.8 PBS溶液对金电极浸洗3次,除去未连接捕获探针CP2,然后用氮气吹干金电极表面,滴加10 uL含1 mmol/L巯基己醇浓度为10 mmol/L pH 7.4 磷酸盐缓冲溶液,封闭时间为1小时;用浓度为200 mmol/L pH 7.4 磷酸盐缓冲溶液对金电极浸洗3次,除去未连接的巯基乙醇,氮气吹干金电极表面;在金电极表面滴加10 uL浓度为2.5 umol/L的信号探针 RP2,杂交时间为6小时;用含0.1 mol/L NaCl浓度为10 mmol/L pH 7.4 磷酸盐缓冲溶液对金电极进行浸洗3次,用氮气吹干金电极表面;往金电极表面滴加10 uL步骤(4)所得条形码,杂交5 小时;用含0.1 mol/L NaCl浓度为10 mmol/L pH 7.4 磷酸盐缓冲溶液对金电极进行浸洗3次,以除去游离的条形码,用氮气吹干金电极表面;利用三电极体系,以含0.1 mol/L NaCl 10 mmol/L pH 7.4磷酸盐缓冲溶液为电解质,用差分脉冲伏安法对金电极表面的电活性物质亚甲基蓝进行扫描,由此间接得到不同浓度目标物的电化学信号;
所述捕获探针CP2 为巯基修饰的DNA序列,其碱基序列为: 5´-SH-GCGAGTTAGACCGATCCCCCCCCTTCGTCCAGTCTTTT -3´ ;
所述信号探针RP2为亚甲基蓝MB修饰的DNA序列,其碱基序列为:5´-MB-GACTGGACGCCCCCCCATCGGTCTAACTCGC -3´。
2.根据权利要求1所述基于生物条形码的microRNA-7a电化学检测方法的应用,其特征在于所述基于生物条形码的microRNA-7a电化学检测方法能应用于癌症标记物的检测。
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