[发明专利]一种单细胞甲基化测序技术及其应用有效

专利信息
申请号: 201811123559.8 申请日: 2018-09-26
公开(公告)号: CN109295500B 公开(公告)日: 2022-02-01
发明(设计)人: 王辉;郭弘妍;邓莉莉;邢婉丽;程京 申请(专利权)人: 博奥生物集团有限公司
主分类号: C40B50/06 分类号: C40B50/06;C12Q1/6858
代理公司: 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 代理人: 关畅;秦梦楠
地址: 102206 北*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 一种 单细胞 甲基化 技术 及其 应用
【权利要求书】:

1.一种单细胞甲基化测序文库的构建方法,包括如下步骤:

(1)将单细胞裂解并进行重亚硫酸盐转化;

(2)以步骤(1)处理得到的DNA样本为模板,利用BstDNA聚合酶和引物甲进行第一链的合成;所述引物甲包括测序接头甲和随机引物甲;所述随机引物甲包括5-9个N和1-2个H;所述碱基H位于引物甲的3’末端;所述第一链合成的反应程序为:65℃3min;65℃2min、8℃4min、16℃1min、22℃1min、28℃1min、36℃1min、36.5℃1min、37℃8min,5-10个循环;4℃hold;

(3)以步骤(2)的产物为模板,利用引物乙进行第二链的合成;所述引物乙包括测序接头乙和随机引物乙;所述随机引物乙包括5-9个N和0-2个H;所述碱基H位于引物乙的3’末端;

(4)对步骤(3)的产物进行PCR扩增,得到测序文库;PCR扩增时向样本引入index标签;

所述引物甲为序列表的序列1所示的单链DNA分子;所述引物乙为序列表的序列2所示的单链DNA分子;

所述测序平台为illumina测序平台;

所述测序接头甲为P5测序接头;

所述测序接头乙为P7测序接头。

2.如权利要求1所述的方法,其特征在于:

所述BstDNA聚合酶为Bst DNA聚合酶大片段、Bst2.0 DNA聚合酶或Bst3.0 DNA聚合酶。

3.权利要求1或2所述的方法制备得到的单细胞甲基化测序文库。

4.一种用于构建单细胞甲基化测序文库的试剂盒,包括权利要求1或2中所述的BstDNA聚合酶、引物甲和引物乙。

5.单细胞甲基化测序方法,包括如下步骤:利用权利要求1或2所述方法构建单细胞甲基化测序文库,然后对所述单细胞甲基化测序文库进行测序;所述方法为非疾病诊断和治疗目的的方法。

6.权利要求1或2所述方法在单细胞DNA甲基化研究中的应用;所述应用为非疾病诊断和治疗目的的应用。

7.权利要求3所述的单细胞甲基化测序文库或权利要求4所述的试剂盒在单细胞DNA甲基化研究中的应用;所述应用为非疾病诊断和治疗目的的应用。

8.权利要求5所述的单细胞甲基化测序方法在单细胞DNA甲基化研究中的应用;所述应用为非疾病诊断和治疗目的的应用。

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