[发明专利]一种PLAGL1基因SNP标记辅助快速检测黄牛生长性状的方法及其应用有效
申请号: | 201811184564.X | 申请日: | 2018-10-11 |
公开(公告)号: | CN109161601B | 公开(公告)日: | 2021-08-17 |
发明(设计)人: | 黄永震;张禹;贺花;郑立;陈宏;雷初朝;党瑞华;蓝贤勇;胡沈荣 | 申请(专利权)人: | 西北农林科技大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
代理公司: | 西安通大专利代理有限责任公司 61200 | 代理人: | 范巍 |
地址: | 712100 陕*** | 国省代码: | 陕西;61 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 plagl1 基因 snp 标记 辅助 快速 检测 黄牛 生长 性状 方法 及其 应用 | ||
1.一种黄牛PLAGL1基因SNP的检测方法,其特征在于:包括以下步骤:
以黄牛基因组DNA为模板,PCR扩增黄牛PLAGL1基因部分片段,将PCR扩增得到的片段经限制性内切酶NdeI消化后进行琼脂糖凝胶电泳,根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定黄牛PLAGL1基因参考序列NC_037336.1中第95141位SNP位点的基因型;
所述SNP位点的基因型的电泳结果为:TT基因型表现为821bp一条条带;TC基因型表现为821bp、742bp和79bp三条条带;CC基因型表现为742bp和79bp两条条带;等位基因C与秦川牛和郏县红牛的生长性状密切相关,相应的基因型可作为黄牛坐骨端宽和尻长早期选择的分子遗传标记。
2.根据权利要求1所述一种黄牛PLAGL1基因SNP的检测方法,其特征在于:所述PCR扩增采用的引物对为:
上游引物F:5'-CAGAGGCAAGTCCTCAAGCA-3'
下游引物R:5'-CTCACCGGTGTGCTTACTGT-3'。
3.根据权利要求1所述一种黄牛PLAGL1基因SNP的检测方法,其特征在于:所述PCR扩增的反应程序为:94℃预变性5min;94℃变性30s,58℃退火30s,72℃延伸50s,共32个循环;72℃延伸5min。
4.根据权利要求1所述一种黄牛PLAGL1基因SNP的检测方法,其特征在于:所述琼脂糖凝胶电泳使用的是质量浓度3%的琼脂糖凝胶。
5.如权利要求1所述的黄牛PLAGL1基因SNP的检测方法在黄牛分子标记辅助选择育种中的应用。
6.如权利要求1所述的黄牛PLAGL1基因SNP的检测方法在辅助检测黄牛生长性状中的应用。
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