[发明专利]检测大肠杆菌含量的试剂盒、特异性引物和探针及应用在审
| 申请号: | 201811108227.2 | 申请日: | 2018-09-21 |
| 公开(公告)号: | CN109055587A | 公开(公告)日: | 2018-12-21 |
| 发明(设计)人: | 安志远;周怀谷;李发院;柳勇;赵鹏;郭育林;夏子芳;郑卫国 | 申请(专利权)人: | 上海公安学院;上海市刑事科学技术研究院;无锡中德美联生物技术有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6851;C12Q1/10;C12Q1/06;C12N15/11 |
| 代理公司: | 苏州国诚专利代理有限公司 32293 | 代理人: | 李思睿 |
| 地址: | 200137 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 特异性引物 大肠杆菌 探针 特异性片段 大肠杆菌LacZ基因 检测 实时荧光定量聚合酶链反应 荧光定量PCR检测 基因克隆技术 保守片段 含量检测 探针序列 序列设计 重组质粒 靶目标 标准品 试剂盒 大鼠 灵敏 应用 合成 评估 优化 | ||
1.用于检测大肠杆菌的特异性引物和探针,其特征在于:所述特异性引物和探针以保守片段序列内序列为靶目标,所述保守片段序列为SEQ No.1。
2.根据权利要求1所述的用于检测大肠杆菌的特异性引物和探针,其特征在于:
所述探针序列如SEQ No.2:5’-ACCGCTGGGATCTGCCATTGT-3’;
所述特异性引物为下述序列或为下述序列的互补链序列:
上游引物序列如SEQ No.3:5’-ACTATCCCGACCGCCTTACTG-3’,
下游引物序列如SEQ No.4:5’-GCGCAGACCGTTTTCGCTCGG-3’。
3.根据权利要求1所述的用于检测大肠杆菌的特异性引物和探针,其特征在于:所述上游引物和所述下游引物序列为以所述SEQ No.3和SEQ No.4为基础向5’端和/或3’端方向延伸一至数个碱基或删减一至数个碱基得到的序列。
4.根据权利要求2所述的用于检测大肠杆菌的特异性引物和探针,其特征在于:所述探针5’端标记的荧光报告基团为FAM,所述探针3’端标记的荧光淬灭基团为BHQ。
5.用于检测大肠杆菌的实时荧光定量PCR试剂盒,其特征在于:所述试剂盒含有权利要求1至4中所述任意一种用于检测大肠杆菌的特异性引物和探针。
6.根据权利要求5所述的用于检测大肠杆菌的实时荧光定量PCR试剂盒,其特征在于:在20μl PCR反应体系中,所述上游引物PCR终浓度为0.5μM,所述下游引物PCR终浓度为0.5μM,所述探针PCR终浓度为0.2μM。
7.根据权利要求5或6所述的用于检测大肠杆菌的实时荧光定量PCR试剂盒,其特征在于:所述实时荧光定量PCR试剂盒还包括系列浓度标准品和阳性对照;所述系列浓度标准品是将大肠杆菌LacZ基因与载体连接,转化至感受态细胞中诱导表达,提取重组质粒,将重组质粒定量后稀释,得到系列浓度标准品。
8.根据权利要求7所述的用于检测大肠杆菌的实时荧光定量PCR试剂盒,其特征在于:所述标准品的核苷酸序列如SEQ No.1。
9.检测大肠杆菌的实时荧光定量PCR试剂盒的应用,其特征在于:权利要求5至8中任意一种检测大肠杆菌的实时荧光定量PCR试剂盒的应用如下任意一种用途:
(1)定性或定量检测或辅助检测大肠杆菌;
(2)测定大鼠死后心血中大肠杆菌含量,进而推断死亡时间;
(3)尸检中推断死亡时间;
所述应用不以疾病的诊断和治疗为目的。
10.推断死亡时间的方法,其特征在于:测定动物死后心血中大肠杆菌含量进而推断死亡时间;所述测定动物死后大肠杆菌含量使用权利要求5至8中任意一种用于检测大肠杆菌的实时荧光定量PCR试剂盒。
11.根据权利要求10所述的一种推断死亡时间的方法,其特征在于:分别以系列浓度标准品和待测样品DNA为模板,利用特异性引物和探针进行实时荧光定量PCR,绘制标准曲线,通过标准曲线和待测样品的Ct值判定结果。
12.根据权利要求11所述的一种推断死亡时间的方法,其特征在于:所述实时荧光定量PCR的反应条件为:50℃2min,95℃10min,95℃15s、60℃1min并收集荧光信号,40个循环。
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