[发明专利]DNA甲基化检测方法及相关应用有效
申请号: | 201811074552.1 | 申请日: | 2018-09-14 |
公开(公告)号: | CN109929919B | 公开(公告)日: | 2020-02-14 |
发明(设计)人: | 于浩洋;梁宁;吕禾 | 申请(专利权)人: | 深圳市晋百慧生物有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6858 | 分类号: | C12Q1/6858;C12Q1/6886 |
代理公司: | 44470 广东君龙律师事务所 | 代理人: | 吴娟 |
地址: | 518000 广东省深圳市*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 试剂盒 核酸 应用 基因甲基化 癌症诊断 预后 可用 基因 检测 | ||
1.一种DNA甲基化检测试剂盒,所述试剂盒用于胃癌的诊断,其特征在于所述试剂盒中包含:
(1)对待测DNA进行转化处理的试剂,所述试剂包括亚硫酸氢盐和/或重亚硫酸盐;
(2)用于待测DNA扩增和检测的试剂,其中所述待测DNA为Reprimo基因,所述试剂包括用于扩增和检测Reprimo基因的上游引物、下游引物和检测探针,所述上游引物、下游引物和检测探针的序列分别为SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:24和SEQ ID NO:25;
(3)用于检测内参基因ALU-C4的试剂,其包括用于扩增ALU-C4的正向引物和反向引物以及ALU-C4检测探针,所述正向 引物、反向 引物和检测探针的序列分别为SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:28和SEQ ID NO:29,和
(4)阻断剂,其中所述阻断剂序列为SEQ ID NO:26,且所述阻断剂的3’端基团使得所述阻断剂在DNA扩增时无法被延伸。
2.根据权利要求1所述的试剂盒,其中所述阻断剂的3’端基团选自磷酸基团、间隔子C3(Spacer C3)、间隔子C9(Spacer C9)、间隔子18(Spacer 18)中的一种。
3.根据权利要求1或2所述的试剂盒,其中所述检测探针用标记物标记。
4.根据权利要求3所述的试剂盒,其中所述标记物为荧光标记物。
5.根据权利要求4所述的试剂盒,其中所述试剂盒包括PCR反应试剂、阳性对照品和/或阴性对照品。
6.根据权利要求5所述的试剂盒,其中所述PCR反应试剂包括DNA聚合酶,所述阳性对照品为Reprimo合成DNA,所述阴性对照品为纯化水。
7.(1)对待测DNA进行转化处理的试剂、(2)用于待测DNA扩增和检测的试剂、(3)用于检测内参基因ALU-C4的试剂和(4)阻断剂在制备DNA甲基化检测试剂盒中的用途,所述试剂盒用于胃癌的诊断,所述待测DNA为Reprimo基因,其特征在于:
所述(1)对待测DNA进行转化处理的试剂包括亚硫酸氢盐和/或重亚硫酸盐;
所述(2)用于待测DNA扩增和检测的试剂包括用于扩增和检测Reprimo基因的上游引物、下游引物和检测探针,所述上游引物、下游引物和检测探针的序列分别为SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:24和SEQ ID NO:25;
所述(3)用于检测内参基因ALU-C4的试剂包括用于扩增ALU-C4的正向引物和反向引物以及ALU-C4检测探针,所述正向引物、反向引物和检测探针的序列分别为SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:28和SEQ ID NO:29;
所述(4)阻断剂序列为SEQ ID NO:26,且所述阻断剂的3’端基团使得所述阻断剂在DNA扩增时无法被延伸。
8.根据权利要求7所述的用途,其中所述阻断剂的3’端基团选自磷酸基团、间隔子C3(Spacer C3)、间隔子C9(Spacer C9)、间隔子18(Spacer 18)中的一种。
9.根据权利要求7或8所述的用途,其中所述检测探针用标记物标记。
10.根据权利要求9所述的用途,其中所述标记物为荧光标记物。
11.根据权利要求10所述的用途,其中所述试剂盒中包括PCR反应试剂、阳性对照品和/或阴性对照品。
12.根据权利要求11所述的用途,其中所述PCR反应试剂包括DNA聚合酶,所述阳性对照品为Reprimo合成DNA,所述阴性对照品为纯化水。
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