[发明专利]一种斑节对虾抗菌肽ALFpm10及其制备方法有效
申请号: | 201811108521.3 | 申请日: | 2018-09-21 |
公开(公告)号: | CN109021088B | 公开(公告)日: | 2021-09-10 |
发明(设计)人: | 王潮岗;周亮;李国强;胡章立 | 申请(专利权)人: | 深圳大学 |
主分类号: | C07K14/435 | 分类号: | C07K14/435;C07K1/22;C12N15/12;C12N15/70;A61P31/04 |
代理公司: | 北京金智普华知识产权代理有限公司 11401 | 代理人: | 杨采良 |
地址: | 518060 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 对虾 抗菌 alfpm10 及其 制备 方法 | ||
1.一种斑节对虾抗菌肽ALFpm10,其特征在于,所述斑节对虾抗菌肽ALFpm10氨基酸序列为:SEQ ID NO:1;
所述斑节对虾ALFpm10基因的cDNA序列SEQ ID NO:4;信号肽序列为SEQ ID NO:2;
斑节对虾抗菌肽ALFpm10的有效抑菌肽段氨基酸序列为:SEQ ID NO:3。
2.一种如权利要求1所述斑节对虾抗菌肽ALFpm10的制备方法,其特征在于,所述斑节对虾抗菌肽ALFpm10的制备方法包括:
通过原核表达系统获得,将ALFpm10的基因序列连接到pET-28a、pCold IV质粒上,转化到大肠杆菌中,通过IPTG诱导获得SUMO- ALFpm10融合蛋白,经过镍离子的亲和层析纯化获得融合蛋白,再利用SUMO蛋白酶进行酶切获得ALFpm10抗菌肽。
3.如权利要求2所述的斑节对虾抗菌肽ALFpm10的制备方法,其特征在于,ALFpm10的基因获得方法包括:
斑节对虾先用副溶血弧菌进行处理,收集处理3h的斑节对虾血细胞,采用试剂盒提取血细胞的总RNA,通过反转录获得cDNA;
根据ALFpm10的cDNA序列设计引物,以斑节对虾血细胞的cDNA为模板,通过PCR克隆获得抗菌肽序列,上游引物为5' GAGGCTATAAGATTTACGAGTGAAG 3',下游引物为5'AAGAGTAAATCTCGCACATAAATCC 3',获得517bp的特异性cDNA片段,经测序得到517bp的斑节对虾ALFpm10抗菌肽基因。
4.如权利要求2所述的斑节对虾抗菌肽ALFpm10的制备方法,其特征在于,斑节对虾抗菌肽ALFpm10的制备方法,具体包括:
1)斑节对虾血细胞的收集和总RNA的提取:
血细胞的收集:先用1毫升注射器吸入100微升抗凝剂插入斑节对虾的心包窦吸取600微升血淋巴液,1500rpm离心10分钟,用1mL抗血清洗涤细胞,即可用于后续的总RNA提取;
总RNA的提取:采取RNeasy Mini Kit提取斑节对虾的总RNA,吸取不超过1×107个细胞,5000rpm离心5min,去上清;加入Buffer RLT,充分振荡混匀;所有液体转移到收集管,15000rpm离心2min;加入一倍体积70%乙醇,充分混匀;吸取700μL混合物到Rneasy收集柱,15000rpm离心15秒,去除液体;加入700μL的Buffer RPE,15000rpm离心2min;将吸附柱子放入新的2mL收集管,15000rpm离心1min;将吸附柱子转移到新的1.5mL收集管,加入30-50μL的Rnase-free water,盖上盖子,15000rpm离心2min,收集管获得斑节对虾的总RNA,存储于-80℃冰箱;
2)抗菌肽cDNA序列的克隆:
根据斑节对虾ALFpm10抗菌肽序列设计引物,从斑节对虾血细胞中克隆获得抗菌肽序列,上游引物为5' GAGGCTATAAGATTTACGAGTGAAG 3',下游引物为5'AAGAGTAAATCTCGCACATAAATCC 3',采用RNeasy Mini Kit提取斑节对虾的血细胞总RNA,采用PrimeScript RT reagent Kit with gDNA Eraser试剂盒进行反转录获得cDNA,反转录程序为:42℃进行60min;70℃进行15 min,获得斑节对虾的cDNA;以该cDNA为模板,采用上下游引物进行扩增,PCR程序为:94℃,3min;94℃,30sec,55℃,30sec,72℃,1min,共35个循环;72℃,10min;4℃终止反应,然后进行1%琼脂糖凝胶电泳,获得约517bp的特异性cDNA片段,用干净刀片切取517bp的目的片段,采用胶回收试剂盒回收目的片段,克隆到T-vector上,进行基因测序,得到517bp的斑节对虾ALFpm10抗菌肽基因。
5.如权利要求4所述的斑节对虾抗菌肽ALFpm10的制备方法,其特征在于, 步骤1),斑节对虾血细胞的收集和总RNA的提取中,
先用1毫升注射器吸入100微升抗凝剂插入斑节对虾的心包窦吸取600微升血淋巴液,1500rpm离心10分钟。
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